在沈有容的安排之下，西班牙和荷蘭艦隊在雅加達的外海遇到了一起，荷蘭人來就是爲了奪回被西班牙人搶走的印尼，西班牙人則是來奪回被明朝奪取的菲律賓，可是在沈有容的安排下，西班牙人覺得遭到了荷蘭人的突然襲擊，而荷蘭人則感覺西班牙在自己的印尼殖民地搞事，兩國現在的艦隊都在雅加達在沈有容的安排下相遇了。沈有容安排大明水師對兩國的艦隊進行大範圍迂迴，留下足夠的空間給兩國艦隊單挑，而沈有容的大明水師則是要做最後面的黃雀！
這場三國艦隊的大會戰是從爪哇外海開始的，近七百條戰船，七百條沒有一顆炮彈的西班牙戰船！這批戰船將自己的炮彈交給另外的七百艘西班牙戰艦抵擋荷蘭人，而這支七百艘的艦隊則是西班牙的骨幹，相乘機會從爪窪島撤出去，可是早有安排的沈萬榮並沒有讓西班牙人得意，以一艘寶船爲主的百餘艘戰艦已經等候多時了，西班牙的艦隊出現的時候，明軍的艦隊馬上就壓了上去，黑洞洞的炮口就瞄向了西班牙的艦隊。西班牙的艦隊司令見到明軍艦隊，馬上派人進行聯絡，因爲這位司令認爲剛剛和大明朝簽訂了合約，應該是會放自己離開的。
結果溝通之後，西班牙艦隊司令鬱悶的要死，因爲明朝艦隊聲聲稱自己並沒有接到西班牙和大明朝簽訂合約的通知，只接到任何不允許任何船隻離開爪哇海，如有違令者，將予以擊沉！不過鑑於對方是西班牙艦隊，可以另行處置，就是請西班牙艦隊在大明艦隊的監督下先在民都洛爾島停靠，待請示大明艦隊沈有容大帥之後，再行離開！西班牙艦隊司令知道自己的情況，根本就沒有資格和人家談條件，至少這樣可以先躲開後面的荷蘭艦隊！沒有考慮多少時間之後，這七百艘戰艦被明軍戰艦被押解至民都洛爾島。
到了民都洛爾，明軍立刻請西班牙海軍官兵上岸休息，非常的客氣，使得西班牙人感覺明朝人還是很看重兩國的合約的，便安心等待明朝人的放行！到了民都洛爾島的西班牙海軍沒有想到的是，當他們一上岸，就被明軍包圍了，一個明軍將領通知西班牙人，經過詢問，大明朝並沒有和西班牙籤訂合約，根據大明水師大帥沈有容的命令，將西班牙戰船全部沒收，西班牙海軍官兵則全部予以消滅！頓時西班牙艦隊司令就傻眼了，沒想到自己作爲一代海上強國的司令走到那裡都是說一不二的，到了大明朝這裡居然說了等於沒說，大明朝竟然和自己一樣沒有把對方放在眼裡。明軍的士兵沒有給他太多的時間，半個小時的槍炮聲之後，兩萬多西班牙海軍士兵被明軍殺了個精光！
明軍幹掉了這一批西班牙戰船的時候，在雅加達，龐大的荷蘭艦隊和西班牙艦隊已經大戰了數個小時，荷蘭艦隊仗着自己實力遠超對方，開始進行了不間斷的衝鋒，並且用大批的戰船考到前面，用排炮對射和西班牙人拼消耗，這個時候，西班牙戰艦已經是強弩之末了，荷蘭人一副痛打落水狗的架勢，用幾艘戰艦輪番攻擊一艘西班牙戰艦，西班牙戰艦左支右擋，但終歸是實力相差太遠，被擊敗也只是時間問題。
沈有容在戰場外圍，緊緊關注着戰場上的變化，看見荷蘭艦隊已經是勝利在望了，便下達命令，半個時辰之後開始進攻荷蘭艦隊！沈有容下達命令之後，西班牙的戰船隻剩下不到五十艘戰艦了，荷蘭人步步緊逼，西班牙戰船在迅速減少，到了半個小時之後，西班牙艦隊的剩下的幾條戰艦從荷蘭人的包圍攻擊中衝了出來，開始向外海逃逸。荷蘭人馬上派出一部分戰船開始追擊，可是逃逸的西班牙戰船突然發現前方出現了大批的戰艦，是明朝的戰艦，大喜過望，希望明朝人看在兩國簽訂了合約的份上，應該會幫自己一把，所以用最快的速度向大明船隻靠了過去。西班牙艦船靠上來之後，明軍戰艦的炮兵校尉們一聲令下，幾百發炮彈向西班牙戰船飛去，絲毫沒有準備的西班牙戰船被打了個措手不及，一下子被打得騰起了烈火，爆炸聲不斷。後面追趕的荷蘭戰船見到明軍戰艦出現，並且擊沉了逃跑的西班牙戰艦，頓時歡呼起來，荷蘭艦隊已經開始慶祝勝利了！
