不過他的這番交代還沒有傳到清軍前面的隊伍那裡去，明軍的伏擊便開始了。
明軍居高臨下，一陣猛烈的射擊，清軍猝不及防之下陣型大亂，張聰這時率領敗退的明軍從谷口往谷中反衝過去，清軍抵擋不住，紛紛向山谷中敗退。
明軍稍稍追擊之後立馬脫離了戰鬥，迅速向着泉港的地方趕去。
明軍的反擊讓谷中的清軍一片混亂，前面的清軍往後面撤退，後面的士兵還在前進，加上山谷中地形太窄，頓時整支軍隊亂成一團了。
李崔大怒，騎馬趕上前軍，這時明軍已經撤出山谷了，清軍前軍將領將遭襲的詳細經過報告給他，李崔嘆了一口氣，看了一眼明軍撤退的谷口，下令清軍先行整軍，再行追擊。
他心裡明白，伏擊他的軍隊應該是塗嶺的守軍，既然塗嶺的守軍出現在了這裡，那麼說明塗嶺方向的清軍攻擊還是有點成效，明軍應該是放棄了塗嶺，只是這樣一來明軍肯定急於撤退，等清軍陣型整頓妥當，只怕是追不上明軍了。
這支明軍看來很狡猾，李崔暗暗記在心中，將來要是再遇到這支明軍，一定要將他們全部殲滅，再也不能讓他們逃脫了。
項玉和張聰兩軍匯合之後馬不停歇，快速的向泉港方向撤退，明軍這時人數不到兩百五十人，這時已經到了正午，塗嶺方向的清軍應該已經發現了山上的明軍已經撤退了，那麼他們可能立即出兵南下，襲擊惠安，項玉並不關心惠安的防務，他擔心明軍在撤向泉港的途中會遇到南下的清軍。
因此派遣了很多斥候在前面探路，好在他們運氣不錯，並沒有遇到清軍。
明軍一路避開大路，直到傍晚時分纔再次回到了泉港，不過海面上卻看不到明軍的戰船了，項玉令士兵照舊點燃了幾堆篝火，士兵們又累又餓，紛紛圍坐在篝火旁邊，過了沒多久，海面上終於出現了兩條船影，明軍的船隊終於來了。
明軍兩百多人花了進一個半時辰終於全部登上了戰船，兩艘戰船向南行去，匯合着等候在海面上的另一艘大船向廈門行事過去。
此時，泉州府已經大部分淪陷，清軍三面大軍兵臨**城下，北面的清軍攻下了惠安，西邊的清軍從溪尾出兵直達**城下，李崔的軍隊也度過了安溪從後面迂迴，切斷了明軍從陸上向南方撤退的道路。
周全斌一連發了七封告急信，請求廈門方向的明軍從南邊接應泉州府的軍隊撤退，但是廈門此時自己也是岌岌可危，海澄再次陷落，清軍從三面陸地包圍了廈門，在城外架起了上百們火炮日夜轟擊，根本沒有能力從陸地上去接應周全斌，唯一可行的是從海上派出艦隊接應明軍撤退，但是清軍水師這時已經抵達泉州灣，清軍的目的很明確，要從海上進攻，配合陸地上的清軍打開局面，意圖一句徹底殲滅南方最後一股抵抗勢力。
在這樣的情況之下，鄭成功自然不會冒險派出自己手中的王牌水軍，周全斌在**城抵抗了三天之後終於城破身亡，明軍大部分戰死，兩千餘人被俘，最後被清軍殘忍的殺死，清軍的做飯激起了明軍更大的仇恨，也斷絕了明軍投降的念頭。
明軍陳鵬部在高崎大敗清軍，斬殺清軍五千餘人，清軍三路進攻其中一路已經被擊破。
鄭成功自己則率領明軍水軍主力出了廈門灣，佈下陣勢準備迎接清軍水軍，十月十日黎明，清軍從海上出發開始進攻，明軍將領周瑞、陳堯策奮勇抵抗，壯烈犧牲。清朝海軍又攻擊陳輝部隊，陳輝令部下大發火炮，此時明軍的火炮大多是西洋火炮，重量上面要畢清軍輕很多，因此戰艦上面一面就有多大三十六門重量在四百斤重的火炮，明軍火力優勢十分明顯，炮擊引起的大火點燃了大量清軍艦隻，清軍抵擋不住，且戰且退。中午，海上颳起大風，海浪洶涌，鄭成功親自率領鉅艦衝殺清軍船隊，鄭泰也率領浯嶼方面軍隊加入戰鬥，明軍越戰越勇，清軍潰敗橫屍遍海，達素乘坐小船狼狽逃回泉州。有兩百名滿洲兵乘船逃到圭嶼，企圖據守頑抗，明將馬信將其誘降，然後在夜裡將他們全部投入大海淹死。
