初平三年四月，正逢天子大病初癒。朝廷百官在未央宮集合，恭祝天子龍體安康。
事前，呂布派同郡騎都尉李肅等人，帶領十多名心腹親兵。讓他們穿上宮廷侍衛的服裝，潛伏在宮殿側門兩邊。
董卓出現在側門外時，立即遭到李肅等人的突然襲擊。董卓急呼呂布，呂布手捧聖旨，大呼：“奉旨殺賊！”
隨後，董卓被呂布所殺，並且誅連三族。
長安城，李府。李儒這兩日，總是感到心緒不安，每日亦是有些昏昏沉沉。
忽然之間，他聽到了門外的喧譁之聲，頓時臉色一變。
李儒的一個家僕，跌跌撞撞的跑了進來，臉上帶着驚慌的神色。他對李儒喊道：“主人，呂布聯合王允反叛，已經殺掉了太師。”
“現如今，李肅又帶着兵丁前來李府，要抓走主人啊。”
李儒聞言，先是一愣，而後嘆息一聲：“我早知會有今日，卻不想這一天來的如此之快。”
話畢，他整理了一下衣着，對那個家奴說道：“某之頭顱在此，你可以將其取走，拿到呂布那裡請功。”
那個家奴聞言，駭得面無人色，急忙跪在地上，說道：“主人待我恩重如山，我又豈能做出如此事來？”
“還請主人喬裝打扮一番，我這就率領家中的奴僕，爲主公斷後。”
李儒聽到家奴的話，欣慰的笑了起來，他說道：“這樣的話，咱們誰都活不了，你還是拿着我的腦袋，獻給呂布吧！”
長安城中，亂成了一鍋粥。
這次誅殺了董卓，李肅心中感到十分興奮。當初他投奔董卓，說降呂布，本來以爲是件大功，能夠得到董卓的重用。
卻沒想到，之後的董卓，並沒有重用他，這不僅使得李肅一直鬱鬱不平。
“這次幫奉先殺掉董卓，爲國除賊，我一定能夠聞名天下。若是再抓到李儒，必定又是大功一件。”
想到了以前高高在上的李儒，將會被他狠狠踩在地上。李肅的臉上，就忍不住露出了猙獰的笑容。
“將軍，前面就是李府！”
一個士卒來到李肅面前，向他彙報。李肅揮了揮手，說道：“你等將李府團團圍住，休要放走了一人！”
衆軍士聽令，頓時將李府圍得水泄不通。
“哐當！”
李肅一腳踹開了李府的大門，帶着一些士卒衝了進去。他正要讓衆人散開捉拿李儒，卻發現有人提着一個血淋淋的腦袋，向他走了過來。
來人正是方纔李儒身旁的那個家奴，他跪到李肅面前，說道：“將軍，李儒這廝助紂爲虐，方纔還想着逃走。”
“好在小人眼尖手快，這才一刀結果了那廝的性命。”
“還請將軍念在小人識相的份上，放過府中的傭人，他們都是無辜的。”
李肅接過李儒的腦袋，細細打量了一陣。雖說死者的臉龐顯得非常猙獰，但是依稀之間，仍舊能夠看到李儒的模樣。
既然李儒已死，李肅的任務自然就已經完成。
他揮了揮手，說道：“就依你所言，除了李儒的親人，其他人我就饒了他們的性命。”
而後，李肅猛然拔出腰中的佩劍，將那個家奴的腦袋砍了下來。
那個家奴絲毫沒有防備，被殺死的時候，眼睛仍舊睜得很大，一臉的不可思議。
李肅將劍上的鮮血，在那個家奴身上擦了幾下，不屑的說道：“其他人我可以放過，但是像你這種賣主求榮之輩，卻沒必要活在這個世上。”
話畢，他對着身後的士卒高聲喝道：“誅殺李儒家眷，拿走他家中的財物。至於其他的人，就放他們一條生路！”
一時間，整個李府之中，李儒的家眷被誅殺一空。
誅殺掉了長安城所有的董卓黨羽，王允爲了撇清與董卓的關係，辭掉了董卓封給他的所有職務。並且將溫侯的爵位，封給了呂布。
他自己卻是領着錄尚書事的職位，總攬朝政大權。
錄尚書事是漢昭帝時期設立，當時大將軍霍光柄政，與金日磾、上官桀共領尚書事。歷史上三國時期，蜀丞相諸葛亮，也曾擔任錄尚書事的職務。
由此可見，錄尚書事的職位，是何等的顯赫。可以說，王允現在的職位，哪怕比起當初獨斷朝綱的董卓，亦是不逞多讓。
大權在握，以及百姓、士人們的稱讚，使得王允不禁有些飄飄然。
以前王允爲了圖謀董卓，所以不管面對何人，總是一副折節下交的態度。但是現在，每逢在別人面前，他總是擺着架子，板着一張臉。
下面的人稍微有些不如他的心意，他也不會像以前那樣，好言撫慰，反而肆意責罰。
