洪仁玕跑到太平天國總攬朝政的時候，左宗棠卻倒了血黴，咸豐皇帝對他很厭惡，御批左宗棠可就地正法。
寶慶之戰後，曾紀澤放走了石達開，左宗堂代湖南巡撫駱秉章給咸豐皇帝寫了一封悔過書，上奏清廷說“官軍雖兼程行走，終未能速到賊前，截其竄路。此則臣思慮所未到而深爲慚恨者也”，有人向朝廷告惡狀，說左宗棠總攬湖南軍政大權，和太平長毛有一腿，故意放走了石達開，犯了欺君罔上的大罪。
這個告狀的人，就是湖南永州鎮總兵樊燮。
和樊燮一起狀告左宗棠的，還有湖廣總督官文，樊燮是官文五姨太孃家的親戚。
他們還狀告左宗棠身爲師爺，只是舉人，卻在湖南地面驕橫無比，獨攬軍政大權，甚至干涉朝廷的用人大計，這一點，說的倒是事實。
因爲寶慶大戰之後，咸豐皇帝已經從胡林翼等人的奏摺中得知：石達開的最終戰略目標，很可能是四川，到天府之國割據一方。
這是清廷難以忍受的，咸豐皇帝便開始命令各將嚴密佈置官軍防守四川。
曾國藩重新復出後，左宗棠一直在努力爲曾國藩謀取督撫實權，他覺得清廷布防四川是一個好機會，只要運作得當，清廷有可能任命曾國藩爲四川總督。
左宗棠和巡撫駱秉章商量之後，函告湖北巡撫胡林翼，請他促使官文領銜上奏清廷。官文是滿人，朝廷對他沒有猜忌，所以湘軍將領要有什麼大的行動，一般都是由胡林翼促使官文領銜上奏。只要官文願意掛名，這個奏章在朝廷那裡通過的可能性就大得多了。
果然，清廷答應官文的請求，命曾國藩率部入川防堵石達開。
然而，咸豐皇帝還是對曾國藩有猜忌，並沒有任命曾國藩爲四川總督，他不信任漢將，怕湘軍也割據一方。
曾國藩其實是不想入川的。按照謀取東南的既定戰略，曾國藩想進攻安徽，但朝廷一直不把湘軍視爲剿滅太平軍的主力，只叫他配合綠營，對付已經成了流寇的石達開。
但是，帶兵入川畢竟是胡林翼左宗棠等幾個好友共同努力的結果，他不得不接受，硬着頭皮逆江而上，一邊慢騰騰前進，一邊觀察事態的新變化。
胡林翼見清廷始終不任命曾國藩爲四川總督，知道咸豐皇帝對曾國藩還是不信任，便再次上奏，說外省軍隊進入四川，處境孤立，恐怕難以防堵石達開。他的言下之意，便是希望咸豐皇帝任命曾國藩爲四川總督。
然而，這個時候咸豐皇帝仍然很忌諱漢族將領獲得督撫實權，湘軍的統兵大將中，只有江忠源和胡林翼做到巡撫，總督到目前爲止，還沒有任何人做過，江忠源死了，胡林翼還可以控制，咸豐皇帝實在不願將督撫實權授予第三個湘軍將領，那樣對愛新覺羅的江山統治有害。
見咸豐皇帝始終不肯讓步，胡林翼秘密來到湘軍大營，和曾國藩緊急磋商。
當時，曾紀澤已經重新回到了曾國藩的身邊。
胡林翼的意見，偏向於曾國藩不要再去四川。
曾國藩覺得這時聖旨已下，要是抗旨不尊，咸豐皇帝只會對他更加不信任，他靠在椅背上，習慣性地擡起右手，慢慢地梳理着鬍鬚，問曾紀澤：“紀澤，你說說看，四川是否可去？”
曾紀澤雙目晶亮，神采奕奕，回答說：“四川不可去，也不必去。咸豐六年逆賊內訌後，江西已漸爲湘勇光復，逆賊勢力只在蘇南、皖中兩處較爲強盛。與長毛決戰的主要戰場，也只有這兩處。現在石達開跑到廣西，可以說氣數已盡，廣西土地貧瘠，養不了那麼多軍隊，時間一長，他就會衆叛親離。長江兩岸，我們每復一城池，長毛氣焰輒消一分。“
這時，李鴻章也對曾國藩說：”圖皖中，下安慶，攻江寧，門生從心底裡佩服恩師高屋建瓴，深謀遠慮，其取勢百倍勝過江北江南大營。將來平巨憝，復江寧，非恩師莫屬。”
“少荃啦，這等大事，不許信口開河。朝廷已對江寧逆賊撒下了天羅地網，你何以知下江寧者非我莫屬？”曾國藩打斷李鴻章的話，他轉頭問曾紀澤：“紀澤，你說四川不可去，不能去，道理在哪裡呀？說說看。”
李鴻章素知老師行事謹慎，便不再說話。
