曹操現在有了兵馬，有了地盤，但馬上有了個很現實的問題，就是這麼多人你如何安置，如何養活？毛玠在這個時候就體現出他是一個重要的謀士的價值，他向曹操提出了一個戰略性的意見。
青州黃巾軍不是還有六七十萬不能打仗的隨軍家屬嗎？這個青黃巾軍是個奇怪的軍事組織，它整體來說並不是一個純粹的準軍事化組織，它還有許多的隨軍家屬和農民，就是當時的青州的黃巾軍戰鬥人員是三十多萬，非戰鬥人員的隨軍家屬和農民加起來一共有六七十萬，兩者加起來這黃巾軍還真有一百多萬，而且那些隨軍家屬和農民還隨身帶着農具、耕牛等耕作用品。僅在無鹽縣戰鬥結束後，曹軍就在縣城內收繳黃巾軍農耕用具十幾萬件，耕牛三千多頭。
毛玠建議曹操安排這些人開荒種田，自食其力。這些隨軍家屬和農民打仗肯定是濫竽充數，但種莊稼倒是行家裡手。如果能發揮這些人的特長，今年秋天他們就能向曹操的軍隊提供一部分軍糧。
其實，這也是後來爲曹操大規模實行“屯田”的一種實驗，毛玠的建議已經具備一個這種形式的雛形。
毛玠認爲現在曹操必須修耕植、蓄軍資。說到擴充軍隊所需的軍資，曹操和曹智心照不宣的笑了。錢！他們不缺，身邊帶的加譙縣老家藏得，絕對夠付面前這六十萬軍隊幾年的軍餉。在兗州平定後，曹操就讓樂進、李典帶人回譙縣分批運送財寶到鄄城和宛陵，黃巾軍收服，兗州到手，接下來的先期治理就需要大量用錢了。
當然，要長治久安還是要聽取毛玠的意見，除了經濟實力的比拼以外，戰爭作爲政治的延續，還要比拼政治實力，政治實力靠什麼呢？靠正義的旗幟，毛玠主張曹操必須表現自己是師出有名，是堂堂正正的正義之師，至少必須有一面正義的旗幟。
這面旗幟，目前毛玠還沒說到、想到要“挾天子以令諸侯”，這麼高深的政治覺悟。他倡導曹智應當“遵奉天子”，這個遵奉的意思，就是說你得跟現在的長安政府搞好關係，讓皇帝或則是挾持皇帝的人對你有好感，以達到曹操現在迫切需要的正歸聖命，有了皇帝或是中央政府的肯定，曹操這個兗州牧纔是合法的，以後做事才能名正言順。
毛玠說的這些其實的確非常重要，作爲想成爲一個深謀遠慮的政治家的曹操來說，現在缺的就是有人來爲他指明政治方向。
曹操對毛玠非常賞識“敬納其言”，馬上實行他所建議的一切施政綱領。派從事王必出使長安，目的是向獻帝表示忠誠，和溝通自己與朝廷當權者李傕、郭汜的關係。儘管他知道自己和李傕、郭汜的關係很糟。李傕、郭汜對他的疑忌太深了，以前甚至於是你死我活的對手。曹智自己也不怎麼看好此次王必的長安之行，但爲了鼓勵毛玠的戰略性建議，他還是做了。
接着曹操又準備實施毛玠的“修耕植” 發展農業生產的經濟策略。連曹操都認爲這很重要，他告訴曹智和屬下“定國之術，在於強兵足食”。
但曹智沒告訴他，自己在丹陽已經比曹操先一步建立了科學和帶有資本性質的屯田體系，曹操要到建安元年才實行的《屯田令》，其實曹智已經在丹陽實施了，甚至還加以了改進。
曹智對毛玠初具屯田色彩的建議加以了深化，再在私底下告訴了曹操。曹操也是眼前一亮，非常欣賞弟弟對施政綱領的轉化和深化。
於是在曹智的加工建議下，曹操等於是在興平元年提前開始了屯田令計劃。
東漢末年，因爲連年的戰爭，許多土地都已經沒有業主了，也沒有人耕種。無主田畝收歸國有，也就是說統統收給了曹操的兗州政府所有。然後把這些田地拿出來一部分交給自己的軍隊和黃巾軍投降的那些士兵去耕種，叫做軍屯，還有一部分招募了那些失地的農民，那些流民來耕種叫民屯。耕牛和農具是由政府提供，然後軍人和農民向政府交五成到六成的地租，這個就叫做屯田。屯的意思就是居住方式軍事化，耕作方式集體化。也就是說，曹操建設了一個古代的生產建設兵團，曹操的軍政府就變成了農場主。
這是一個非常高明的政策，也是一筆非常合算的買賣：第一，土地是人家丟下來的，耕牛和農具是從黃巾軍那裡繳獲的，曹操沒有一點本錢的投入，是一種幾乎無成本的生意；第二點，收五成到六成的地租，這是高利，因爲漢代初年定下的地租是十五分之一，後來漢朝最強盛、鼎盛收得最少的時候甚至到了三十分之一，曹操現在變成了二分之一，暴利。但是對於士兵和農民來說現在有飯吃了，總比原來餓肚子好，所以大家也願意。曹智也曾建議少收點地租，但被毛玠、程立等謀士反對，他們認爲將來曹操的州府、軍隊，還有隨時可能的戰爭都是急需耗費糧食的，情願現在多收，也不能因爲缺糧而面臨政府危機；第三，屯田制度是居住方式軍事化、耕作方式集體化，這就等於建設了一個軍民合一的新社會，和一支耕戰合一的新軍隊，這些人平時能幹，急時能戰，既是兵源，又是糧庫，豈不是一舉兩得，而且還解決了一個讓人頭疼的流民問題，這已經是一舉多得的政策計劃。
曹操升任毛玠爲幕府功曹，委以重任，讓他具體監督屯田的實施。
曹智也在兗州諸事稍定後，啓程回了丹陽。一路上曹智老在嘀咕，曹操現在有了毛玠、程立、荀彧等人，應該就要飛黃騰達，一帆風順了。雖說這也是曹智所期盼的，但他經過這麼多年在曹家，在三國這個大環境的歷練和薰陶，他也早已不滿足碌碌無爲的過一生，總希望自己也能有更大的建樹。