在秦國邊境殘月谷，蓋聶一人擊退三百秦國鐵騎，秦始皇震怒，命丞相李斯務必剷除兩人。
李斯在陰陽家東皇太一的指引下尋訪到了蓋聶的同門兄弟衛莊，衛莊劍術超羣卻始終居於蓋聶之下，爲奪得天下第一劍的名號，衛莊答應了李斯的要求，殊不知自己已經掉入了東皇太一的圈套。
原來天明在出生之時，身上便被陰陽家偷偷種下“封眠咒印”。
逃亡路上，蓋聶與天明結識了墨家衆高手，以及楚國大將後人項少羽和墨家少女高月，一行人在命運的引領下進入被譽爲世間最後一片淨土的墨家機關城。
機關城隱匿於絕嶺雄峰之間，集結了墨家深厚的智慧，是天下所有反秦勢力最後的堡壘，它也是墨家弟子最後的避難所。
面對固若金湯的墨家機關城，趙高先用激將法又一次挑起衛莊的怨恨，繼而又用權力誘惑衛莊，讓他相信只要胡亥登基，衛莊就能擁有自己一直夢寐以求的權力與地位。
爲了攻破機關城，秦始皇派出龐大的精銳之師，衛莊找到了公輸家族的掌門公輸仇，公輸仇與墨家世代爲仇，機關城嚴密的防守工事受到了前所未有的挑戰。
衛莊刺客團中的數名高手亦紛紛出動，一時間，機關城內殺機迭起、暗流涌動。最終機關城破，被墨家鉅子啓動自毀裝置，幾百年建設而成的奇蹟之城毀於一旦。
後荊天明和墨家等人來到了桑海城，聯合儒家，經歷一系列的圍殺與逃遁，伴隨着帝國奪嫡陰謀，上演一幕幕大劇。
與此同時，蜃樓也建造完成，雲中君主持，準備奉始皇之命，東渡尋訪仙山。
這就是秦時明月的主要背景。
其中涉及縱橫家、儒家、墨家、道家、陰陽家、農家、名家、法家、兵家、醫家等等，羣星璀璨，思想碰撞，這是一個前所未有的燦爛時代，英雄輩出；也是一個動盪不安的時期，百姓困苦。
故事就從一個叫做蓋聶的人開始。
他被稱爲劍聖、天下第一劍、秦國第一劍客、帝國最強劍士。
蓋聶氣質從容淡定，處事冷靜。師出鬼谷，劍術出神入化，被稱爲秦國最強的劍客，在江湖上享有“劍聖“的名號，但是卻意外地從秦國叛逃，帶着故人荊軻之子荊天明，亡命天涯。
殘月谷，被帝國三百騎兵追上，一人一劍，屠盡鐵騎，卻也身受重傷。
蓋聶和天明逃亡途中，結識了項氏一族的少羽和墨家月兒等衆人，後前往墨家據地鏡湖醫莊。
而另一邊，衛莊則和秦國達成交易，他先後派出手下的流沙四天王追殺蓋聶一行人。
蓋聶殺無雙鬼、與蒼狼王作戰後，終因傷勢過重而倒下，幸被墨家“鏡湖醫仙“端木蓉所救。
流沙組織殺來，繼續逃亡，前往墨家機關城。
山路上，他們乘坐的馬車被白鳳的大鳥襲擊，跌落山崖。端木蓉、天明、月兒正要繼續前行時，蓋聶卻發現自己中了毒，而下毒的卻是月兒。
月兒是燕國公主，因爲她發現了蓋聶的身份，在她的記憶中，蓋聶曾經殺了他的父王燕丹。
她想要蓋聶死。
“其實我早說過，我的命是墨家救的，若墨家讓我死，只要吩咐一聲就可以了！”
蓋聶看着月兒平靜說道。
“啊，有蛇！”
憂傷中的月兒忽然尖叫一聲。
端木蓉、天明和蓋聶立即發現周圍出現了大量的毒蛇，已經將他們包圍住。
毒蛇中，走來一位身穿紅衣，妖嬈萬分，腰間纏繞着一條毒蛇的女子。她掃視一眼四人，看向了蓋聶，嬌笑一聲：“就算死，也要付出代價的？”
“你是什麼人，我看你不是好人！”
天明手指紅衣女子喝道。
“呵呵呵，這位小兄弟，說話要當心，姐姐會生氣的哦！”
紅衣女子美波流轉之間，施展出了幻術。
卻在這時，他們之間的十餘丈高空上，忽然出現一個黑影，驟然墜下，將兩方人都嚇了一跳。
“小心！”
月兒驚呼一聲。
眼看這人就要摔死，卻見他身子猛然一頓，輕飄飄的落在了地上。