曾紀澤回答曾國藩的問話說：“湘勇多年浴血奮戰，已將長毛逼在皖中、蘇南一隅之地，現在反而忽然掉頭入蜀，到千里之遙去堵流寇，等於將這伸手可摘之熟桃讓給別人。”
“這曾紀澤十分了得，長大了，越來越有遠見，可能將來他的老子也遠不及他。”胡林翼這時微微一笑，在心裡思量。
胡林翼略加思索，對曾國藩說：“川督王慶雲爲人器局狹小，他也決不會願意你入川。石逆目前確實已成流寇，軍心不穩，此去四川，將很可能走向末路，不必動用湘勇這把牛刀。”
曾國藩覺得曾紀澤和胡林翼說得有道理，但他一時犯了難，自言自語道：“可是，皇上已經下旨，如何是好？總不能枉顧皇命啊。”
“這個好辦！”李鴻章爲人處事比較圓滑，平時就鬼點子多，他建議曾國藩道：“門生以爲，恩師須立即向皇上陳明入川之非和圖皖之要，同時亦請官帥、胡帥代爲說明不能離開東南戰場的原因；爲使朝廷明白此中要害，恩師可密令目前在徽州、寧國的鮑超之部暫且撤離皖南。這樣，陳玉成部的長毛一定會乘虛而入，翁中丞必定急奏朝廷，到那時官帥、胡帥再交章挽留，恩師可免去入川之勞。”
“這主意不錯。”曾國藩不得不佩服李鴻章的處事之明。在湘勇主要將領中，彭玉麟忠貞，楊載福樸直，鮑超、李元度勇猛，曾國荃能打硬仗，卻只有李鴻章能出主意，機巧應對朝廷，畢竟他在京城翰林院待過，手腕靈活！
胡林翼也覺得李鴻章的主意可行，便回去跟湖廣總督官文商量，代爲向咸豐皇帝說情，奏請曾國藩暫緩入川，留在湖北與胡林翼的楚軍共圖安徽。
曾國藩這時處事也比較圓融，爲不使咸豐皇帝不悅，他盡起在建昌的水陸兩支人馬，慢慢踏上赴川的道路，走得相當之慢，一天也就行進十來里路，不時還以天氣原因原地休整。
幾個月後，當曾國藩的人馬剛走到武昌，就接到了咸豐皇帝的上諭，命曾國藩暫駐湖北，與官文、胡林翼商進剿皖省之計，援川部隊從湖南選調。
官文、胡林翼在武昌治酒爲曾國藩道喜。席上，湖廣總督官文提出派他的親戚、永州鎮總兵樊燮帶兩千人入川。這個樊燮，在石達開大軍襲擾永州的時候，不認真籌備防守，天天和一幫狐朋狗友置酒高會，要不是曾紀澤率軍援助，他早就丟了永州，結果寶慶會戰過後，他被人告發彈劾。官文想讓樊燮帶兵入川，立功頂罪。這一點胡林翼和曾國藩心領神會，一致同意一起保奏朝廷。
於是朝廷調樊燮立即入川。湖南永州鎮總兵樊燮接到命令後，興沖沖地準備帶着二千綠營兵啓程入川。樊燮是湖南將領，入川之前，他按例到長沙去跟湖南巡撫駱秉章報告，要湖南巡撫衙門出具調令和推薦信。
樊燮爲官不清廉，仗着是官文五姨太孃家親戚有恃無恐，名聲不好。湖南巡撫駱秉章對於樊燮的劣跡早有耳聞，湖南巡撫衙門接到不少參劾信函，駱秉章不願得罪湖廣總督官文，壓着這些信不理睬，而且自1854年進入湖南巡撫駱秉章的幕府之後，左宗棠一直是湖南軍政大權的實際操作者，樊燮來長沙辦手續，駱秉章便讓樊燮去找左宗棠。
這一日，樊燮帶着幾個親兵入城，徑直來到湖南巡撫衙門裡。巡捕見是樊鎮臺，不敢怠慢，忙進內通報。
樊燮大步踏進簽押房，沒見到駱秉章，只見到左宗棠正在低頭處理公務。
樊燮見左宗棠板着面孔，心中不快，打了招呼，就叉開兩腿坐到他身邊，擺着架子得意地說：“這次官中堂親向朝廷保舉在下去四川剿賊，樊某特來跟巡撫衙門辦一些手續。石逆孤軍遠竄，成不了氣候，樊某不敢誇口說一舉獲勝，但終究要剿滅那些亂臣賊子。”
聽了樊燮這種欺世大言，左宗棠冷冷迴應道：“朝廷調兵幾十萬，糜餉幾萬萬，至今尚未把長毛平定下去；且石達開乃賊中梟雄，曾滌生侍郎都數敗於其手，你說這話，不臉紅嗎？”
樊燮吹牛時並不臉紅，強壓怒火說：“左師爺，本官也不和你打嘴皮仗，以後你就看本官的厲害！”
樊燮來巡撫衙門，本是一種官場應酬，辦好了手續，見氣氛不好，轉身便走，並不理睬左宗棠。
