“你光是爲了防風，完全可以像你韋家莊裡面那樣，多修防風林便可以了吧？”吳三輔像是看穿了韋寶的心思，“你這是爲了將韋家莊與外界隔開，爲了割地稱雄！修建這麼高大堅實的城牆，十萬大軍都打不進來。”
韋寶一汗，雖然他知道，自己修築城牆，一定會給人這種感覺，這不是什麼能隱瞞的心態，但吳三輔是第一個當他的面這麼說出來的，韋家莊之外的人。
吳三輔和吳雪霞饒有興致的看着韋寶，等待韋寶回答，想看看巧舌如簧，善於辯論的韋寶會說出哪些藉口。
韋寶卻只道：“與外界隔開是真，割地稱雄是沒有的。若要割地稱雄，遼西絕不是什麼好地方，大漠，朝鮮，都比遼西好，再不然，關外也行。關內有大明重兵駐防，我這麼點人，稱雄什麼呀？三輔大哥，你這話過重了，我當不起。”
“這有什麼啊？遼西遼東哪個世家大戶不想稱雄一方？稱雄又不是造反。”吳三輔不以爲意的笑道：“只是沒有人會花費這麼大的財力物力人力修築城池。要麼是沒有這麼大的財力，要麼就是沒有這個耐心，你這城牆打算修多高？”
“三丈以內。”韋寶答道。
“那你怕是還要修築五六年吧？別等你城牆沒有修好，先給旁人做了嫁衣。”吳三輔笑道：“不過，你現在不用擔心了，有我吳家在，沒有人敢再打你韋家莊的主意。”
“那就多謝三輔大哥了。”韋寶淡然道。
“你該多謝雪霞纔是。”吳三輔呵呵一笑。
韋寶看向吳雪霞，吳雪霞正在看車外風光，聽吳三輔提起自己，粉臉一紅，嗔道：“哥，說話就說話，老是說到我身上幹什麼？韋公子謝我什麼？”
“小寶要是成了咱們家的女婿，還有誰敢打韋家莊的主意？這不是應該謝你嗎？”吳三輔笑道。
吳三輔的話，說的韋寶和吳雪霞同時臉發燙。
韋寶以爲吳雪霞會反駁的，吳雪霞卻並沒有。
這讓韋寶心中暗喜，女人不怕多，男人大抵如此，尤其是美女。
像吳雪霞這種傾國傾城，美貌絕世的女孩，更是什麼年齡段的男子都能被秒殺，韋寶也不例外。
韋寶一行人快到山海關的時候，山海關的大佬們也在各自忙碌。
這幾天，他們開了好幾次軍事會議，主要因爲思想不統一。
仍然是老問題，主戰主守，似乎從建奴十幾年前開始猖獗，從薩爾滸之戰後，這個問題一直困擾明軍，困擾邊軍。
這幾年大明與建奴的主要戰事主要集中在兩次，一次薩爾滸之戰，一次王化貞和熊廷弼。
大明倒閉的禍根是從萬曆中後期開始種下的，而這兩次戰役慘敗，更是直接將大明的東北軍務拖入了雪上加霜的境地。
1618年（萬曆四十六年，後金天命三年）正月，後金努爾哈赤趁明朝朝廷黨爭激烈、防務鬆弛的時機，決意對明用兵。農曆二月，努爾哈赤召集諸臣討論用兵方略，決定先打遼東明軍，後並葉赫部，最後奪取遼東。農曆三月間，後金加緊秣馬厲兵，擴充軍隊，修治裝具，派遣間諜，收買明將，刺探明軍虛實。在經過認真準備和精心籌劃之後，努爾哈赤在農曆四月十三日以“七大恨”誓師反明，歷數明朝對後金國（建州女真）的七大罪狀，率步騎2萬嚮明朝發起進攻。
撫順城以東諸堡，大都爲後金軍所攻佔。後金軍襲佔撫順、清河後，曾打算進攻瀋陽、遼陽，但因力量不足，翼側受到葉赫部的威脅，同時探知明王朝已決定增援遼東，便於九月主動撤退。
撫順等地接連失陷，讓明神宗感到事態嚴重，派兵部左侍郎楊鎬爲遼東經略，主持遼東防務。並決定出兵遼東，大舉進攻後金。
但由於缺兵缺餉，不能立即行動，遂加派餉銀200萬兩，並從川、甘、浙、閩等省抽調兵力，增援遼東，又通知朝鮮、葉赫出兵策應。
