在蘇哈拓長達32年的統治時間裡，華人被打壓、司空見慣，印度尼西亞現當代幾乎重大的排華事件都發生在蘇哈拓時代。而這背後，清晰可見的卻是蘇哈拓政府行爲。
08年蘇哈拓死後，有媒體人聲稱，他的死，至少把三個秘密帶入了墳墓，其中之一，便是當時是陸軍少將的蘇哈拓，對1965年9月30日“9?30事件”當晚，綁架和謀殺6個印度尼西亞陸軍將領的陰謀是否知情？
1965年9月30日至10月1日發生了舉世震驚的“9?30事件”，這一事件引發了印度尼西亞歷史上最殘酷的血腥大屠殺，並導致蘇家若下臺和蘇哈拓長達32年的獨裁統治。長期以來，雖然疑點重重，但事件的真相一直被掩蓋。由於涉案人員大都逝去，揭開這一謎底已成爲難題。
20世紀60年代初，印度尼西亞共產黨迅速發展爲擁有300萬黨員的大黨，併成爲蘇家若總統可資依靠的政治力量。蘇家若明確說道：“我是共產黨人的朋友，因爲共產黨人是革命者。”
1965年5月他又講，“沒有共產黨幫助，印度尼西亞永遠也不能作爲第一流的大國出現”，“我愛印度尼西亞共產黨，把它看成我的兄弟”。蘇家若的言行引起印度尼西亞右翼勢力，特別是陸軍中右翼勢力的怨恨。陸軍中得到美、英支持的“將領委員會”密謀發動推翻蘇家若總統的政變。
1965年9月21日，由40名陸軍高級軍官組成的“將領委員會”秘密集會，並從首都雅加達以外調遣軍隊，準備於10月5日建軍節時發動政變。這些陰謀活動被蘇家若總統的衛隊長公羽東中校獲悉。他聯合陸軍戰略預備隊加裡曼丹第四軍區司令蘇帕左准將和陸軍上校狄臘福等，決定採取先發制人的軍事行動，綁架陸軍主要領導人，挫敗政變圖謀，並由狄臘福兩次去見當時掌握強大的陸軍戰略預備隊兵權的蘇哈拓將軍，向他彙報情況。
9月30日夜22時，公羽東等人採取了行動。7輛卡車裝滿身穿總統衛隊服的武裝士兵從哈林空軍基地出發，次日凌晨到達雅加達，然後分赴7名陸軍將軍的寓所搜捕。結果，陸軍參謀長雅尼中將、潘賈伊坦中將和哈約諾少將被打死，蘇普拉普託少將、帕爾曼少將和蘇多佐准將被綁架到了哈林空軍基地，後來遭到殺害，只有納蘇蒂安將軍一人翻、牆逃匿。
10月4日，被殺害的6名將軍和一名副官的屍體在哈里姆空軍基地附近的鱷魚洞的枯井裡發了。據說他們中活着的3個人曾經遭到過印度尼西亞共婦女組織的拷打，這些人的屍體已殘缺不全，有的甚至眼睛被挖掉，生、殖器也被割掉。
事發後，一直不動聲色的蘇哈拓迅速指揮陸軍進行了全面“反擊”。
羽東中校的一個最大疏忽是忽視了蘇哈拓少將的力量，沒有把這個印度尼西亞陸軍戰略後備司令部司令列入綁架名單，這就給蘇哈拓將軍和印度尼西亞陸軍以反擊的機會。而蘇哈拓將軍的策略，就是要把“9?30事件”與印度尼西亞共產黨甚至蘇家若總統聯繫起來，掀起反、共，以便奪取陸軍和國家的領導權。因此，從這個意義上講，公羽東中校的冒險正好中了蘇哈拓和印度尼西亞陸軍早已設下的圈套，給了他們以張網待捕的藉口。
10月1日清晨6時整，蘇哈拓正在家中睡覺。突然，他接到了一名部長的報告，說民族英雄紀念碑和獨立宮附近出現了許多來歷不明的部隊。於是，蘇哈拓立即穿好野戰服，驅車趕往陸軍戰略後備司令部。與此同時，他已知道7名陸軍高級將領已遭綁架，並準備暫時接管陸軍司令部的領導權。