“你給我回來！”左宗棠覺得自己是代表湖南巡撫駱秉章的，勃然大怒，一聲暴喝，如炸雷把樊燮驚嚇到了。他停下出門的腳步，反問左宗棠道：“何事？”
“樊燮，你可知道湖南武官，無論大小，見我都要請安，你進衙門不向我請安，出衙門不向我告辭，是何緣故？”左宗棠暴怒，面色黑得要下陣雨。
樊燮雖爲武官，但很要面子，出門從不騎馬，要擺文職官員的譜，非坐轎子不可，被譏諷爲“轎子總兵”，甚至連閱兵都坐轎子。湖廣人消遣他說：“樊總兵閱兵：坐着看”，他要面子，見左宗棠當着很多人的面呵斥自己，也怒了，高聲回答左宗棠說：“朝廷體制，武官雖輕，地位不比師爺賤，何況樊某乃朝廷任命的二品總兵，豈有向你這區區舉人幕僚請安的道理？”
“舉人幕僚”，這話有殺傷力！
中國傳統的社會，“萬般皆下品惟有讀書高”，科舉考場失意，沒中進士，這是左宗棠心中永遠的痛，這時被爛官樊燮看低，左宗棠一時語塞，惱羞成怒，氣得環眼暴凸，燕頷僵硬，虎地站起來，衝過去，一腳飛踹樊燮，然後高聲大罵：“王八蛋，滾出去！”
樊燮只得含恨退出，在長沙蒐集了一下左宗棠的黑材料，窩着一肚子氣跑到武昌，謁見湖廣總督官文，添枝加葉地把左宗棠如何無視朝廷命官、驕橫跋扈、獨斷專行的情形，向官文哭訴了半天。
所以說，*的，寧可得罪君子，不要得罪小人，尤其是有背景的小人。因爲小人喜歡在背後捅刀子，防不勝防啊！
“左賊猖狂！”左宗棠居然敢對他的姻親、朝廷指派的援川將領如此無禮，官文老大不快！當天夜晚，酒過三巡，官文便給咸豐皇帝上了一個摺子，將樊燮所說的摘要寫了幾條，又給左宗棠戴了一頂“劣幕”的帽子，說他把持湖南，爲非作歹，還把左宗棠早年一些舊賬翻了出來：左宗棠先有謀同洪秀全造反的行動。當年長毛揮師北進，勢如破竹。當其兵鋒抵達湖南時，平民出身的知識分子左宗棠有過一番深思，認爲天下大亂，首先倒黴的是平民百姓。他覺得當今國事敗壞已極，朝廷上下相蒙，賢奸不分，對外屈膝投降，內部貪污腐化，外敵侵略無已。各地盜賊紛起。另外，左氏對朝廷的統治一直不滿，曾經存有扶明滅清的思想，同情農民起義，加上科舉道路與洪秀全相似，極不順利。長毛攻抵長沙期間，左宗棠曾去拜見賊首洪秀全，共謀大計。左氏曾勸洪秀全“勿倡上帝教，勿毀儒釋，以收人心‘’，洪秀全不聽，左乃離去。這件事對左宗棠來說是很嚴重的：若爲朝廷知道，這可是滅族大罪;從太平軍中逃走，洪秀全對他也不會善罷。所以，他只好舉家隱入深山梓木洞。最終經駱秉章等極力勸說，左宗棠才勉爲其難，在駱幕供事六年，卻驕橫無比，目中無人。
官文的奏摺對樊燮蒐集的黑材料繪聲繪色，還說左宗棠故意放走了石達開，讓湘勇只追不堵，這是犯了欺君罔上的大罪。
咸豐皇帝以前也不知道左宗棠，見到官文這道奏章，大爲吃驚，怒不可遏，立即在奏章上硃筆批道：“湖南爲劣幕把持，可惱可恨，着細加查明，若果有不法情事，可就地正法。”
奏摺遞迴武昌總督府，官文的六姨太知左宗棠與胡林翼是親戚關係，便悄悄地把此事告訴胡林翼的靜娟夫人。
靜娟夫人怎能眼見自己兄弟的丈人吃官司不救，便求胡林翼設法搭救。胡林翼一面火速打發人送信到長沙，將事情原委告訴了左宗棠，一面發信給曾國藩當年的幕僚郭嵩燾和王闓運，讓他們在京周旋。
郭嵩燾此時供職南書房，此爲內廷詞臣直廬，常代皇帝撰擬詔令諭旨，參預機務。王闓運則在已升爲協辦大學士的肅順家當賓師。曾國藩率湘勇出省入鄂時，王闓運沒有隨行。咸豐五年，王闓運中舉，次年赴京會試。會試告罷後留京溫習，被肅順看中，被請入府中。
胡林翼還給左宗棠報信，說官文不日將派人來長沙調查搜捕左宗棠，建議他先去安徽宿松的湘軍軍營躲一陣子，尋求在那裡屯兵的曾國藩庇護。
左宗棠接到胡林翼的信後，藉口赴京會試，向駱秉章辭職，含恨離開長沙，回湘陰小住幾天後，便只帶着一個僕人，冒着嚴寒輕舟乘船，北去宿松找曾國藩庇護。