除此之外，聯邦在發展中的這十幾年中，也遇到了更多的問題，首先一個就是黑社會問題。聯邦在成立之初就嚴令禁止黨派的存在，但是有人的地方就有羣體，因爲人是一個羣居動物，而這個羣體必然有它自身的利益索求，這種索求經過發展，就會逐漸演變成一個羣體的追求，說白了吧，就是黑社會的成型。
既然叫黑社會，那就肯定是對應着白社會而講的，那麼白社會是什麼呢？其實就是聯邦政府，而黑社會就是要彌補政府所管理不到的地方，聯邦政府有管理不到的地方嗎？回答是，必須有！只要是在一個追求民主法制的政府的領導下，就必然會出現黑社會這種民間的組織，他們會在政府照顧不到的地區和空間裡，旺盛的生長開花，讓你鏟也鏟不乾淨，滅也滅不完。
目前聯邦國內的狀況就正好符合了黑社會滋生的條件，聯邦政府雖然在骨子裡是獨裁政府，但是在法制和人制上，劉芾還是選擇了絕大部分的法制，當然了，劉芾自己不在法制範圍之內，不過這並不太矛盾，因爲劉芾頂多就是有個妻子，連個孩子都沒有，更沒有身後那些什麼大家族大財團的影子，所以並不會對聯邦的法制制度提出什麼挑戰。
另一方面，劉芾對自身的要求還是比較嚴格的，他信奉一句話：己所不欲勿施於人。他雖然不信教，但是過得比清教徒也好不到哪裡去。首先他不好吃，他認爲吃飯和睡覺是人類最無用的兩個習慣。但是肉體上又離不開，所以在這兩個反面，他沒有什麼可享受的，能吃飽，能不失眠，就是最大的追求了。
其次他也不好色，雖然漂亮的女孩子是個男人就喜歡，但是他也只是停留在了喜歡看一看的程度。每天裡日常工作都忙不完，年紀又一天一天的大了起來，養後宮這個穿越人士經常乾的事情他沒有去涉足。
最後，他對錢也沒什麼感覺，金錢對於他來說，已經就是一個數字了，國家沒有錢不成。少賺一點他都急，而他自己的財產，大多也都拿出去做各種捐款了，他的愛好不多，用不到多少錢，自己又沒孩子。攢那些錢何用？
說到愛好，劉芾基本上只有3個，一是沒事就往研究所裡跑，他喜歡到哪裡去裝半仙的成就感；而是釣魚，只要有時間。他就會跑到一個安全的海域裡去，和海里的魚類做生死搏鬥；最後一個愛好就是建國了。這個愛好有點大，在劉芾心目中，目前的南海聯邦國土還不夠理想，他一直念念不忘南邊那塊大陸，做夢都想着怎麼去給搶過來。
當一個人對自己狠的時候，尤其這個人是領導，那麼他的下屬也會主動或者被動的去模仿或者學習他的習慣，這用術語來說叫：上有所好，下必甚焉。大概意思就是說，處於上位或者高層的如果有什麼愛好，那麼下屬就必然會和他有着同樣的愛好，而且還要比他強烈。
這句話很富有哲理性，由於有了劉芾這位毫無情趣、對自己都狠的總統，聯邦政府的高層裡的絕大部分官員都不自覺的按照這個標準來要求自己了，再加上那幫總統的鐵桿粉絲外加狂熱崇拜者內務部特工存在，很多高級官員即使不太認同劉芾的生活方式，也不得不有樣學樣的裝出這種狀態來，而且還得裝的很像才成。
一個人如果長期讓自己處於一個演戲的狀態，時間一長，他就入戲了，很多官員也是如此，最初還是裝模作樣，慢慢的這種生活習慣就成了真正的生活習慣，也就不覺得清苦和不習慣了。當然了，劉芾絲毫沒有提出過這方面的要求，他並不反對官員們去追求更高檔的生活品質，只要這個錢是通過正當途徑來的，就絲毫問題都沒有。
雖然聯邦的上層還都比較廉潔奉公，但是這也只是聯邦政府裡的一種風格，和普通的聯邦老百姓根本就挨不上邊。對於生活在聯邦中下層的老百姓來說，政府高官們是否廉潔，生活是否簡樸，和他們的關係都不大，他們接觸不到那個層次，他們只想能多掙點錢，讓自己的生活更好。
這些年隨着聯邦國內經濟的快速發展，在國內慢慢的就出現了一些灰色組織，比如在碼頭工人羣體中、國內海上短途運輸業中、色情產業中都會產生一種類似於幫派的民間組織，他們最初的成立目的可能是爲了團結起來增強競爭力，也可能是爲了抱個團讓個體更安全，但是慢慢的，隨着這些組織的逐漸壯大，它們的力量逐漸引起了一些人的注意，這些組織也由於這些人的加入而變得越來越偏離了原來的發展軌跡。
它們開始向警察部門和聯邦政府最基礎的管理部門進行滲透，通過金錢、美女、選票等手段，拉攏了不少聯邦低級的政府官員和警察，逐漸的形成了自己的勢力範圍，並開始進入了規模化擴張的階段。
對於這種現象，劉芾一直都沒注意到，別說劉芾這個天天待在總統府、研究所和釣魚船上的總統了，就連內務部的特工和情報員們，也都沒有留意到這些組織的動作，因爲這些組織往往都是在人民底層建立的，並沒有公開的活動，開始階段也並不觸及聯邦的法律，所以很不起眼。但是當它們進入了擴張期之後，就慢慢的浮出了水面，開始讓更多的人注意到了它們龐大的勢力和能力。
最初引起內務部重視的，是一個叫“水手互助會”的組織，聽這個名字就能知道，這是一個以水手爲主體的民間組織，更準確的說，它的成員全都來自在聯邦國內的各條海上運輸線上跑船的水手。
在內務部的一次例行對內部人員的考評中，一位隸屬於內務部內務司的外勤特工被查出在個人生活上有着重大問題，他不光有一個老婆，還在外面養了2位情人。這個情報不是內務部查出來的，而是這個特工的老婆跑到內務部的監督司裡來揭發的，他的這位老婆由於無法忍受他在外面豢養情人而怒火中燒，在兩個人多次吵架之後，一怒之下，就把自己的老公給告發了。
既然他的老婆提出了告訴，監督司的人員就必須仔細覈查，然後提交書面的核查報告，而且這個報告將保留10年，那幾位監督司的人員經手了這個案件，必須都簽上自己的名字，一旦將來出現問題，是要追究責任的。
結果，內務部的監督司很快就在這位特工身上發現了更嚴重的問題，生活開支與其收入嚴重不符！本來豢養情人這個問題並不算是犯罪，只能說是個人私德上有虧欠，這也就是因爲內務部是聯邦的強力部門，所以對員工的要求比較高，纔對個人私德也加以限制。但是開支與收入嚴重不符就不是小問題了，尤其是在內務部這種部門裡，一旦經濟上發現了問題，那肯定不是一個孤立的問題存在，最終很可能就會帶出一連串的其他問題。
在發現了這名特工很可能有經濟問題之後，監督司就動用了手中的特權，開始對這名內務部特工進行了全天24小時的監視。結果只用了4天時間，就大概搞清了他隱瞞收入的來源，竟然都是受賄款項。