南雲忠一的手裡有四艘航空母艦，其中有兩艘比較小的航母是飛龍號以及蒼龍號，這兩艘航母都是能夠搭載70以上架艦載機的輕型艦隊航母，雖然並不是日本海軍精銳中的精銳，但是也絕對是比較大型的艦隊航母了。
另外兩艘一艘是旗艦赤城號，另一艘是加賀號，同樣是搭載70架以上飛機的大型航母，赤城號更是能夠滿載90多架飛機，可以說是這個時代比較先進的航空母艦了。所以此時此刻，日軍在瓦胡島附近的艦隊擁有艦載飛機的數量，超過了300架。
但是這幾天的攻擊下來，南雲忠一手裡的飛機已經沒有這麼多了，他實實在在損失掉的飛機就有61架，這是他所有力量的五分之一了，如果算上故障維修的飛機以及其他原因無法起飛的飛機，他差不多有三分之一的飛機是無法參戰的了。
而且，赤城號上面搭載零式戰鬥機20架，加賀號上搭載零式戰鬥機20架，蒼龍號和飛龍號兩艘航母搭載零式戰鬥機也都是正正好好的20架，所以日本海軍能夠出動的艦載戰鬥機滿打滿算只有80架，而目前爲止，南雲忠一的這80架飛機已經有一半都被擊落了。
也就是日本海軍擁有瘋狂的武士道精神，這些飛行員又各個悍不畏死。如果換成其他海軍的話，一半的損失已經足以讓士兵崩潰了。可是這些日本海軍航空兵依舊毫不畏懼，義無反顧的執行着南雲忠一決一死戰的命令。
日本軍國主義洗腦的強悍由此可見一斑，日本軍人的可怕意志力也絕對是讓人恐懼的。他們把死亡看做是自己表達忠誠的途徑，把執行上級的命令當做自己爲國盡忠的手段。不得不承認一點，那就是至少在忽悠士兵去死這一方面，日本人走在了世界的前列，並且做到了幾乎讓人無法超越的地步。
古往今來，能損失半數兵力還敢死戰不退的部隊，都已經成爲各國永不磨滅的番號。而日本第一航空艦隊竟然在太平洋上的夏威夷島嶼附近做到了這一點，憑藉着這種可怕的精神，他們就已經算是世界上數一數二的士兵了。
但是南雲忠一知道這一次實在是不能再戰了，他的部隊如果還想要保留一絲骨血，在未來繼續爲大日本帝國作戰的話，現在說什麼也必須要撤退了。只不過看着近在咫尺又脆弱不堪的美國艦隊，南雲忠一又有那麼一絲不願意放棄的意思。
這可是決定日本命運的一戰啊，他如果連嘗試都不敢去嘗試一下，這一輩子都會爲此悔恨的。所以天旋地轉之後，他扶住了身邊的地圖桌，依舊咬着牙狠狠的發佈了攻擊的命令：“讓下一波飛機起飛！今天，我要率領大日本海軍的你們，與該死的美國佬決一死戰！不死不休！”
“天皇陛下……萬歲！”一名日本軍官高舉起自己的雙手，高聲在艦橋裡喊道。他喊完之後，更多的日本軍官還有水手舉起自己的雙手，從腿的兩側甩向天空：“天皇陛下！萬歲！”
就連南雲忠一都跟着舉起了自己的雙手，大聲的跟着喊了起來：“萬歲！萬歲！”很快，口號聲蔓延到整個赤城號航母的每一個角落裡，所有的日本士兵都在狂熱的呼喊，疲勞和沮喪在這一刻似乎都被趕走，整艘戰艦又充滿了活力。
“將軍，山本元帥來電，命令我們立刻撤退！”一名軍官拿着一封電文，走到了南雲忠一將軍的身後，他的話如同一盆冷水，瞬間就澆滅了整個艦橋裡寧願玉碎不爲瓦全的決死之心。大家都不再叫喊，而是盯着南雲忠一，空氣裡一股沉寂的詭異味道瀰漫開來，讓人窒息。
“這一定是敵人迷惑我們發出的電文！”一名軍官瞪着那份文件，惱羞成怒的嘀咕了這麼一句。
“八嘎呀路！你把這麼一份電文拿過來幹什麼？你還是不是帝國的軍人？”另一名日本軍官甚至把手按在了自己的指揮刀上，咬着牙狠狠的教訓起送電文的軍官來。
南雲忠一鐵青着臉，接過山本五十六的電文，仔細的閱讀起來，他在心中有過一絲抗命的念頭，不過同時也微微鬆了一口氣，現在不管是撤退還是決戰，這個責任都不在他的身上了，這對於一名前線指揮官來說，無疑是非常幸運的。