經過半年多的準備，援軍雖大部到達瀋陽地區，但糧餉未備，士卒逃亡，將帥互相掣肘。
1619年（明萬曆四十七年，後金天命四年）正月，努爾哈赤又親率大軍進攻葉赫部，得到二十多個寨子。聽說有明朝的軍隊來了，這纔回去。
明朝的楊鎬派遣使者去後金商議罷兵，努爾哈赤回覆書信拒絕。
1619年（明萬曆四十七年，後金天命四年）二月，明抵達遼東的援軍約87000餘人，加上葉赫兵一部、朝鮮軍隊13000人，共約11萬，號稱20萬。
由於明朝朝廷財政緊張，無力長期供養遼東集結明軍作戰部隊，明神宗一再催促楊鎬發起進攻。於是楊鎬坐鎮瀋陽，命兵分四路圍剿後金。
總兵馬林率1萬5千人，出開原，經三岔兒堡，入渾河上游地區，從北面進攻；總兵杜鬆率兵約3萬人的主力部隊擔任主攻，由瀋陽出撫順關入蘇子河谷，由西面進攻；總兵李如柏率兵2萬5千人，由西南面進攻；總兵劉綎率兵1萬餘人，會合朝鮮軍共2萬餘人，經寬甸沿董家江北上，由南面進攻。
另外，總兵祁秉忠，遼東將領張承基、柴國柱等部駐守遼陽，作爲機動增援部隊；總兵李光榮率兵一部駐廣寧，保障後方交通。副總兵竇承武駐前屯監視蒙古各部；以管屯都司王紹勳總管運輸糧草輜重。
楊鎬本人則坐鎮瀋陽，居中指揮。
時楊鎬奏上“擒奴賞格”經兵部尚書黃嘉善復奏，明神宗批准，頒示天下。
賞格規定：擒斬努爾哈赤者賞銀10000兩，升都指揮使；擒斬其八大貝勒者賞銀2000兩，升指揮使；李永芳、佟養性等叛將，若能俘獻努爾哈赤，可以免死。又詔令葉赫貝勒金臺石、布揚古若能擒斬努爾哈赤，將給與建州敕書並封龍虎將軍、散階正二品。若擒斬其餘努爾哈赤的十二親屬伯叔弟侄，及其中軍、前鋒、領兵大頭目、親信領兵中外用事小頭目等，一律重賞並且封授世職。
原擬1619年（明萬曆四十七年，後金天命四年）農曆二月二十一日出邊進擊，但因天降大雪，改爲同月二十五日。同時，限令明軍四路兵馬於農歷三月初二會攻赫圖阿拉。
後金方面努爾哈赤在攻破撫順、清河之後，鑑於同明軍交戰路途遙遠，需要在與明遼東都司交界處設一前進基地，以備牧馬歇兵，於是在吉林崖築城屯兵，加強防禦設施，派兵守衛，以扼制明軍西來之路。
四路明軍出動之前，作戰企圖即爲後金偵知。
努爾哈赤探知明軍行動後，認爲明軍南北二路道路險阻，路途遙遠，不能即至，宜先敗其中路之兵，於是決定採取“憑你幾路來，我只一路去”的集中兵力、逐路擊破的作戰方針，將6萬兵力集結於都城附近，準備迎戰。
1619年（明萬曆四十七年，後金天命四年）農曆二月二十九日，後金軍發現明朝劉綎軍先頭部隊自寬甸北上，杜鬆率領明軍主力已出撫順關東進，但進展過速，孤立突出。
努爾哈赤接到奏報以後，決定以原在赫圖阿拉南駐防的500兵馬遲滯劉綎，乘其他幾路明軍進展遲緩之機，集中八旗兵力，迎擊杜鬆軍。
努爾哈赤說：“大明軍隊確實來攻打我們了，我們南方已有駐兵五百人，就用這些軍隊抵禦南方的敵軍吧。這是明軍聲東擊西的戰術，他們故意讓南方的軍隊先讓我們知道，這是要引誘我們的軍隊開向南方，他們的主力大軍一定會從西邊撫順關的方向來進攻的。我們要先打他從西邊來的軍隊。”
努爾哈赤命令諸王貝勒和大臣領城中兵出發向西迎敵。