抵達陸軍戰略後備司令部以後，蘇哈拓迅速瞭解到，蘇家若總統沒有到獨立宮來，而是直奔哈里姆空軍基地了。7點整，蘇哈拓打開收音機，他第一次聽到了公羽東中校的聲明。由於公羽東曾是印度尼西亞共領導人阿育民的養子，蘇哈拓得出結論，“9?30事件”是印度尼西亞共產黨策動的一個政變陰謀。
聽完廣播後，蘇哈拓立即召見了參加公羽東冒險的兩個營的指揮官，並對他們進行了策反工作。
大約9時一刻，蘇哈拓召開了參謀部會議，對形勢進行了分析，並擬定出了對策。蘇哈拓首先駁斥了公羽東中校的廣播講話，對與會者說，“公羽東所說的完全沒有事實根據”，“將領委員會根本不存在，有的是一個評委會，全稱是‘陸軍高級軍官職稱評委會’。我就是其中的委員之一。”“保護蘇家若總統的安全，只不過是他們的一個藉口。實際情況是，此時此刻，蘇家若總統並不在獨立宮。”
最後他肯定地說，公羽東的行動不僅針對所謂的將軍委員會，而是有更加深遠的謀略。“他們發動政變，用暴力手段奪取國家政權。這些肯定是印度尼西亞共產黨策劃的”。
會議決定對公羽東中校進行反擊，並由蘇哈拓統一指揮反擊行動。
會後，蘇哈拓馬上動用了陸軍的內部通訊，與各軍兵種司令和各地方軍區司令進行了聯繫，並通知他們，他已暫時接管了陸軍的指揮權和領導權，只有陸軍戰略後備司令部司令纔有權調動部隊。
中午11時左右，蘇哈拓與部下討論了攻佔印度尼西亞共和國廣播電臺和電訊局的計劃，因爲這兩個關鍵部門已被公羽東的部隊所佔領。
12點半，蘇哈拓召開了第二次參謀會議。這次會議主要討論了攻佔哈里姆空軍基地的計劃。考慮到蘇家若總統正在那裡，蘇哈拓向總統發出了警告。當天晚上，蘇家若被迫乘小汽車回到茂物宮——哈蒂妮夫人的住處。
10月1日，黃昏祈禱時間剛過，攻佔國家廣播電臺和電訊局的戰鬥就打響了。在赫魯上尉和烏立普上尉的率領下，陸軍突擊團開進了國家廣播電臺和電訊局。由於公羽東的部下已經逃跑，陸軍突陸團未遇到反抗就控制了國家廣播電臺。而電訊局當時是由印度尼西亞共的人民青年團看守的。他們以爲開進去的部隊是他們的同伴。在這種情況下，解除人民青年團的武裝簡直易如反掌。因此，未放一槍一彈，印度尼西亞陸軍就佔領了國家廣播電臺和電訊局。
7時整，印度尼西亞國家廣播電臺播出了蘇哈拓將軍的錄音講話，這次講話使全國都知道蘇哈拓是反叛亂的英雄。在講話中，蘇哈拓告訴全國聽衆，1965年10月1日，在雅加達爆發了一起反革命暴、亂事件，他們自稱“9?30事件”。這些人綁架了6名陸軍高級將領，並非法佔用了雅加達印度尼西亞共和國廣播電臺和電訊總局。他還宣佈，“陸軍的領導權暫由我掌握。印度尼西亞共和國陸軍、海軍和公安、部隊之間互相理解、互相合作、團結一致，共同平息‘9?30事件’所發動的反革命活動”。
10月2日中午11時左右，蘇哈拓接到蘇家若總統對他的無線電通知，要他立即去茂物宮一趟。蘇哈拓決定乘吉普車前往。在那裡，蘇哈拓見到了總統和空軍司令達尼等人。蘇家若總統要求蘇哈拓以政治方式解決危機，但遭到了蘇哈拓的拒絕。最後，蘇家若被迫任命蘇哈拓爲負責恢復治安和公共秩序的陸軍司令，而普拉諾託少將負責主持日常事務。
當蘇哈拓從茂物宮返回陸軍戰略後備司令部時，印度尼西亞陸軍已經攻佔了哈里姆空軍基地。公羽東中校已不知去向，艾地乘飛機逃往日惹。空軍司令達尼上將及其家屬在茂物宮，受到蘇家若總統的保護。攻擊哈里姆基地的戰鬥，只發生了零星的對抗，陸軍方面死1人，空軍死2人。至此，“9?30事件”已告完全失敗。
