多次襲擊同仁。1937年2月，馬步芳壟斷同仁森林資源，強迫長牙昂藏民選拔700餘精壯民夫，進行採伐運輸，由於缺乏工具和技術，民夫死30多人。羣衆不堪，停工對抗。同年5月，馬步芳令馬元海前往屠殺，先後殺死羣衆數百人，並焚燒大小村莊14個，其中最大的古德村，有206戶、六七百人，被殘殺124人；馬元海將他們的頭顱割下，掛於隆務寺街頭，復迫令劫餘牧民用銀元回贖。馬元海還下令將該地大寺達日江寺放火燒燬，火光沖天，燃燒七八天之久，所存酥油熔化，從山畔直流到山下。附近的德千寺、宗弄寺、江弄尕賽寺、宗剋日寺和古德寺也都遭到洗劫。1937年9月，同仁和日只桑部落在馬步芳殘酷統治下無法生活，取得黃正清同意，擬遷移到甘南山科禾西灘放牧。事爲馬元海偵悉，電報馬步芳，馬派韓有祿率兵星夜前往，追及於甘青交界處，即行屠殺，牧民死40餘人，頭人阿日郭戰死，部落的牛1000多頭、羊2萬多隻、馬500餘匹和羊毛400餘馱以及一切物品，均被劫持。馬步芳分賜馬元海、馬步鑾、馬全義等人所有，他們就用以在大通、貴德一帶建起私人牧場。同仁的蘭採是和日乃亥族的村莊，有藏民300餘戶，由於無力交清馬步芳的捐稅，馬遂於1937年6月，派馬樸帶兵鎮壓，蘭採起而自衛，將馬樸兩個營消滅。1939年又派馬元海去鎮壓，又被擊敗。馬步芳不甘心，復於1941年9月，派馬樸、譚成祥攻擊，又遭受重大損失。馬步芳終於1942年3月派馬樸、馬生龍等將蘭採攻陷，藏民男女70多人死難；劫後餘生千餘人逃到夏河。所有田地、房屋以及牛、羊等，悉入馬步芳之手，並遷化隆、循化一帶農民於此。直至解放後，蘭採藏民才返回家園。
洗劫藏寺。藏寺是同德兩大寺院之一，因與拉卜楞來往較多，招惹馬步芳之忌，遂於1940年尋釁，限期令該寺交軍馬50匹。逾期未能交齊，馬步芳即於1941年2月派營長馬維成率部進駐該寺，勒令其寺活佛到西寧晉見馬步芳，幾經請求以管家代替，均不允准。藏寺活佛不得不反，遂用計擒殺馬維成部50餘人，押解馬維成向黃河南的拉門昂溝轉移。並奪取當地德興海倉庫約值20萬元的物資。馬步芳派馬得勝率部鎮壓，佔領該寺及其周圍帳幕，所有金銀財寶，鋼鐵器皿，洗劫一空。馬得勝又繼向拉門昂溝進逼，雙方交戰，互有死傷。第二天戰鬥更烈，藏民死難480多人，溝中屍骨堆集，鮮血凝結。100多婦孺被俘掠而去。此後，馬步芳又誘騙藏寺活佛返寺，在設宴接待中，將其毒死。藏民捐獻大批牛羊誦經超薦，又被馬步芳將這些牛羊沒收。
屠殺哈薩克人民。新疆鎮西一帶哈薩克族牧民，因反抗盛世才的鎮壓，被逼逃到甘、新、青交界，散居於青海邊境的有5800餘戶、37000餘人。1939年春，派代表晉見馬步芳，以同教關係，請求安置。馬佯爲歡迎，待哈薩克移至都蘭寺、茶卡一帶時，即以設治局名義，將哈薩克族劃分兩部，分別管理，向其派徵大量駱駝、馬匹，致使他們無以爲生，只好鋌而走險，就近劫殺蒙古牧民。如可裡溝原有蒙古族3500多人，劫後僅餘2000餘人。大牲畜由20多萬頭（只），僅剩兩萬餘頭。臺吉乃原有1800餘人，被殘殺1200餘人。大小牲畜20多萬頭，只剩60多頭。這兩旗剩餘蒙民無以爲生，遂流亡於新疆南部和河西走廊一帶。馬步芳乘機挑起蒙古族、哈薩克族之間的仇殺。發給哈薩克族一批槍支，揚言“我們都是伊斯蘭教，利害一致”。