這一戰打完之後清軍徹底殲滅明軍的企圖便被粉碎，海澄重新被明軍奪回，但是明軍自己也傷亡慘重，加上戰場多在廈門附近，因此不僅軍隊基礎設施破壞嚴重，而且各地的人口流失更是觸目驚心，清軍在福建一帶燒殺搶掠帶來的人口出逃，使得大批農田被荒廢，大量的百姓逃亡廣東、南洋。
戰後的廈門，項玉走在廈門的街上，放眼望去滿目瘡痍，清軍的炮擊讓這座本來就不算繁華的城市變得更加破舊，城中已經很少見到普通老百姓了，到處都是燒焦了的廢墟，和一隊隊巡邏的士兵，項玉嘆了一口氣，明軍在福建已經呆不久了。
在城西的一處大宅內，明軍主要將領都聚集在一起，商討今後的出路，項玉來的時候屋內已經坐滿了人，他的軍職比較低，有屬於新晉的統制官，因此誰也沒有在意他。
鄭成功還沒到，正堂的主座還空着在。
大堂內的將領吵翻了天，項玉留心了一下，見他們談論的主要是明軍的出路在哪裡，有人說是退往金門依託水軍跟清軍糾纏，立馬就有人反對，說金門島地方太小，人口又少，養活不了大軍，全部退到金門島是不現實的，況且現在清軍水軍不行，不代表以後也不行，萬一以後水戰不利，金門島就成了死地。
項玉微微點頭，這人的說法不錯，目光顯然要比之前的一人要看的長遠。
這人提起清軍水師要比明軍厲害，水軍中的諸將自然是不滿了，一人說道：“韃子只在路上厲害，厲害的是八旗的騎射，到了海上還不是旱鴨子一個，你看看歷次的韃子水師，有哪一次是一韃子人自己爲主的？還不都是在江浙廣東一帶找了些回水的漢人充當水軍，這樣的水師怎麼會是我們的對手！”
其他水軍將領紛紛較好，附和他所說的。
項玉卻暗暗搖頭，他是知道歷史的，明軍最後敗就敗在水軍上面，清軍水師眼下的確不是明軍的對手，但是隨着施琅被重用，他訓練出來的水師戰鬥力與日俱增，到了後來已經不亞於明軍的水軍了，兩軍在澎湖的海戰當中，清軍一舉殲滅了明軍水軍的主力，臺灣島這才被康熙收了回去，雖說那是明軍水軍的戰鬥力確實是有一定的下降，但是清軍水師的進步卻是不可否認的。
水軍方面有人出面，陸軍自認不甘落後，大廳內在此吵作一團。
這時，鄭成功終於出來了，將領們見他出來之後紛紛停止了談話，目光投向鄭成功，看他要說什麼。
鄭成功坐在正座上，向下掃了一眼，見諸將都來齊了，心裡稍稍鬆了一口氣，泉州府的周全斌戰死之後，他一直擔心底下的將領會心生芥蒂，因爲他確實是可以救下週全斌的，不過最終他沒有這麼做，兩人之間的矛盾也不是一天兩天的事情，底下的人也都看在心裡，他本以爲周全斌會投降清廷，那樣的話他要揹負的壓力就會減輕許多，不曾想周全斌竟然選擇戰死沙場，這樣鄭成功陷入了極大的被動，不得不擔心下面的將領。
“諸位將軍，此番我軍大破清軍，斬殺清軍不下三萬餘人，大大的挫傷了清軍的銳氣，半年之內清軍肯定不會再來進犯了，大軍也可以稍微休整休整，只是諸位將領切不可心生懈怠，清軍勢大，我軍暫時的目標就是保住福建一帶的大明疆土，等待時機成熟再行揮師北上，一舉蕩平天下，還我大明故土！”