不過他打開電文之後，才發現這是兩份電文，第一份竟然是正在瓦胡島上的第4師團的師團長大島中將以及第131師團師團長福田中將發出的電文，上面已經明確說明，美軍在瓦胡島上的抵抗非常頑強，短時間內日軍步兵無法控制瓦胡島，更不可能像夏威夷島發起攻擊。
第二份電文則是山本五十六發出的撤退命令，這名日本的海軍元帥正確的評估出了日本海軍遭受的損失，在他看來搭上整個第一航空艦隊的精銳飛行員去拼掉美國海軍艦隊完全是白癡一樣的行爲。
“南雲忠一將軍，如果在這裡我們拼盡全力，那麼日後美軍的反擊到來之時，你的艦隊卻只能返回日本本土待命，這對於帝*人本身來說，就是對帝國命運的不負責任！我命令你立刻隨我撤退，以保留力量迎接美國即將到來的第一次反撲！”這是山本電文中最核心的一部分，非常明確的指出了南雲忠一正在浪費兵力，並非明智之舉。
美國損失一個艦隊，3個月或者半年之後，差不多就還能補充這麼一個艦隊，可是如果日本損失200名飛行員，那麼半年內能補充上來的飛行員，最多也就只有150人。這就是山本五十六不願意和美國拼消耗的原因，他不敢消耗，因爲日本消耗不起。
山本的計劃非常簡單，他的海軍艦隊需要休整，等到補充和休整完畢之後，他的艦隊可以恢復作戰能力，這個時候又沒有了瓦胡島這個固定點的羈絆，他可以在大洋上選擇一個有利的位置尋求決戰，更容易的擊垮美國艦隊。
當然他也知道，現在一旦撤軍，那麼美國也就算徹底緩過氣來，那麼逼迫美國短期內投降的計劃，也就變得更加困難氣來。不過日本海軍現在必須要休整了，這是他覺得必須要做的事情，沒有辦法省略。
至於戰略的主動權易手，他也不是沒有考量過，在山本五十六看來，現在日本的進攻已經顯露出疲軟的態勢來，強撐着表演給美國看有沒有效果，實在是難以預料的事情，爲這麼一個不一定奏效的欺騙來搭上整個第一航空艦隊，是不值得的事情。
於是他在得到大島還有福田兩名陸軍將領的電報之後，立刻下達了撤退的命令，山本五十六希望這4萬名陸軍士兵可以在瓦胡島和可愛島上堅持4個月，那個時候他將帶領着精銳的日本聯合艦隊再殺回來，一舉殲滅附近的美國海軍。
山本的盤算非常簡單，那就是用幾個月的被動去爭取一次先手，再上演一次類似威克島之戰時候的海上殲滅戰，將美國人的艦隊再一次殲滅，那個時候再來討論是戰是和的問題。
“給山本元帥回電！跟他說，南雲忠一決心拼死一戰！”南雲忠一想了想之後，在所有人期待的目光下咬着牙說出了自己的決定：“大日本帝國的軍人，還沒有逃走的傳統！我南雲不是懦夫！我的手下也不是懦夫！”
“將軍！”有一名電報室的軍官走了進來，把一份電報遞給了南雲忠一：“山本元帥來電，說……”
“說什麼？”南雲一把搶過了那份電文，因爲速度過快，甚至撕扯掉了一個小小的角落。他仔細的看清上面的文字，竟然是山本本人的口氣：“如果你不服從我的命令，我將和長門號戰列艦趕往你的艦隊，並且親自接手你的指揮權！”
南雲面無表情的看完了這份電文，最終還是開口說道：“命令艦隊向南轉向，脫離交戰海域！”
“將軍！”一個主戰派的軍官上前一步，想要勸說南雲改變自己的主意。
南雲伸出自己的手來打斷了他的話：“好了！不要再說了！山本元帥的命令是對的！我們這麼苦戰下去，會誤了元帥的大事！他有自己的計劃，我們遵守就是了！”
上午11時12分，日本第一航空艦隊的戰艦開始轉向，同時美國有一批戰機趕到，趁亂擊傷了日軍的飛龍號航母，造成了日軍地勤和水手2人死亡32人受傷。不過在中午之前，日本海軍就脫離了與美國海軍的接觸，在可愛島以西洋麪上重新集結。
夏威夷海戰就這樣以虎頭蛇尾的樣子結束，美國海軍奪回了太平洋中部地區的海上主動權，太平洋戰場在被日本統治了將近4個月之後，進入到了戰略相持階段。