同時也發給蒙旗槍支，煽動他們起而復仇。又給汪什代亥和千卜錄等藏族發槍，讓他們進襲哈薩克族。結果三個民族互相仇殺，犧牲都很慘重。最後，蒙古族、藏族聯合，迫使哈薩克族退居於都蘭北部地區。1940年4月，馬步芳調第一百師二九八旅副旅長韓進寶，率部會同蒙古族、藏族羣衆，夾擊哈薩克族，將其繳械，俘獲爾里斯汗以下700多人，解送西寧。行至宗家烏呼圖爾，韓進寶誘姦爾里斯汗的小妻，爾里斯汗扭開鐐銬，率衆將韓進寶砍死，向西逃亡。馬步芳派韓進祿追擊，並強令藏民2500餘人組織兵團，沿青新公路搜索前進。追及於臨近西藏的堪布俄博地方，韓即將數千人全部殺死，擄回婦幼400餘人，押送西寧途中，死亡過半，其餘送工廠做勞工，又死亡不少，最後僅餘100多人。此次掠回羊兩萬餘隻、牛550頭、駱駝1000餘峰、馬300餘匹，還有許多金銀財寶，這些本是哈薩克族掠自於蒙藏人民，轉手之間，卻爲馬步芳所有。此後，劫後餘生的哈薩克族人，流落於共和縣曲乃亥、都蘭西北和柴達木的尕斯等地，但僅剩下1100多人了。
實際上，馬步芳對各個民族，並無一定的政策，軍隊也毫無紀律可言。軍行所至，燒殺搶掠，無所不爲，毫無顧忌，馬步芳亦從不追究。1941年7月3日，馬得勝到玉樹，路過河東八莊，正值年僅十餘歲的邦卜寺活佛久保，在通天河乘馬閒遊。馬得勝即以機槍隔岸射擊，久保中彈而死，僧侶4人戰慄於屍旁，亦被擊斃。馬得勝撫掌大笑，大呼：“活佛還能死嗎！”這樣任意殺人的例子，在青海不勝枚舉。所以，馬步芳集團在青海傷天害理的獸行，各族人民無不切齒痛恨。
八、興辦教育
馬步芳家族也懂得教育的作用，所以也抓緊興辦教育，以爲其統治服務。茲分述其大要。
1．普通教育
先說初等教育。1943—1945年是青海省初等教育發展最高的時期，此後就逐步下降。按1945年的統計，全省共有小學校947處，教職員2340人，學生51532人。到1949年學生即減至40540人。分縣來看，當時擁有人口222600多人的湟中縣，在校學生僅爲20600多人。省會所在的西寧市，僅有小學校8處，學生1108人。農業區的樂都、民和、互助、大通、湟源、貴德、化隆、循化、門源等9縣，共有小學校660處，學生總數46750人，教職員980人。其中學校最多的化隆縣，也只有24處，門源縣最少，僅有5處。牧業區的共和、同仁、都蘭、海晏、同德、祁連等6縣、局中，每縣、局小學僅有三五處，學生總人數爲2233人。玉樹縣只有國立玉樹小學和玉樹蒙藏兩處學校，而稱多、昂欠、興海3個縣連一處小學也沒有。以上學校是按名目統計，其中還有些有名無實。當時一般是春季始業，而採用的教材則是秋季始業的課本。而且有40％左右的學校根本買不到課本，由學生逐日手抄。教學方法，由教師決定採用複式或單式教學，且多是填鴨法，實行體罰。至於兒童接受能力如何，很少考慮，故教學效果太差，學校經費多不固定，教師工作亦無保障，使爲數甚少的小學，掙扎於風雨飄搖之中。