軍隊正行進的時候，哨探又來向努爾哈赤報告說：“東南方向從清河城那條路上又有明軍隊兵來了。”
努爾哈赤說：“清河城方向這一路雖然有軍隊，但這條路地形狹隘險峻，他們不可能很快趕到，就讓他們自己來吧，我們先到撫順關迎擊西面的敵軍。”
1619年（明萬曆四十七年，後金天命四年）三月初一，杜鬆軍突出冒進，已進至薩爾滸，分兵爲二，以主力駐薩爾滸附近，自率萬人進攻吉林崖。
努爾哈赤看到杜鬆軍孤軍深入，兵力分散，一面派兵增援吉林崖，一面親率六旗兵4萬5千人進攻薩爾滸的杜鬆軍。
次日，兩軍交戰，將過中午，天色陰晦，咫尺難辨，杜鬆軍點燃火炬照明以便進行炮擊，後金軍利用杜鬆軍點燃的火炬，由暗擊明，集矢而射，殺傷甚衆。
此時，努爾哈赤乘着大霧，越過塹壕，拔掉柵寨，攻佔杜軍營壘，杜軍主力被擊潰，傷亡甚衆。
後金駐吉林崖的守軍在援軍的配合下，也打敗了進攻之敵，明軍西路軍主將總兵杜鬆、保定總兵王宣、原任總兵趙夢麟，都在戰鬥中陣亡。明西路軍全軍覆沒。
明軍主力被殲後，南北兩路明軍形孤勢單，處境不利。
1619年（明萬曆四十七年，後金天命四年）三月初一的夜裡，明朝北路軍由馬林率領進至尚間崖（在薩爾滸東北），得知杜鬆軍戰敗，不敢前進，將軍隊分駐三處就地防禦。
馬林爲保存實力，環營挖掘三層塹壕，將火器部隊列於壕外，騎兵繼後。又命部將潘宗顏、龔念遂各率萬人，分屯大營數裡之外，以成犄角之勢，並環列戰車以阻擋敵騎兵馳突。
努爾哈赤在殲滅杜鬆軍後，即將八旗主力轉鋒北上，去尚間崖方向迎擊馬林軍。
1619年（明萬曆四十七年，後金天命四年）三月初二早晨，馬林軍隊剛要撥起紮營的器物準備向南進軍，發現努爾哈赤率領的軍隊到了，就率軍隊重回宿營地重新紮營佈列戰陣，陣列方形，營地四面昨夜挖有三道壕溝，壕溝外排列大炮，放炮的兵皆徒步站立炮後，大炮的外層，又密密排列一層騎兵，騎兵的前面再排列火槍隊，其餘衆兵都下馬，進入三層壕內的營中列陣。
後金軍先派一部騎兵橫衝明將龔念遂營陣，接着以步兵正面衝擊，攻破明軍車陣，擊敗龔軍。到中午12點的時候，努爾哈赤趕到了馬林所扎大營的地方。
馬林營地的東邊有一山。
努爾哈赤說：“我們的士兵應當先佔東邊山上的高地，從山上居高臨下的向西方山下的馬林軍的軍營衝擊，我們就能把馬林的軍隊打敗”。
於是努爾哈赤率親衛軍及二旗衆兵全體離營向東，來到東山南坡山腳下，準備從南坡登山。
這時馬林與後金軍對峙一上午後，見後金的援兵已到，在帥旗下聚集起來的兵加起來也不過二旗再加四五千人，他認爲後金的兵總數也就這些了，加上後金兵離營移軍向東，隊不成列，於是馬林決定主動出擊決戰，他命令營內士兵出營與營外的騎兵和火槍隊匯合，大軍主動向位於明營東邊的後金軍隊發起攻擊。
努爾哈赤在山上向西看，見大明營內軍兵與營外壕外的軍兵匯合，努爾哈赤就說：“這樣子是明軍要來主動攻擊我們了，不用登山了，可以下馬跟他們徒步作戰。”
代善就從山的左側，也就是南坡下山到山腳下，命令他的二旗士兵下馬準備步戰。下馬的人才四五十個人，大明軍隊就從西面來攻上來了。
代善對努爾哈赤說：“我應當領兵前進。”隨即策馬迎敵，直殺入明軍的隊伍中。隨後諸貝勒與各位率兵的臺吉等分別投入殺明兵，兩軍混戰，明軍敗退，進攻的明軍被殺大半。
