中華軍的艦隊開始向東轉向，漸漸的脫離海岸線，好使得清軍在岸上的士兵難以發現艦隊的蹤跡，大隊離開海岸線十餘海里之後開始開始向北轉向，繞過南匯城之後抵達崇明島。
崇明島這個時候也在中華軍的控制之下，島上有七艘軍艦和兩百名守軍，這個時候中華軍的艦隊抵達崇明島之後補充了一些水和食物之後沒做停留，因爲崇明島的港口太小，艦隊的船隻難以全部停靠，再加上目前的戰局也不允許海軍再做耽擱，因此大軍繼續前行，沿着長江出海口逆流而上，一路經過江陰、太洲、鎮江之後抵達了南京城下。
這一路自然不是一帆風順的，清軍在長江的戰略要道江陰修建了一處巨大的炮臺，中華軍如果想要進入江陰以西的水域，就勢必要先將這裡的炮臺給拿下，不然的話在歸途的時候很容易遭到清軍的兩面夾擊。
江陰之戰是中華軍艦隊在三天之內的第二場戰鬥，艦隊以損失十三艘戰艦的巨大代價拿下了江陰炮臺，清軍守軍表現的出乎意料的頑強，完全是死戰不退，立國之初的清軍的戰鬥力確實不容小覷，但是正是因爲他們的拼死抵抗，使得中華軍大舉進攻的消息立刻四下傳播開來。
中華軍被擊沉了六艘戰艦，七艘重傷，陣亡人數達到三百餘人，這個傷亡數字可算是不小了，受傷的士兵也有兩百多人，好在清軍使用的都是實心彈，所以傷兵不太多，而陣亡的士兵也大多是落水之後來不及救援，被湍急的江水沖走溺死的。
在三艘戰艦的護衛之下，這七艘戰艦和兩百多名傷兵順流而下，返回了崇明島，在此治療休整，戰艦則要等到工匠們慢慢修復，才能繼續作戰。
艦隊離開江陰之後又在鎮江再次和清軍展開激戰。鎮江炮臺的規模沒有江陰那麼大，士兵的戰鬥力也要差上很多，所以這一次中華軍這邊的損失十分輕微，只有三艘軍艦被擊傷。陣亡十六名士兵，以此代價就拿下了鎮江炮臺，也算是出乎了李權的預料了吧。
中華軍一路大張旗鼓的行軍，矛頭直指江寧城（南京），這令南京城的清軍大爲緊張。清軍一面閉守城門，一面從各地抽調兵力前來駐守，一時間揚州、鳳陽、池州、廬州、寧國府的清軍都被調動起來，八百里加急的快件也從南京星夜兼程送向北京。
南京城是前朝的舊都，它的意義不是別的城市能夠比擬的，這也是爲什麼鄭成功會北伐的時候一定要拿下南京，因爲他十分清楚，只要拿下南京城，就勢必會造成舉國震動，不僅是中原的百姓會人心鬆動。而且江南各地的反清志士也會立刻響應，到時候清軍面臨的就是四面楚歌，舉步維艱的局面，而他鄭家軍隊則可以趁勢崛起，光復舊都恢復正統也是大有可期的。
不過十分可惜的是鄭成功的北伐最後是失敗的，北伐軍隊在南京城下一敗塗地，從那以後清軍四面緊逼，鄭軍步履維艱，終於不得不退守臺灣，這一切都是李權當時親自經歷過的。五年前的事情似乎歷歷在目，又是當時的南京城，還是一樣的從水路進軍，但是不同的是這一次清軍的對手是強大的中華軍。
南京城的加急告件只用了六天的時間就送到了北京城。中華軍大局來犯，似要拿下南京的消息果然讓清廷內部震動了，南京城實在是太過於重要了，一定要不惜一切的代價將他守住，爲此朝廷甚至還特意從北京派遣了一支五千人的騎兵星夜趕往馳援，只不過這支騎兵耗時十五天。累死了上千匹馬之後，終於趕到的時候才發現中華軍早就跑的沒影了。
先不說海軍在歷經了千難萬險之後終於抵達了南京城，先來看看陸軍這邊，因爲海軍的決策，所以杭州城的清軍在被拖延了一天的時間之後，終於還是出兵前來救援鎮海了，只不過這一次派出來的軍隊人數相比於第一次來說要少得多，人數從一萬五千人，削減到只有四千人，而且趙國祚因爲擔心杭州城的局勢，所以沒有親自率軍前來。
其實之前清軍在守城的時候傷亡慘重，包括戰死和受傷的士兵，一共有超過兩千人減員，而且杭州城剛剛經歷了大火，城中很多百姓都流離失所，人心惶恐不安，而且趙國祚也擔心中華軍還會繼續前來進攻，因此不敢絲毫的大意，整日都在加強城防，能夠派出四千人已經是很大的妥協了，直到七八天之後，中華軍艦隊北上的消息傳到杭州的時候，趙國祚這才長長的鬆下了一口氣，沒有經歷過的人始終都不明白，一個強大的海上敵人會對自己造成多麼大的威脅。
杭州城的援軍還是選擇走陸路，杭州距離寧波直線距離有三百多裡，加上山路崎嶇，部隊的隊形又拉得很長，這都對行軍的速度產生了不利的影響，因此杭州城的援軍直到鎮海之戰打響了四天之後才姍姍來遲。
而他們因爲不瞭解戰局，加上沒有和紹興當地的軍隊合兵一處，因此和寧波城中的援軍一樣，一頭就鑽入了中華軍早就佈下的口袋之中，在經過三個多時辰的激烈戰鬥之後就被中華軍消滅了。
經過這一戰之後，中華軍在鎮海的局勢就徹底的穩了下來，中華軍自從登陸之後先後經歷了十餘次的戰鬥，除了四五次比較大的遭遇戰之外，其餘的戰鬥都進展的十分順利，因此部隊的傷亡並不太多，而且中華軍在幾次戰鬥之中始終都保持着兵力上面的優勢，而反觀清軍，因爲部隊之間缺乏聯繫，導致很多軍隊都是按照預定的計劃行軍，根本就不做改變，因此很容易就遭受中華軍這邊的埋伏，死傷慘重。
這個時候中華軍已經從最初的只是佔領了鎮海，到將勢力範圍擴展向北到了鳴鶴場、松浦鎮、長西嶺一帶，向南控制了昆亭寨、天童山、寧波府，幾乎佔據了大半個寧波府，而且這個時候奉化城中的軍隊已經傾巢而出，幾乎就是一座空城，所以寧波府內幾乎再沒有像樣的抵抗勢力了。。