次說中等教育。1920年設立寧海蒙番學校，1925年，馬麒派朱繡將該校改爲寧海籌邊學校。1929年青海建省，改甘肅省立第四師範學校爲青海省立第一師範學校，此校前身爲清代的湟中書院，辦得較好，當時一般政教人員，多出身於此。又將寧海籌邊學校改爲省立第一中學，附設師範本科。1932年將省立第一模範兩級小學改爲省立第一農業中學，不久又改稱省立第一職業學校。這是當時省會西寧僅有的幾座最高學府。外縣中等學校有二：一是1931年在樂都設立的初級中學，二是1938年在貴德設立的初級中學。1938年又將省立第一師範一分爲二，分別遷往民和、化隆兩縣，均爲簡易師範，圖書、教具也兩校平分，一套《萬有文庫》，各得其半；一部《辭源》，各執上、下冊，實爲奇談。1940年，將西寧大街中心學校（即原省立第一師範址）擴充爲省立西寧師範學校。1944年，在湟源、循化兩縣各設省立中學1所，在樂都、化隆、循化、互助、湟源、民和6縣各設簡易師範1所。此後，這些學校有時合併，有時分開，有時遷徙，有時改縣立爲省立，旋又改回原隸屬關係。如此七拼八湊，分合不定，無一穩定局面，圖書教具，流散短缺，原有基礎消磨殆盡。據1945年統計，中學共5處，學生1072人。中等專業學校3處，學生351人。師範學校9處，學生1016人。其中有兩座不屬於馬家創辦的中等學校，則備受馬步芳的排擠和刁難。一是國立師範。1934年10月，國民黨中央在西寧設中央政治學校西寧分校，招收簡師一班，蒙藏初小兩班。此校屬於CC系，馬步芳既怕與己對立，又嫉妒該校設備完善，即施以重重障礙，遇有國慶、新年等各校共同活動，不通知該校參加。1938年6月，中央政治學校包頭分校遷並於該校，兩校學生對立，竟起風潮。1940年改爲國立西寧師範學校，直屬教育部。馬步芳認爲“國師一天不倒，一天不得安心”，依然採取孤立該校的態度。二是湟川中學。系庚款董事會開辦，成立於1938年8月，由王文俊任校長。馬步芳對此牴觸甚大，連電國民黨中央，請求停辦，以所撥開辦費用撥歸回民中學。時教育部長朱家驊正欲插足青海，豈肯罷休！馬步芳又取強硬手段，不撥給校址，又不供給建築用料。王文俊則以高價購得校址和建築材料，開辦高、初中各一班，附設小學，幼兒園，學生300餘，馬步芳又限制省內學生報考，王則從省外招生。馬步芳又處處爲難，1940年竟嚴令面鋪、磨戶，不準爲該校售給麪粉和進行糧食加工，以致該校師生以洋芋、牛肉當主食，延續40天之久。其後，王文俊在朱家驊支持下，兼任國民黨青海省黨務特派員，1943年又兼任三青團幹事長，提高了政治地位。1943年，該校直隸於教育部。馬步芳幾度爲該校和國立師範推薦校長，均未得教育部許可。其後，馬步芳利用亦屬於CC系的馬紹武攻擊王文俊，終於使馬繼援代王任三青團幹事長，接着，王的特派員一職也被撤換，僅任校長一職，故困難日多。馬步芳時刻盤算兩校，曾對教育廳長劉呈德說：“湟川、學師一旦拿到手，我們事情就好辦了。”但由於兩校，特別是湟川質量甚佳，在青海無與倫比，故甚負盛名。此外，教育部還在貴德設職業學校1處，後遷於湟源；又於玉樹設小學1處。馬步芳均不支持，處處給以刁難。但對於教會學校卻是另一番態度。西寧的教會學校建立較早，1891年和1910年，基督教、天主教在西寧設立教堂後，即招收少數教友學習聖經和語文。1918年成立福音小學1所，學生十幾人，1922年，命名爲西寧光華初級小學。1920年設立天主堂小學，學生10餘人，以授經文爲主，兼授醫藥，1931年學生增至120餘名，更名爲培英小學，並在公教醫院附設女子小學。此後，福音堂和天主堂在西寧、互助、樂都、湟源、大通、化隆、貴德等縣教堂內，均附設小學，男女兼收，每校學生百人左右。馬步芳對教會學校取支持態度。1937年7月，給教會學校師生每人賞發夏衣衣料1套。1946年給培英小學補助銀元200元，也給光華小學師生髮一些實物。