這時，追殺龔念遂部逃兵的六旗兵戰鬥結束，急急忙忙趕來了，看到兩軍正戰，這六旗兵先到的不等後面軍隊到來，也來不急整頓隊伍，直接攻擊明軍馬林的大營。馬林軍營中士兵放槍接戰。滿州兵射箭衝擊，在東面和南面兩路夾攻之下，大明軍隊抵擋不住進攻勢頭，大敗而逃，滿州軍兵乘勢追殺，擊破潘宗顏部，北路明軍大部被殲。明軍副將麻巖等皆被殺，總兵馬林僅自己率數人逃走。
明朝劉綎所率的東路軍因山路崎嶇，行動困難，未能按期進至赫圖阿拉。
因不知西路、北路已經失利，仍按原定計劃向北開進。努爾哈赤擊敗馬林軍後，立即移兵，迎擊劉軍。
1619年（明萬曆四十七年，後金天命四年）三月初三，爲全殲劉軍，努爾哈赤採取誘其速進，設伏聚殲的打法，事先以主力在阿布達裡崗（赫圖阿拉南）佈置埋伏，另以少數士兵冒充明軍，穿着明軍衣甲，打着明軍旗號，持着杜鬆令箭，詐稱杜鬆軍已迫近赫圖阿拉，要劉綎速進。
劉綎信以爲真，立即下令輕裝急進。
三月初四，明軍東路劉鋌軍從寬奠出發時，後金東邊的人都躲避到深山老林中去了。
劉鋌率軍一路上攻佔山寨，將瘸子、瞎子等不能動的人殺死，一路向前進軍。劉綎先頭部隊進至阿布達裡崗時，遭到伏擊，兵敗身死。努爾哈赤乘勝擊敗其後續部隊。
楊鎬坐鎮瀋陽，掌握着一支機動兵力，對三路明軍沒有作任何策應。
及至杜鬆、馬林兩軍戰敗後，纔在三月初五，慌忙傳令李如柏軍回師。
李如柏軍行動遲緩，僅至虎攔崗。
當接到撤退命令時被後金哨探發現，後金哨探在山上鳴螺發出衝擊信號，大聲呼噪。
李如柏軍以爲是後金主力發起進攻，驚恐潰逃，自相踐踏，死傷1000餘人。
朝鮮軍隊元帥姜弘立率領剩餘的五千兵下山來投降，後金設宴款待他們之後，將他們釋放回國，並且修書給朝鮮國主光海君。
薩爾滸之戰，以明軍的失敗、後金軍的勝利而告結束。
此戰之後，後金軍乘勢攻佔開原、鐵嶺，征服了葉赫部，酋長金臺吉、布揚古被殺死，餘部俱降建州。
朝鮮王朝的光海君於1619年（明萬曆四十七年，後金天命四年）農曆五月，派遣使者去後金致謝，從此對後金與明朝採取中立政策，直至後來仁祖反正。
薩爾滸、尚間崖及牛毛寨戰事失利消息傳至明朝都城順天府（今北京），順天府米價立即陡漲。
明軍主帥楊鎬兵敗之後立即引咎辭職，後被拘押，崇禎二年（1629年）被處決。
杜鬆與劉綎已死於戰場，馬林也於3個月後在開原戰死，明軍四路主將四人已失其三，僅有李如柏始終未遇敵，但在戰役之後數日即爲言官彈劾。
一年半後遼事更壞，此事再被提及，李如柏自殺以明志。
薩爾滸戰役，除李如柏軍撤走未遭慘重損失，明軍共損失兵力約45800餘人，戰死將領300餘人，喪失騾馬28000餘匹，損失槍炮火銃20000餘支，元氣大傷，後金軍的勝利，不但使其政權更趨穩固，而且從此奪取了遼東戰場的主動權。
而明軍自遭此慘敗，開始陷入被動，到天啓年間，遼陽、瀋陽、廣寧等重鎮相繼失守，明朝退守遼西，完全陷入被動，局勢萬分危急。
明朝方面自此由進攻轉爲防禦，後金方面由防禦轉爲進攻。
從此攻守之爭就成爲了大明朝談論遼東戰事的主旋律，每每外面還沒有幹起來，裡面的人，自己先爭個你死我活，不可開交。
後面比較出名的是熊廷弼和王化貞的攻守之爭，韋寶也略知一二。
王化貞平素不學習軍事，輕視大敵，好說大話。文武將吏的規勸一點也聽不進去，與熊廷弼尤其牴觸得厲害。他妄想投降後金的李永芳會做他的內應，相信蒙古人的話，說是虎墩兔將派援兵四十萬，因此想不戰而獲全勝。一切事務如兵馬、甲仗、糧草、營壘等都放置一邊不加過問，一意說大話矇騙朝廷。