此人太過悽慘，渾身鮮血，狼狽異常，而且臉上有着密密麻麻宛若蛛網一般的裂痕，宛若從地獄中走出來的惡魔，十分瘮人。
他正是楚陽。
“好玄妙的滯空之術！”
蓋聶盯着楚陽，露出凝重之色。
“臉上的所有的血管全部爆裂，還有頭皮，脖子，雙手，凡是暴露的地方，血管盡皆裂開流血，這樣悽慘的傷勢，竟然沒死？”
端木蓉倒吸口涼氣。
“你是人是鬼？”
天明驚叫道。
“你、你是從山上落下來的？”
月兒擡頭看了看背後的山峰，不禁頭皮發麻。
楚陽眉頭舒展，眼光一轉，就將周圍的情況納於眼底。
這個世界是秦時明月，當初知道後他猶豫了很久，可後來轟殺了真和尚，又有強者趕來，他沒得選擇，只能進入。
“你是天明，你是月兒，你是蓋聶，你是端木蓉！”
楚陽手指連點，道出一個個名字。
關於秦時明月的一些信息，也從心底最深處翻涌而出。
天明和月兒是這個世界的主角，蓋聶基本上也算是，至於端木蓉，相對而言，戲份少了些。
端木蓉是墨家統領之一，出身醫家。清麗脫俗，冷若冰霜，實則外冷內熱、似剛卻柔，居住在風景秀麗的鏡湖醫莊，年紀輕輕卻醫術高明，有“鏡湖醫仙“之稱。
與燕國高月公主同爲墨家弟子，對高月百般呵護。對來自秦國的劍聖蓋聶有強烈的敵意，但深入接觸後逐漸改變了看法，互生愛慕之情。
端木蓉有一顆純粹的心，她感受到了蓋聶的孤獨然而最後師傅給了她一句忠告：永遠不要愛上一個以劍爲生的男人。師傅臨死之際曾評價她：外冷內熱，似剛卻柔。
她作爲醫者有仁愛憐憫之心，曾爲了救治病人三天三夜未閤眼。對天明、月兒、少羽三人經歷戰亂之苦流露出同情之意，體貼細緻。
端木蓉作爲墨家統領，有責任感和決斷力。曾說過爲了保護月兒可以連自己的命也可以捨棄。
她也是一個典型的刀子嘴豆腐心的人。她爲蓋聶打破自己三不救的規矩後曾因立場問題對蓋聶放出狠話，而之後的旅途中，她在對其逐步深入瞭解後對蓋聶表露出關心。
端木蓉是一個有自己獨立思考和判斷力的人，處事冷靜理智，性格穩重。在衆人以爲蓋聶是敵人時她挺身而出，表明自己的想法，阻止了一場即將發生的爭鬥。在少羽想和“流沙“拼殺時，端木蓉也勸告他不要衝動，先與大部隊會和纔是當務之急。
在她的性格之中也有那種很內斂很含蓄的東西，特別是她對蓋聶的感情當中，她又是非常純粹和勇敢的。她的每一句話每一個表達表面上都是不溫不火非常冷靜的。但是在每一句話背後都有她的情緒和思想狀態在裡面。
這是一個理智、內斂、外冷內熱而又富有感情的女人。
對於端木蓉，楚陽的印象非常深。
“大叔，小心蛇啊！”
月兒忽然開口。
“謝謝了小姑娘！”
楚陽一笑，卻宛若厲鬼，將月兒嚇的花容失色。
在他周圍，一條條蛇兒已經遊了過來，昂起頭，似要攻擊。
“沒有靈性的東西！”
楚陽大袖一甩，不見什麼威勢，所有的毒蛇卻凌空飛起，落下了旁邊的懸崖。
“你竟敢傷我的小寶貝，找死！”
一直靜靜觀察楚陽的赤練，露出了惱色，手一抖，她的鏈蛇軟劍纏繞而來，直取楚陽的咽喉。
“好一個狠辣的赤練！”
楚陽伸出兩根手指，夾住了蛇形劍尖，任赤練如何抖動，都無法抽動絲毫。
“你是誰？”
赤練臉色變了，她實力不弱，就連衛莊都不敢這樣做。
“我是改變你命運的人！”
楚陽大有深意道。
在秦時明月中，赤練此人，名聲非常高。
赤練曾經是韓國公主，封號紅蓮。後爲衛莊手下四天王之一。娥眉婉轉，明眸流盼，硃脣皓齒，媚態橫生的妖冶女子；
一襲紅裝，嬌豔動人，蓮步輕挪間盡顯風姿嫣然。
嫵媚妖嬈的她精通各類毒術，可以控制各類毒蛇，而她的性感往往比毒藥更加危險。