再說女子教育。1913年，西寧縣警佐明璋及其妻黃淑蘭創西寧縣立女子初等小學堂，1918年增設師範講習科，1920年更名爲西寧縣立女子師範學校。青海建省後，改爲省立。馬步芳對這個學校，特別給以照顧，因而人稱之爲“金女師”，1946年，馬步芳將原興文學校校址及民宅數處，撥給該校作爲新校址。時西寧明興號原股東與經理趙墨林內訌，馬步芳接受趙的賄賂銀元兩萬元，又從省會警察局抽出贓款15000元，兩項共35000元，均撥給該校作基金。不久，又設立高中、初中、簡師、師範本科、專修科、小學部、幼兒園等各種班次。馬步芳在女師挑選30多個年齡十四五歲的女生，成立海心劇團；接着又在省立西寧師範學校挑選十幾個男生，從海心劇團抽出20多個女生，另成立兒童抗戰劇團，不久又稱爲兒童劇團；繼又成立崑崙劇團。這3個劇團，均以女師爲大本營，由馬步芳直接掌握。劇團團員，供給衣食，平時專事歌舞，亦可以照常畢業或提前畢業。馬步芳經常把這些男女學生接到省府三堂跳舞唱歌，他們白天不能回校學習，甚至夜間也不能回家休息。他還經常在上五莊、甘都等地，以遊玩爲藉口，把挑選的女生，用汽車接去，十天半月不放回西寧。
2．民族教育
先說蒙古、藏族教育。1911年青海辦事大臣在西寧設立蒙古半日學堂，是青海蒙藏教育之始。馬麒於1920年改該校爲寧海蒙番學校，學生很少。1925年附設中學班，改名爲寧海籌邊學校。1929年改在省立第一中學附設一個蒙藏班。1933年，在這個班的基礎上，成立省立蒙藏師範學校，由教育部每年補助銀元24000元。每年有學生70人左右。但該校在1946年被遷往大通，改爲省立大通簡易師範學校。還有一個青海蒙藏文化促進會，成立於1933年7月，馬步芳自任理事長。次年，馬步芳利用青海南部邊區警備司令部名義，附設蒙藏學校，1937年改稱爲蒙藏中學，附設小學1所，馬步芳自兼校長，田恩雨爲副校長。通令蒙古族王公、藏族千百戶的子弟入學。蒙藏一些上層人物爲維持自己的封建地位，也派遣子弟入學。如八寶王之子俄亥仁慶、察卡王之子旺智亥、尕讓千戶之子尕桑才旦、日安千戶之子羅布仁慶等20多人，先後到校。但他們入學不久，馬步芳又把他們轉送衛士隊受訓，經過3個月的短期軍事訓練，即調爲衛士，並給以田糧處或秘書處等單位的秘書、督導員等名義，使之追隨左右，這實質上是把這些子弟作爲人質。青海蒙藏大多數王公、千百戶多年來對馬步芳比較順從，這種“人質”手段，是其原因之一。而這些子弟在馬步芳薰染下，學會了一套封建法西斯作風，成爲壓迫本民族人民的統治者。蒙藏文化促進會還在門源的八寶，湟中的羣加，化隆的扎巴、瓦昂幹、千瑞，樂都的巴藏溝、維新鄉、新衙門莊、虎狼溝、羊官寺、馬營寺、蘆花寺、張家寺，互助的甘禪寺、白馬寺等地成立蒙藏小學15所，在大通的廣慧寺成立藏民小學1所。這些學校因經費無着，不久即相繼停辦。但仍然列具名稱，每年向教育部和蒙藏委員會領取邊疆教育費和補助費，轉而充爲軍費。1943年教育部派員專程檢查，馬步芳則明令將蒙藏文化促進會遷至玉樹，而玉樹交通不便，視察人員無法前去，遂逃避了檢查。