尚書張鶴鳴很相信他，他有所請無不答應，因此熊廷弼無法實現自己固守的心願。
廣寧有十四萬部隊，而熊廷弼的山海關上卻沒有一兵一卒，只是有經略這麼個虛名而已。
從延綏調來的部隊不能作戰，熊廷弼請把主帥杜文煥治罪，張鶴鳴卻讓寬恕了他。
熊廷弼奏請任用佟卜年，張鶴鳴遞上奏章反對。熊廷弼奏請派遣樑之垣去朝鮮，張鶴鳴故意扣發他的餉銀。於是兩人之間相互怨恨，事事爭吵。
熊廷弼這個人也器量狹小，剛愎自用，火氣一觸即發，盛氣凌人，朝臣大多都厭惡他。
毛文龍鎮江之捷，王化貞自以爲立了奇功。
熊廷弼說：“三方兵力尚未集合，文龍發動得太早，致使敵人恨遼地的人民，把周圍四衛的軍民屠戮殆盡，使東山軍民灰心，讓朝鮮君臣膽寒，令河西軍隊喪氣，擾亂了三方並進的計劃，耽誤了聯絡朝鮮的打算，把它看作奇功，實際上是奇禍呢。”送信到京城，竭力批評化貞。
朝臣們正把鎮江一役看作大捷，聽到他的話，心中多有不服。
熊廷弼又明顯地攻擊張鶴鳴說：“我既然擔任經略，四方援軍應當聽我調遣，而鶴鳴徑自發動，不讓我知道。七月裡我向兵部詢問軍隊人數，到現在兩個月了，沒有回答。我有經略之名，無其實，遼左的戰事都是張樞密和王撫臣一起辦的。”張鶴鳴這下更加惱恨他了。
到九月份，王化貞還說虎墩兔的四十萬部隊快來了，請迅速出兵。熊廷弼說：“撫臣靠着蒙古人，想不虞而收戰功。我不敢輕視敵人，不敢說能不戰而勝。”
後來蒙古軍隊終於沒來，王化貞也不敢進兵了。
熊廷弼主張防禦，認爲遼地人不可信用，蒙古人不可憑仗，李永芳其人不可相信，廣寧地方有很多間諜讓人擔心。
王化貞則一切相反，絕口不提防禦，說我們一渡河，河東人必爲內應。並且飛書報告朝廷，說八月裡你們就可以高枕酣睡，而收到我的捷報。有見識的人知道他一定壞事，因爲疆場事關係重大，沒有人敢說他的不好。到十月份，河上結了冰，廣寧人認爲後金一定渡過河來，紛紛想逃出廣寧。
王化貞於是和方震孺商議，分兵把守鎮武、西平、閭陽、鎮寧等城堡，而以主力駐守廣寧。張鶴鳴也認爲廣寧值得擔憂，請明熹宗命令熊廷弼出關。
熊廷弼於是又出山海關，到達右屯，考慮用重兵內護廣寧，外扼鎮武、閭陽，於是派劉渠以兩萬人駐守鎮武，祁秉忠以一萬人駐守閭陽。又派羅一貫以三千人守西平。又重申他的命令說：“敵人來時，跨出鎮武一步的，文武將吏都有殺無赦。敵人到達廣寧而鎮武、閭陽不出兵夾攻，敵人搶劫右屯餉道而三路兵馬不救援的，罪也相同。”
熊廷弼剛剛部署完畢，王化貞又相信間諜的話，突然發兵襲擊海州，不久又退了回來。
廷弼於是上書說：“撫臣進兵，到現在已經五次了。部隊屢進屢退，敵人早看透了我方的計謀，我的虛名也因輕易出兵而受到損傷。希望陛下明確指示撫臣，對自己的行爲慎重些，不要給敵人嘲笑了。”
王化貞看到他的上書很不高興，飛章上奏，爲自己辯解，並且說：“我請求給我六萬兵，我保證把敵人一舉蕩平。就是不如意，也一定能做到死傷相等，使敵人一蹶不振，管保它不再成爲河西之憂！”並請准許他便宜行事。
當時葉向高掌了大權，他是王化貞成進士時的主考官，很偏向王化貞。等王化貞請求把後金軍一舉蕩平時，熊廷弼上書說：“就請按撫臣約定的辦吧，應及早罷掉我的官以便於鼓舞士氣。”
