爲了阻止南華國家聯盟聯合軍的登陸作戰行動，印尼軍開始組織大規模的陸上反擊作戰行動的同時，於4月6日開始了殘酷恐怖的海上自殺攻擊行動。
4月6日至7日，印尼軍出動裝滿炸藥的各種小船，進行了第一次海上自殺攻擊行動
。
聯合軍兩艘擔任警戒哨位任務的武裝貨輪－布希號和科爾號，遭到印尼軍多艘小艇的連續攻擊，致使兩艦沉沒，死亡38人，121人受傷。
另外兩艘小型護衛艦－特茲號和康姆號也遭到重創，死亡17人，傷34人。
在這次攻擊行動中，聯合軍共損失3艘武裝貨輪、1艘登陸貨輪、2艘軍火船，還有10艘艦船遭受重傷，印尼軍355艘小艇小船也沒有返回，全部被擊沉。
4月12日，天氣良好，印尼軍出動185艘自殺艦船進行了第二次瘋狂自殺攻擊。
約有50艘攻擊聯合軍在一號地區警戒哨位值勤的－普蒂號、卡辛號武裝貨輪和4艘支援登陸艇，致其死傷數十人，兩艦和三艘小型登陸艇受傷返回錨地。
在另一警戒陣位巡邏的－埃伯號護衛艦，遭到10艘動力自殺小艇的直接撞擊爆炸被炸成兩截，5分鐘後沉沒。
此後－林濟號、薩斯號武裝貨輪、聖路號改裝登陸艇、納西號大型駁船等也都遭到攻擊而不同程度的受傷。
此次作戰，聯合軍採取了積極的抗擊行動，第1護航航母特混編隊在空中戰鬥巡邏機的配合下，擊沉自殺式小艇約47艘。
第三次自殺攻擊行動是從4月16日開始的，印尼軍派出自殺艦船362艘。
拉菲號驅逐艦首先發現目標，數十架動力小艇從四面八方接近軍艦，在80分鐘內遭印尼軍22次攻擊，有6艘小艇撞中艦體。
驅逐艦被命中四處，舵機被炸壞，艦尾下沉，用兩艘拖船將其拖回錨地，該艦上死亡或失蹤31人，傷72人。
隨後，格爾號武裝貨輪也遭自殺小艇攻擊，1艘剛好撞在艦中央位置，劇烈的爆炸炸彎了艦體的龍骨，貨輪斷成兩半後即沉沒，62人失蹤，43人重傷。
位於蘇拉威西島以北擔負警戒的－博斯號快速運輸艦，遭20艘動力小艇攻擊燃起大火，有48人死亡或失蹤，56人重傷
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到6月22日止，印尼軍共進行了10次自殺海上攻擊行動，累計出動小艇，小船3700多次，其中有動力小艇2700多次。
擊沉聯合軍各種船隻36艘，擊傷68艘，死、傷及失蹤聯合軍約1000餘人，聯合軍在此次戰爭中遭受了一次最慘重的損失。
伴隨着聯合軍第4混成裝甲旅加入北部戰鬥，在良好地勢的配合下，輕型坦克和裝甲車滿載聯合軍戰士直奔目標－萬鴉老。
印尼軍在南部第一道防線被突破後，即以2個步兵師和3個混成旅防守第二道防線。
5月1日，聯合軍開始重新發起進攻。
5月3日，先頭部隊前出至倫邦，麥瓦一線以北地區，目標是巴里巴里。
5月4日晨，印尼軍組織大規模反擊，企圖將聯合軍第2混成裝甲旅主力殲滅在巴里巴里以北地域。
在正面反擊的印尼軍2個師遭到聯合軍地面炮火和攻擊機的轟擊，以及聯合軍裝甲車輛部隊的攻擊，兵力損失達一半以上。
至5月5日晚，印尼軍被迫停止反擊。
5月8日，聯合軍第2混成裝甲旅再次發起進攻，但無進展。
至此，聯合軍第2混成裝甲旅傷亡已達3000人以上，指揮部遂將第1，5混成裝甲旅投入戰鬥。
5月11日，聯合軍以2個混成裝甲旅再次全線進攻。
印尼軍憑藉第二道防線上的堅固支撐點頑強抗擊，每一個山背、巖洞、碉堡都進行了反覆激烈的爭奪。
至5月20日，聯合軍第5混成裝甲旅突破巴里巴里城市兩側的高地。
21日，聯合軍第1混成裝甲旅在坦佩湖方向的森康迂迴巴里巴里陣地，24日突破印尼軍防線，印尼軍已處於兩面被圍的境地，於25日開始退回島嶼南部最後一道防線。
5月30日撤退完畢，聯合軍於5月31日佔領巴里巴里，6月10日佔領龐卡傑裡
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印尼軍撤出以巴里巴里爲核心的第二道防線後，兵力僅存2萬餘人，另在本藤島有海軍岸基部隊約3000人。
殘餘印尼軍在卡姜，克拉臘河，邦卡拉一線附近以南的山地調整部署，修築工事，準備最後掙扎。
****，聯合軍的兩個混成營在本藤島登陸，另一個混成營在正面攻擊，在攻擊機的配合下，經過10天戰鬥，全殲印尼海軍岸基部隊。
6月5日，聯合軍第1，2，5混成裝甲旅相繼向印尼軍第三道防線實施全面進攻。
6月19日，聯合軍突破印尼軍整個防線，經過激烈戰鬥，將印尼軍逐個包圍殲滅。
6月22日，印尼軍停止有組織的抵抗，印尼軍蘇拉威西島駐軍司令蘇寶拉包基少將及參謀長自殺。
蘇拉威西島北部的戰鬥開始進展順利，眼看就要結束了，只剩下一個島上主要的城市－萬鴉老。
印尼軍蘇拉威西島最高軍銜之一的龍－皮埃斯少將率領印尼軍的兩個師駐防這裡，加上逃過來的殘兵敗將，人數達到三萬之衆。
對面進攻的聯合軍加上附屬部隊有五萬之衆，並可以隨時得到聯合空軍的有力支持。
萬鴉老這個城市荷蘭人曾對它進行了最後一次大規模重建，使之成爲博物學家阿爾弗雷德－華萊土所說的東方最美的地方之一。
聯合軍的首次進攻受挫，原因在於前面的戰鬥太順利了。
聯合軍通過擴音喇叭發出公告－－駐軍三天內必須投降，平民請撤出城市，但被拒絕。
三天以後，聯合軍的重型轟炸機，攻擊機開始火力準備，然後，地面炮火加入進來。
東方最美麗的地方變成人間地獄。
猛烈地轟炸和炮擊進行了不到一天，一面白旗豎了起來。