澳大利亞人萊格在其所著的《蘇家若政治傳記》中稱，“9?30事件”的主要事實雖已衆所周知，“但對其細節和內在含義可能永遠莫衷一是”。
對這一事件的疑問主要有三：第一，蘇哈拓到底知不知道7名將軍要被綁架？第二，爲什麼手握兵權又持反、共態度的蘇哈拓的名字不在被殺的將軍名單中？第三，爲什麼公羽東要將抓獲的將軍殘忍地殺害？
有跡象顯示蘇哈拓事前已經獲悉，陸軍一批青年軍官即將在1965年9月30日晚採取行動，綁架幾名陸軍將領。這些青年軍官之一的狄臘福中校，曾經在雅加達一間醫院拜訪了蘇哈拓，向他報告他們計劃先發制人，採取行動對付據稱企圖從蘇家若總統手中奪取權力的“將領委員會”，蘇哈拓當時是印度尼西亞陸軍戰略預備部隊司令。據狄臘福說，蘇哈拓當時的反應是中立的。
平息“9?30事件”後，以蘇哈拓爲首的陸軍領導人及右翼勢力開始了對印度尼西亞共產黨的全面清剿行動。10月8日，雅加達召開了50萬人的大會，遊行隊伍焚燒了印度尼西亞共總部。
史無前例的大逮捕和大屠殺隨之拉開了序幕。
據不完全統計，從1965年底到1966年中不到一年的時間裡，約有50萬人被捕，25萬多人被殺。而國際媒體估計的數字要大得多，如《倫敦經濟報》稱死者達100萬。當時流經雅加達的梭羅河水面上，漂浮着許多屍體，河岸被血污浸染。遇難的不僅有共產黨員，還有他們的親屬甚至同情者。
這次大屠殺已被稱爲世界最嚴重的大屠殺。
在清除印度尼西亞共的過程中，印度尼西亞軍方還將目標對準了蘇家若的總統權力。蘇家若雖極力挽回局面，但在軍方及右翼勢力的阻撓下，他逐步被架空。
1966年3月11日，3名將領來到蘇家若的茂物行宮，迫使蘇家若簽署所謂的“三一一命令”，把行政權力移交給蘇哈拓。1967年3月7日，在陸軍的壓力下，蘇家若總統被迫交出權力，蘇哈拓任代理總統，而蘇家若仍保留總統職位。但軍方對此仍不滿足，1967年3月12日，軍方操縱的臨時人民協商會議一致通過撤銷對蘇家若總統的任命，剝奪其所有職權。
這便是當時震驚世界的930事件始末，在那段時間中死亡的人數，有人比喻爲希特勒對猶太人的大屠殺，雖然那次的屠殺中的死亡人數沒有六百萬之巨，但多方考證的結果證明，肯定是超過一百萬的。
“三十年前，一百萬的鮮活生命永久的從印度尼西亞消失，同時從這塊版圖上消失的還包括共和的力量。”唐昱在看到那段歷史的時候，不由自主的感慨了一句，蘇哈拓他們當時分明是採取了舊社會時期的株連制度，不僅不放過共產黨員本人，家人也不放過，甚至連同情者都要殺死，堪比清朝時候的文字獄了，當然，這次事件也造就了蘇哈拓政權長達三十二年的獨裁，這次，他似乎有重新重複當年那場大屠殺的衝動，想要繼續延續下去他的政權。
當然，這次他的目標換人了，換成了三十年前幫助過他的人。
事實上，這會兒留在印度尼西亞的華人，大多數是親呆灣政權的，親共的華人，早在930事件的時候被清洗掉了，剩下的也都撤回中國，沿海地帶有很多華僑農場，便是當時爲了安置這些人的。
而當時幫助蘇哈拓的，正是呆灣和美國當局，也有不少的華人幫助印度尼西亞政府清算親大陸華裔的海峽對面的同胞，而且這些人爲了表忠心絕大部分都入了印度尼西亞籍，只不過蘇哈拓此時爲了自己的政權，要把屠刀對準這羣人了。