這個時候，中外都知道經略、巡撫兩人不和，一定會壞了邊疆的大事，大臣們的奏章天天討論此事。而張鶴鳴篤信王化貞，於是想把熊廷弼拿掉。
天啓二年（1622年）正月，員外郎徐大化順承其意彈劾熊廷弼大言欺世，嫉能妒功，不罷免他必將有害於遼地戰事。
他們的奏章一併被髮給各部，張鶴鳴於是召集大臣們討論。說把熊廷弼撤職的有幾個人，其餘大多主張讓二人各盡其職，共謀成功。
正好後金軍這時逼近西平，就停止了爭議，仍然兼用他們兩人，責令他們共同努力，功罪一體。
沒過多久，西平之圍吃緊。王化貞相信中軍孫得功的計策，發動了廣寧的全部兵力，讓孫得功和祖大壽前往和祁秉忠會合，然後向前去作戰。
熊廷弼也傳令劉渠拔營赴援。
正月二十二日在平陽橋遭遇後金軍，剛剛交鋒，孫得功和參將鮑承先等領頭逃跑，鎮武、閭陽的兵力於是也被打敗，劉渠、祁秉忠在沙嶺戰死，祖大壽逃往覺華島去了。西平守將羅一貫待援不至，與參將黑雲鶴也戰死。
熊廷弼當時已離開右屯，駐軍閭陽。參議邢慎言勸他緊急救援廣寧，卻被僉事韓初命阻撓，於是熊廷弼撤退了回來。當時後金軍在沙嶺停下來不再向前來。
王化貞平常把孫得功看作心腹，而孫得功已偷偷地投降了後金，他想活捉王化貞作爲自己的功勞，就詐稱後金軍已到城邊。
城中一時大亂，人各奔逃，參政高邦佐阻擋也擋不住。王化貞正關起門辦理軍書，毫無所知。
參將江朝棟推門闖進來，王化貞大聲訓斥他。
江朝棟大聲喊道：“事情危險了，請你快走！”王化貞不知發生了什麼事，朝棟就攙扶他出來騎馬逃走，後邊兩個僕人徒步跟着，於是丟了廣寧城，倉惶逃命。
在大淩河遇上了熊廷弼，熊廷弼微笑着說：“六萬軍隊就可以把敵人一舉蕩平，到頭來怎麼樣呢？”
王化貞感到慚愧，建議駐守寧遠和前屯。
熊廷弼說：“已經晚了。現在只有保護老百姓入關去！”於是把自己所領的五千人交由王化貞來殿後，把全部積蓄都放火燒了。
正月二十六日熊廷弼和韓初命一起護送難民入得關來，王化貞、高出、胡嘉棟也先後入關，只有高邦佐自殺而死。
孫得功率領廣寧城的叛將把後金軍迎入廣寧時，王化貞逃跑已有兩天時間。
後金軍追趕他們追了二百里，因路上沒得糧食吃纔回去。戰敗的消息傳到朝廷，京城爲之震驚。
薩爾滸之戰和王化貞，都可以說是指揮不力造成的失敗。
到了眼下，孫承宗主持大局，則不存在這個問題。
因爲孫承宗不但頭腦清楚，是明末當之無愧的帥才，且地位崇高。萬曆四十八年（1620年），明熹宗朱由校即位，孫承宗以左庶子充當日講官。
孫承宗是天啓皇帝朱由校的老師，這種人爲統帥，至少不怕讒言，而又有軍事才能，則更爲不易。
似乎是天要庇佑大明瞭。
天啓元年（1621年），孫承宗官升少詹事。同年，後金進攻遼東，瀋陽、遼陽先後被攻陷，遼東經略袁應泰自殺。御史方震孺奏請熹宗朱由校以孫承宗代替崔景榮爲兵部尚書，朝中大臣也認爲孫承宗知曉兵事，推舉孫承宗爲兵部添設侍郎，主持遼東防務。
熊廷弼被罷免後，朝廷以王在晉爲遼東經略。王在晉上任後打算襲取廣寧，但總督王象乾認爲就算能攻取廣寧，但也不容易守住，還不如重守山海關防衛京都。
於是王在晉在山海關外八里鋪修築重關，留四萬人馬去守。
袁崇煥認爲王在晉此舉不是好的策略，與王在晉爭辯無果後，上書給首輔葉向高。
