胡發奎整備自己手中兵力並沒有花費太多的時間，他手下最精銳的能戰之兵一開始是那八百人，後來從香港抽調兵力來又訓練了一批，他認爲足以一戰的也就是一千兩百人左右。在林有德尚未將火槍帶來的時候，他就用之前的數百支步槍，輪替着讓這些海盜練習射擊。不僅如此，他還着實加強了一番海盜們的紀律性，胡發奎畢竟也是在唐軍內部呆過的，唐軍怎麼練兵雖然他不一定全懂，但最起碼都看過，於是胡發奎照葫蘆畫瓢地對自己的部下操練了一番，不合格地都被他踢到二線人馬裡了。
可以說現在胡發奎手中一千兩百人的火槍隊，不僅最早都有海上劫掠的戰鬥經驗，見過血、有夠狠，而且也接受了一些近現代軍隊的東西，初步有了一些紀律性，也有了一定類似唐軍的作戰組織能力。
胡發奎定期就要給他手底下的頭目們開會，讓他們總結訓練情況，進行自我反省，並且他還要做指示什麼的。現代衆的那一套他很自然地學了過去，而且覺得十分符合自己的脾性。這些小頭目，也實際上就是他部隊裡的基層軍官，也許軍事素養比較低，不過卻有進步的空間。
這次隨着林有德帶來的武器彈藥一同而來的，還有國防部派給胡發奎的幾名陸軍軍官，他們將協助胡發奎一同整軍備戰，胡發奎對於這些真正懂行的也是十分尊重，將軍銜最高的陸戰隊少校伍東海封爲自己的參謀官，幾名尉官也都派到部隊裡作爲指揮者。這當然讓一部分小頭目不滿，但是有胡發奎的壓制，他們也不敢怎樣。
經過一個多月的準備後，胡發奎終於準備與和順公司開戰了。實際上他在東萬律、山口洋等地不斷地訓練軍隊，早已傳出了風聲，和順公司也聽說蘭芳公司現在名義上的太哥還是羅芳伯，但是真正做主的卻是來自大唐的胡發奎了。
胡發奎不僅從香盜那裡帶來了大量人馬，而且還從大唐那裡得到了武器，此時正厲兵秣馬，正常人一眼就能看出來這是想幹什麼，和順公司雖然人多勢衆，但畢竟是十四家公司組成的集合體，協作力有限。而且胡發奎的兵強馬壯，特別還裝備有和順公司很少的火槍，甚至還有大炮，更讓本質上還沒有脫離一羣普通鄉民自身體認的和順公司極爲驚恐。
和順公司的頭領謝結慌忙命人前去東萬律拜見胡發奎，提出兩家修好，一致對外。
不過胡發奎纔不會跟和順公司簽訂什麼和平條約，胡發奎直言道：“西婆羅洲華人公司現況，羣龍無首，亂象橫生，欲使我華人於此地壯大發跡，必取締種種公司，成立政府，此潮流不可阻擋，順此潮流者，可流芳千古，子孫得益，逆此潮流者，灰飛煙滅，屍骨無存，言盡於此，好自爲之。”
這樣直白的宣戰，直接使很多規模比較小的公司動搖了，在一週之內，便有兩家公司退出了和順總廳，來到東萬律向胡發奎投誠。他們也都是精明，和順公司的執行力是遠不如胡發奎的，他們退出了和順公司，和順公司一時很難對他們下手，和順公司本身團結性差，想要統一發兵做什麼事情，十分困難。但胡發奎那可是現實的威脅，如果不從了他，他便隔天提兵打上家門，被抓去做牛做馬還好，說不定一刀把腦袋斬了，那就完蛋了。
謝結連忙召集各家公司，想要商討出一個對策來，他認爲談和恐怕已經行不通，如果先下手爲強，說不定還能獲得一線生機。可是這個時候和順公司的弊端就顯現了，十幾家公司之間想法不同，而且互相拖拉，謝結尚未將所有人召集在一起開會，那邊胡發奎已經兵分三路，直攻坤甸了。
和順公司跟蘭芳一樣，沒有常備軍，遇到什麼衝突的時候，大家都是臨時武裝起來，什麼裝備都有，火繩槍算是稀少的了，更多是粗製濫造的刀具或者長矛，直接拿着礦鎬或者農具上的也是大有人在。這樣一支武裝，是不可能鬥得過胡發奎手中的精銳的。
倒是謝結也算是個有本事的，他說服了坤甸蘇丹，使他相信如果華人公司完蛋了，那麼他們馬來人建立的政權也要垮臺，所以坤甸蘇丹也派遣了一支軍隊跟和順的武裝共同行動。他們面對的只不過是胡發奎三路軍中的一路，人數只在三百多人，可是胡發奎的人馬用大炮一轟，爾後他的部隊一衝鋒，就把和順和坤甸蘇丹的聯軍給徹底打散了。
實際的戰鬥中，和順並沒有死多少人，但是炮聲轟鳴，加密集的槍聲，徹底讓他們失去了作戰的勇氣，四散奔逃。而真正的大傷亡出現在他們逃跑的時候，很多人互相推搡要過坤甸河，結果踩踏而死，馬來人和華人之間還出現了衝突。最後胡發奎以極微弱的損失便擊敗了和順的主力，帶領着他的部隊成功攻入坤甸。
這個時候纔出現了第一個麻煩，和順公司被打敗，大批的華人不敢繼續留在公司中，逃出坤甸，要麼去了更偏遠的地方，要麼就直接躲在雨林中了。胡發奎發動戰爭本來就是爲的人口，結果人們都跑掉了，這讓他極爲氣惱。
於是胡發奎不得不安撫和順公司的勞工們，並且嚴禁自己的人馬滋擾普通華人，並隨後派出了蘭芳的人手，到處去把逃掉的華人給追回來。
總體來說這一場戰爭並沒有太大難度，一些知道是不可爲的首領，直接就向胡發奎投降了。實際上一二百年時間內，西婆羅洲華人公司互相攻伐，少有直接下死手的，基本上就是敗了的人投降勝者，然後大家繼續一同在這裡討生活，所以其特徵上來看，還真的更像是黑社會搶地盤，而不是什麼政府國家。