學院各系差太大不適合不分系

不分系正流行，但不是所有學院都適合不分系：學科專業程度較高、學院內各系同質性不夠高的都不適合不分系。

學科專業程度較高的例如語言學院，因爲各語言差別很大，不適合不分系；又例如醫學院各系的學習領域「涇渭分明」，扣掉大一必修，各系日後幾乎各上各的，因此也不太可能不分系。

醫學院還有一個理由不適合不分系。以臺大醫學系與護理系爲例，雖然在同一個學院，但是各系招生錄取分數相差懸殊，如果不分系招生將造成困擾，日後分流作業更麻煩。

以學院而言，同質性較高的學院比較容易不分系，因此各校多從管理學院試辦不分系。但如社會科學院各系學術性質差異過大，如政治、法律、經濟、社會系等其實沒有太大交集，修讀領域各自獨立，且會讀這類科系的學生本身目的就比較明確，所以不太需要「延後分流」，反而是鼓勵雙主修或輔系。

有些情況是學校課程問題。例如96學年度中山大學理學院大一不分系，規定在普通化學、普通物理、普通生物學、線性代數等4科專業科目中，至少選修二科。後來有分流進物理系的學生沒修過普物，課程無法銜接。

還有一種情況是學院內各系規模差太大，或學生選擇科系冷熱差太多，也不適合不分系。如實施2年就「收攤」的中山大學管院不分系，學生日後分流時都跑到某個熱門科系，造成該系師資不足，而其他系卻開不成課。