葉向高卻認爲不能憑主觀猜測，於是孫承宗請求親自前往遼東決斷。
朱由校非常高興，加封孫承宗爲太子太保，並賞賜蟒袍、玉帶、銀幣等。
孫承宗到達山海關後，巡行邊塞，袁崇煥向孫承宗請示道：“在寧遠駐紮五千兵力，以壯十三山的聲勢，然後派遣將領帶兵去救援十三山。寧遠距離十三山只有兩百里，可以輕易佔據錦州，如果不行再退守寧遠，怎麼能放棄十萬難民？”
孫承宗於是與總督王象乾商議，王象乾認爲駐紮關上的軍隊剛剛打了敗仗，士氣沮喪，不如調動插部護關的軍隊三千人前往寧遠，孫承宗同意後一方面調兵前往寧遠，一方面去救難民，救援失敗，十萬難民只救回六千人。
孫承宗對此詢問王在晉：“新城修築好以後，是不是要將舊城的兵馬移四萬人來駐守？”
王在晉說：“應該另外設立一支四萬人的軍隊。這樣一來，八里鋪就有八萬兵了，可是一片石西北不派兵駐守嗎？在八里鋪內修築重關，新城後面就是舊城，舊城前面埋的地雷是用來對付敵人的，還是用來對付自己新兵的？新城可以守的話，還用得着舊城嗎？新城要是不能守，四萬守兵倒戈，你是打算開關放敵人進來，還是閉關投降敵人？”
“如果這樣的話，敵人兵臨城下，士兵像先前那樣逃跑，哪裡還用得上重關？”孫承宗說：“準備在山上建三座營寨，防止士兵潰逃。”
王在晉說：“士兵沒有潰敗就修築營寨等待他們，你這是在教士兵逃跑嗎？況且逃跑的士兵可以進來，敵人也可以尾隨他們進來。你現在不爲恢復做打算，卻在這閉關自守，把關外防線全部撤離，還天天在朝廷爭鬥，京都以東還有安寧之日嗎？”
孫承宗無話可說，孫承宗於是召集諸將商議關外防守的問題。
袁崇煥主張守寧遠，閻鳴泰主張守覺華島，王在晉主張守中前所。
孫承宗採用袁崇煥的建議，並親自鎮守關門。
而後明熹宗在孫承宗的建議下罷免了王在晉的遼東經略之職。
天啓二年（1622年）八月，孫承宗於是自請爲督師，還讓薊、遼等原來的將領監管各處，見機行事時不必受到其他人的限制。
孫承宗用閻鳴泰爲遼東巡撫，又用鹿善繼、王則古爲贊畫，並請求從國庫帶走八十萬錢。
皇帝朱由校同意後，親自將孫承宗送出宮門，並賜給孫承宗尚方寶劍、坐蟒等，內閣大臣將孫承宗直送到崇文門外。
孫承宗上任後，讓江應詔制定軍事編制，讓袁崇煥建造營房，李秉誠訓練火器裝備，鹿善繼、王則古處理軍需物資，沈棨、杜應芳維修甲仗，孫元化修築炮臺，宋獻、程侖購買軍馬，萬有孚採伐樹木，祖大壽輔助金冠守覺華島，陳諫助趙率教守前屯，魯之甲拯救難民，楊應乾招募遼人編製成軍隊。
孫承宗發現先前關上的士兵沒有紀律，而且有大量的不符合條件的人冒領軍餉，於是孫承宗閱兵後，將河南、真定等地不符合條件的士兵全部遣回。將魯之甲所拯救出的難民徵召七千人出來去駐守前屯，楊應乾招募的遼人軍隊去鎮守寧遠，請求朝鮮聲援遼東，又犒賞東江鎮的毛文龍，讓他四面防衛。並傳令給沈有容進據廣鹿島。
而後江應詔被彈劾，孫承宗請求讓馬世龍代替，並讓尤世祿、王世欽爲南北帥，聽馬世龍調遣。
朱由校聽從孫承宗的建議並賜給馬世龍尚方寶劍。
登萊巡撫袁可立與孫承宗同爲天啓二年殿試同考官，共同主遼期間滿人蜷伏。
孫承宗將遼海防務委之於袁可立，十分倚重。他說道：“讀後先大疏，皎皎揭日月，行中天而底裡洞徹，殊令人可味，可展布四體，仰酬國恩。”
皇帝朱由校喜歡視察邊關，經常派東廠的人到關門，然後將邊關的事情上報給朝廷。