與他人議事，他甚至連做下樣子都不願意，一直都是正襟危坐，面無和悅之色。慢慢的，所有人都開始疏遠王允，並不像以前那麼親善他。
就連獻帝劉協，心中亦是懼怕不已，深怕王允成爲第二個董卓。
王允的行事，越發飛揚跋扈。以前就連董卓，都不敢擅殺那些德高望重之輩。但是王允，卻因爲蔡邕的一句話，就將他斬殺。
當時蔡邕與王允對坐，談到董卓被殺之事。想到了董卓對他的器重與尊敬，嘆息了幾聲，臉上有不忍的神色。
王允見狀，頓時勃然大怒，斥責蔡邕道：“董卓國之大賊，幾傾漢室。君爲王臣，所宜同忿，而懷其私遇，以忘大節！今天誅有罪，而反相傷痛，豈不共爲逆哉？”
王允隨即將蔡邕收付廷尉治罪，想要殺他。
蔡邕乃當世大儒，滿腹才華，在士林之中非常有名望。就連董卓這個出身西涼的武夫，都對他敬重有加，更何況是其他士人？
蔡邕雖然不怕死，但他當時正在撰寫《後漢書》，不想半途而廢。所以就遞上辭表道歉，請求受到刻額染墨、截斷雙腳的刑罰，以求繼續完成漢史。
卻不想，王允斷然拒絕了蔡邕的請求。
太尉馬日磾對王允說：“伯喈曠世逸才，多識漢事，當續成後史，爲一代大典。且忠孝素著，而所坐無名，誅之無乃失人望乎？”
王允答道：“昔武帝不殺司馬遷，使作謗書，流於後世。方今國祚中衰，神器不固，不可令佞臣執筆在幼主左右。既無益聖德，復使吾黨蒙其訕議。”
馬日磾退去，而告知衆人曰：王允必不能長久於世。有道德的人，是國家的綱紀；寫書，是國家的典籍。廢棄了綱紀與典籍，他難道還能長久嗎？”
依照蔡邕的所作所爲，完全符合漢代士大夫的道德觀念。董卓雖然令人厭惡，卻對蔡邕有着知遇之恩。
若是董卓身死，蔡邕拍手稱快，那纔會讓人瞧不起。
一代大儒，就這樣死在獄中。他死的那日，滿朝公卿，以及長安士子，全都痛哭流涕，爲蔡邕鳴不平。
王允見狀，感受到了巨大的壓力，追悔莫及。
除此之外，王允在商議是否赦免董卓部曲的問題上，反覆無常。
當時呂布就勸他說；“此輩無罪，從其主耳。今若名爲惡逆而特赦之，適足使其自疑，非所以安之之道也。”
呂布又想以董卓的財物，賞賜給滿朝公卿、將校，好得到他們的支持。但是王允，卻是不從。
而且，王允認爲呂布是一介武夫，心裡非常瞧不起他。常把呂布，當成家中蓄養的劍客。
呂布卻認爲，這次能夠誅殺董卓，他佔據了首功，所以常常自誇自擂。王允與呂布之間有了矛盾，自然開始貌合神離。
四月，是個多事之秋。
在王允誅殺董卓的時候，公孫瓚聯合劉備、陶謙、單經。讓劉備屯高唐，單經屯平原，陶謙屯發乾，準備攻打袁紹。
結果，袁紹與曹操聯合，大破公孫瓚幾人。從此之後，陶謙對曹操懷恨在心。再加上曹操新得兗州，對徐州虎視眈眈，使得陶謙坐立不安。
董卓被殺時，他的女婿牛輔屯兵於陝地。呂布派李肅前去征討牛輔，被牛輔擊敗。呂布心中大怒，就斬殺了李肅。
卻不料，由於董卓的身死，牛輔營中軍心大亂，不少士兵半夜背叛出逃，造成內亂。
牛輔以爲整營皆叛，於是帶着金銀珠寶，獨與親信胡赤兒等五六人出逃。胡赤兒等人謀財害命，於途中將其斬首送往長安。
呂布卻惱怒胡赤兒賣主求榮，將他斬首示衆。牛輔這一路的叛軍，就這樣被平定了。
五月，李傕、郭汜，以及董卓一些以前的部曲，見董卓身亡，就向朝廷上表請降，希望朝廷能夠赦免他們的罪過。
王允卻是執意要殺掉他們，幾人就在賈詡的建議下，散播謠言，說王允要斬殺所有的涼州軍。涼州軍聞言，頓時人心惶惶。
李傕等人，趁機鼓動衆人反叛，帶兵圍困長安。
初平三年六月，呂布軍中叛徒引李傕、郭汜入城，呂布率數百騎衝出長安，王允身死。
李傕等人攻陷長安，俘獲天子。
他們威逼當朝皇帝，加封李傕爲車騎將軍、開府、領司隸校尉、假節、池陽侯；郭汜爲後將軍、美陽。
樊稠爲右將軍、萬年侯；張濟被封爲鎮東將軍、平陽侯，外出屯駐在弘農。又以賈詡爲左馮翊。
自此以後，李傕、郭汜把持朝政，欺凌幼帝。他們的所作所爲，絲毫不下於當時的董卓。
大漢再次經此浩劫，漢室越加威嚴掃地。