她的火媚術可以迷惑看見她雙瞳的人，使之產生幻覺。
赤練的美，不在於外在的裝飾，而在於天生的尤物。
嬌容盈心，冶骨銷魂，妍饒豔影，魅韻惑神。白嫩的膚色，嬌豔的櫻脣，眉目如畫，端麗嬌俏。
燦若玫瑰，麗若朝霞，一雙水靈靈的桃花眼流轉出魅惑人心的萬種風情。與蛇共舞，擅魅惑，狠戾、果決而又妖嬈，如同火紅的罌粟花一般，魅惑卻充滿危險，美麗卻暗含劇毒。
她是外剛內柔的女子，宛如赤練蛇一般，有着明豔的顏色給人威懾感。
赤練蛇雖然看上去劇毒無比，但其實毒性卻很小，正好暗示了她內心的那份的溫存。常隨衛莊左右，爲了衛莊可以犧牲一切，也可以說衛莊是她的全部。同爲四大天王的還有無雙鬼、蒼狼王、白鳳凰，分別排第四、第三、第一。
長橋空寂，樹影婆娑，她風情萬種的從橋上走過，美目盼兮，巧笑嫣然；
桃之夭夭，灼灼其華，她靜靜的躺在桃花樹下，雙目迷離，恍若隔世。
總而言之，這就是一個妖嬈美麗的毒蛇，爲了衛莊，幾乎喪失了自己的個性。
“你最崇拜的人是衛莊；你最喜歡的人也是衛莊。你最大的優點，有同情心，會照顧自己。你最高興的事，就是看着有人落入自己佈置的陷阱，垂死掙扎的可憐模樣。你最大的願望，就是衛莊能夠實現他的夢想！”
楚陽看着赤練，古怪笑道：“我說的可對？”
赤練微微一顫，“你、你到底是誰？”
那些可是她內心最隱秘的事情，甚至連她自己都懵懂難以表述，卻被對方一語總結，道破了心思，怎能不讓她心驚？
“看在以往的情分上，你走吧，別再讓我遇到，否則……！”
楚陽淡淡一笑，又搖了搖頭，心中有種難言的感覺。
遙想當初，模糊的記憶中，他曾天天追更，也曾幻想過，若是能有這樣一個女子陪在自己身邊會如何？
手一抖，劍尖倒退而回，直接纏在了赤練腰間，讓這位女子更加駭然。
她已經知道不是楚陽的對手，倒也果斷，主動退走，卻又問道：“你究竟是誰？”
“楚陽！”
報上了名字，楚陽看向了蓋聶，手指一點，綠光飛速，頃刻間沒入了蓋聶體內。
“你要做什麼？”
端木蓉當即擋在了蓋聶身前，警惕道。
楚陽聳了聳肩，盤膝坐下，閉上了雙目。他體外，卻有無形的力量籠罩，以防意外。
“他在給我療傷！”蓋聶說着，就震驚的發現，隨着那一點綠光入體，他被月兒下的毒已經消融，不久前受的傷，正在快速的恢復。
不過呼吸間，傷口癒合，內息充盈，不但恢復了巔峰狀態，還隱隱有更進一步的趨勢。
“大叔，你好了嗎？”
天明雖跳脫，卻也發現了蓋聶的變化，忍不住關切道。
“好了！”
蓋聶說着，衝楚陽行了一禮，“多謝！”
“你好了？”
端木蓉一愣，就抓起蓋聶的手臂，纖纖玉指已經落在了蓋聶左手腕的寸關尺上，她就發現蓋聶的氣脈強勁有力，知道對方徹底的恢復了。
她可是清楚蓋聶的傷勢，自稱小醫仙的她都難以治療，卻被這個突然出現的楚陽給輕易的治好，難以置信，震驚的無以復加。
“你用的是什麼手段？”
她望着楚陽，目光閃閃，帶着一絲火熱。
這時，她神色猛然變化，露出不可思議之色。
月兒、天明、蓋聶都身軀大震。
在他們的目光中，楚陽臉上的鮮血倒流而回，傷口翻卷，往一起癒合。轉瞬間，滿臉的傷痕已經消失無蹤。
長髮恢復光彩，隨風盪漾，瘦削的臉上沒有一絲瑕疵，帶着陽光般的溫和。
英俊，挺拔，絕世美男子，又不失鋒銳之氣。
只是氣息太過冷漠了些。
“小手段！”
楚陽微微一笑，站起了身。
斷了的筋脈，龜裂的骨頭等等都被他修復如初。
原先的傷勢，只是被五大神源中的真血燃燒融合之後，力量太過強大而無法承載罷了，療傷自然簡單。
“這要是小手段，天下還有什麼大手段？”
端木蓉喃喃而語。