劉基畢竟是位有血性、嫉惡如仇的人，雖然不願自己出面，還是要兒子劉璉不經過中書省，直接向皇帝上奏章，報告這件事。這時胡惟庸正以左丞相主管中書省，。俗話說君子報仇，十年不晚，看來胡惟庸還是位君子。以前劉基在朱元璋面前說了他的壞話，沒有讓他當丞相的一箭之仇，這下正是報復的時機。於是他指使其黨羽弄部尚書吳支彈劾他，誣陷他與百姓爭奪淡洋，只是因爲淡洋位居山海，有王氣，劉基想闢之以爲墓地，圖謀不軌；百姓不肯讓給他，他就指派巡檢司，借官軍的名義逐趕居民，以致激起民變。吳雲的彈劾奏文呈上朝廷之後，胡惟庸藉機公報私仇，請求皇上加以重闢，並要逮捕劉基的兒子。朱元璋知道這件事之後，覺得劉基也太過分了，皮膚有所動，只是想到劉基是開國元勳，功勞太大，不忍心加罪於他，只是象徵性的處分一下，取消其傣祿，並移文傳達給劉基，使他知道了這件事。劉基接到了朱元璋的移文後，即刻入朝面見朱元璋，由於心裡害怕，不敢辯護，怕進一步惹起太祖的不快，只是引咎自責，請辦其罪，也不敢提回家的事。這樣一折騰，劉基終於病倒了。
不久之後，胡惟庸被提升爲丞相，病中的劉基，在京師聽說了這件事之後，痛心疾首，悲傷地說道：“胡惟庸爲相，定會出大禍，國家必然會大亂，生靈又將遭受屠戮。假使我的話不應難，那是因爲蒼生民衆有天大的福份；如果我的話應驗了，這些芸芸衆生怎麼辦呢？”劉基悲憤交加，積憂成疾，臥牀不起，洪武八年三月，朱元璋看到劉基行將就木，大發測隱之心，親自制表賜給劉基，並派使者護送劉基回鄉。回家後，劉基病得更厲害了，只過了一個月，他就帶着無限的憂愴，滿腹的怨氣，離開了人世，終年六十五歲。一代謀士，卓越見識的劉基就這樣淒涼
的長眠在家鄉的山峰上。劉基的死，首先與胡惟庸的進讒加害有關。史料記載，劉基在京病重之時，胡惟庸曾假惺惺的派醫生來給他診治，醫生給了他一些藥，吃了一些藥，吃了後，腹中就有拳頭大小的石頭積物。劉基本是一個寬宏大度之人，萬萬想不到胡惟庸會採取如此卑劣的手段毒害於他，真是以君子之腹度小人之心。其次與朱元璋多疑的本性有關，他對這樣一位忠心耿耿的功臣都不放心，爲了自己的帝位，什麼手段都使得出來。這證明劉基當初請求隱居是完全有遠見的，只是他還隱得不徹底，最終還是逃不脫走狗烹的可悲下場。劉基至死都沒有忘記對明王朝的效忠。在臨終前將自己用心血凝成的著作和預測時勢、人事的奏章呈獻給朱元璋，表現了一位既激又疏淡，既充滿激情又富有柔情的正直謀士的情致。說明了劉基既有飄逸曠達、澄明無滯的氣質，又有一顆放不下的心腸，爲人生操思的拳拳之心。這是典型儒學人格的象徵。
病榻上的劉基，已經是奄奄一息，病得骨瘦如柴了，他把大兒子劉鏈叫到自己的身邊，從枕頭下顫顫索索拿出一本發黃的小岫子，交給他說道：“這是一本關於天象人事的書，它凝結着爲父多年的軍事實踐和從政生涯的經驗，你要將它交給朝廷，並叫皇上不要讓後人學習。”它就是至今也使爲覺得神秘莫測的《天文書》。後來，太祖下令此書與《百戰奇略》一樣，屬於機密文件，秘而不宣，終致失傳，可謂歷史上一大損失。他又將一份奏章交給次子劉景，教誨道：“爲政之道，寬猛如循環，要有鬆有緊，有縱有收。澄清天下之時，應該號令嚴明，有罪必斬，以法治軍；坐天下的時候，尤其是現在，正處在休養生息的關鍵時期，必須修明德政，減省嚴刑，實施仁義，祈求永命。知形勝要害之地，要與京師聲勢相聯絡。本
想作一份遺表，說明上述自己的觀點，只是因爲胡惟庸在位，作了也沒有什麼作用，反而會貽害於你們，但我堅信，胡惟庸必定要出事，他事發之後，皇上必定又會思念於我，如果他向你們問起我的情況，你可將這份機密奏樂章獻給皇上。”劉景含着眼睛答應了自己的父親。
再說，自從楊憲和汪廣洋相繼因罪罷官後，胡惟庸總攬中書省，獨斷專行，濫用生殺黜陟的權利，逞淫威，結朋黨，營私利。凡是內外各司進奏皇上的封事，胡惟庸先取來觀看，有不利於自己的奏章，都被他壓下，隱匿不矛上報。朱元璋漸漸覺察到胡的反常澮。加之想起以前劉基對他說過的藥石積腹的事情，當時朱元璋還不太在意，認爲劉基是多疑，現在回想起來覺得其可能性很大，於是下令追查起這件事。胡惟庸知道事情終會敗露，自計道：“皇上草菅舊功臣，怎麼會饒恕我？事發是死，起兵反叛也是死，不如先下手爲強，不要束手待斃。”胡惟庸又因爲同太師李善長相交甚厚，同其弟顧存義結爲兒女親家，故而貪賄弄權，肆無忌憚。恰在這個時候，傳言他定遠舊宅裡有一口井，這井當中忽然生出了竹筍，鑽出了水面數尺，而且他的父親，祖父和曾祖父三世的墳上，在每天夜裡都有燭光映天。人們都把這些事稱爲祥瑞，胡惟庸知道之後更是得意忘形，野心勃勃，簡直不可一世。時值他的家人販奸榜辱守關官員，被告到了朱元璋的面前，朱元璋聽到了之後惱怒異常，馬上下令殺之。胡惟庸急忙上殿請罪，假裝不知道這裡的詳情。可是這個時候朱元璋又追究起劉基的死因。胡惟庸被問得難以回答，他預感到不妙，他尋思道：“主上對勳舊重臣都是隨意處置，更何況對我呢，恐怕難以容忍，與其束手待斃，不如先發制人，或者還有成功的希望！”於是加緊了策劃的叛亂。
（本章完）