沈有容站在船頭之上，看着遠處的荷蘭艦隊開始排兵佈陣：三艘寶船爲首的主要衝擊編隊用於第一章一輪衝鋒，五百艘主力戰艦則編成火力編隊編隊，另外五百艘和重量衆多的放火船則在兩翼進行迂迴阻截和騷擾，最高作戰原則不是在洋麪上消滅對方，而是將其逼入馬六甲海峽，充分利用戰彪利用的岸炮對其進行殲滅。做出這樣的計劃是因爲荷蘭艦隊還有相當強大的戰鬥力，如果單純用水師來消滅的話，那必定將付出一定的代價，只有充分利用岸炮火力才能以最小的代價達成最大的戰果。
明軍在寶船的帶頭下，開動了蒸氣動力以最快的速度衝了過去，這個時候還不知道怎麼回事的荷蘭人還在嚮明軍艦隊揮手致意，對明軍幫助擊沉西班牙戰船表示感謝！“準備開炮！”明軍戰艦此時已經將炮彈入膛，並瞄準了荷蘭軍艦！“開炮！”看到荷蘭人的軍艦已經到了射程之內，明軍開炮了！“轟！”一聲巨響之後，爲首的一艘荷蘭船被炸起了沖天大火。
緊接着明軍戰艦紛紛開炮，不多時，明軍的炮火已經連成了一片，瞬間荷蘭戰艦被擊沉擊傷數十艘！“這是怎麼回事？”荷蘭艦隊司令喊道“還擊！快還擊！”遭到突然打擊的荷蘭艦隊匆忙還擊，但明軍已經搶的先機，在雙方實力相差無幾的時候，失去先機是很被動的！荷蘭人在遭到打擊的時候才明白過來，雖然不知道爲什麼，但明軍肯定已經開戰了，而且兩翼和中間的艦隊也都已經展開了，而荷蘭人的艦隊卻因爲剛剛和西班牙人大戰一場，隊形散亂，有相當一部分艦隻被隔在隊形之外，岌岌可危，明軍已經快將這些戰船包圍了！“命令全軍集中，命令全軍集中！”荷蘭軍司令大喊道，荷蘭戰船在接到集中信號之後，馬上向中間集中！沈有容看到對方戰艦正在集中，集忙下令三艘寶船分三個方向，乘扇形發動衝擊，衝散荷軍，其他的戰船則盡力擊毀那些荷軍陣形外的荷軍戰艦！在寶船的衝擊下，正在試圖集結的荷蘭戰艦大亂，不是被寶船撞沉，就是被密集的寶船火力擊沉。有的荷蘭戰艦見寶船體大炮猛，不好對付，便只攻擊旁邊的明軍主力艦，並盡力拖住那些主力艦，好讓其他的已經集結了一定數量的荷蘭戰船去圍攻寶船，那些其他的荷蘭集結好或三艘或五艘的艦羣開始圍攻寶船。沈有容見那艘寶船被圍的險象環生，馬上命令自己的旗艦前去支援。很快沈有容的寶船和一批主力艦前來支援，兩艘寶船聚在一起火力大增，圍攻寶船的荷蘭戰船頓時被打的狼狽不堪，在外圍另一艘寶船的配合下，在沒有多長的時間裡，明軍艦隊幹掉了荷蘭主力編隊以外散落的荷蘭戰艦！幹掉那些散亂的荷軍戰艦之後，沈有容發現依然有爲數不少的荷蘭戰艦乘剛纔寶船被圍攻的時候乘亂逃回了荷蘭的主力編隊，也因爲剛纔寶船被圍攻使進攻陣形削弱，使荷蘭艦隊重新組成了隊形，看着數量巨大的荷蘭艦隊，排出了進攻的隊形，沈有容也排出了自己的隊形，雙方開始了新一輪的對戰！
荷蘭艦隊司令在目睹了明軍寶船的威力之後，明白這幾艘寶船絕對是明軍的主力，所以在進攻陣型上作出了針對明軍寶船的佈置：由四百艘戰艦組成突擊羣，在明軍正面針對寶船的兩翼進行突破，用四百艘船單獨進攻寶船，其他的戰艦則去進攻和穿插其他的明軍戰艦，盡全力拖住明軍的主力艦，使其不能增援寶船，以方便拿四百艘戰艦殲滅寶船！沈有容看着對方的戰艦，做出了自己的安排：以寶船爲中心，排出三個大型的艦隊方陣，從三面向荷蘭人壓過去，方陣爲正方形，寶船爲方陣的中心，四周的戰艦用船牆的方式向荷蘭人壓過去，寶船作爲方陣的中心要隨時向方陣的不足之處進行支援，火船跟在主力戰艦的後方，也就是方陣的內層，對突破方陣的荷蘭戰艦進行攻擊，明軍的進攻目標很簡單，就是要將荷蘭人的艦隊壓向戰彪的馬六甲海峽，在哪裡予以荷蘭艦隊以殲滅!雙方排好陣型之後，開始了一場大戰！