魏忠賢掌權後派遣自己的黨羽劉朝、胡良輔、紀用等四十五人帶着數萬武器裝備來到關門，供給邊關軍隊，又用白金十萬，蟒、麒麟、獅子、虎、豹等銀幣賞賜將士，賜給孫承宗蟒服、白金等，表面上是慰勞軍隊，實際上是窺探軍情。
孫承宗出關巡視寧遠，聽到這個消息立刻上書給朱由校，說不能讓宦官監軍，但朱由校卻回覆說這沒什麼。
使者到邊關後，孫承宗只用茶水招待。
天啓三年（1623年）孫承宗推薦閻鳴泰當遼東巡撫以後，認爲他沒有實際才能，所以軍事上的事很多都不跟他商議，閻鳴泰因此感到不高興，朝廷議論後，將閻鳴泰罷免，用張鳳翼接替，但張鳳翼膽小，又主張退守山海關。
孫承宗對此感到不高興，出關巡視寧遠，召集衆將開會，多數將領都想退守山海關，馬世龍建議守中後所，袁崇煥等主張守寧遠。孫承宗採用袁崇煥的主張，於是讓祖大壽修建防禦工事，令袁崇煥、滿桂駐守寧遠。
孫承宗擔心自己的權利受到限制，上書朱由校說督師和總督不能同時設立，請求將自己罷免。
朱由校於是終止總督的推選，令遼東巡撫移駐寧遠。
張鳳翼覺得這是置自己於死地，與萬有孚等詆譭馬世龍。
沒過多久，萬有孚被薊州巡撫嶽和聲彈劾，張鳳翼於是稱馬世龍和袁崇煥陷害，捏造謊話欺瞞朝廷，試圖阻撓出關的計劃。
給事中解學龍也大力陳說馬世龍的罪過，孫承宗非常生氣，上書給朱由校說邊關的防守策略，說寧遠、覺華不能放棄，併爲馬世龍辯解，又揭發萬有孚與張鳳翼等勾結的罪狀。
天啓四年（1624年），寧遠城修復的差不多了，關外的守備器械也已建造完畢，孫承宗上書朱由校請求發軍餉二十四萬，這樣就可以大舉進攻了，但兵部和工部卻橫加阻撓，向朱由校進讒不能給錢，孫承宗上書催促無果，孫承宗大軍因此沒有出征。
孫承宗坐鎮遼東，與天津巡撫李邦華、登萊巡撫袁可立遙相呼應，“關門息警，中朝宴然，不復以邊事爲慮矣。”
在這樣相對安定的大背景下，按照戰功來衡量，似乎孫承宗有些碌碌無爲。
兵部尚書王永光對孫承宗積極防禦的一番作爲作過很中肯的評價：“兵家有云，善戰者，無赫赫之功！”孫閣老之所以打的都是小仗，是因爲建奴知道他能打仗，再加上登萊兩軍鎮袁軍門的水軍牽制，後金不肯貿然來碰他的黴頭，所以兩年下來，孫閣老和袁軍門一直沒有發動大戰役的機會，而發動戰略總反攻把後金趕出去的機會又不成熟。但反過來說，孫閣老在無形中爲朝廷省下了許多軍費，確保了山海關安然無恙，使大明朝廷有了更多的機會養精蓄銳，充分顯示了天朝的不戰之威。”
首輔孔貞運評價孫承宗：“公久歷海上，凡地形險易，軍儲盈縮，將吏能否，虜情向背皆洞若燭照，故登萊終公（袁可立）之任銷鋒臥鼓。”
這也從另一方面肯定了孫承宗和袁可立積極防禦之功。
令人惋惜的是，正當孫、袁二公積數年之力準備大有作爲組織大反攻之時，閹黨已全面掌控局勢，天啓皇帝不再過多的直接參與政事和軍務。
與兩年前比起來，孫承宗更加孤獨，政治牌面銳減。
不管當官還是當統帥，都靠有人撐腰，都需要權力的支撐。
對於薊遼督師這種大明朝重中之重的位置，更是如此，而且必須得到皇帝最大限度的支持。
本來明軍對建奴的形勢就很不好，即便是皇帝全力支持，將帥都很得當，而且都用命，也難有幾分勝算。
現在還有一件讓孫承宗頭疼的事情就是，隨着毛文龍的東江軍崛起，以祖大壽等人爲首的遼西遼東本地世家將門不樂意了。