石井四郎是被北野政次從七三一部隊擠出去的，對於北野政次的所作所爲，石井四郎可謂是恨之入骨，七三一部隊遭到了毀滅性的打擊不假，損失了大量的人員的物資，最爲重要的新開發的幾個型號的天花異變病毒等，不過對於梅津美治郎的擔憂石井四郎則微微一笑道：“總司令官閣下，參謀長閣下，請兩位不必擔心，七三一部隊雖然全體玉碎，設施也全部被摧毀，但是我們在朝鮮境內還有一處秘密實驗所，哪裡儲存着帝國五支特種給水部隊的一切中要資料和文件，包括北野政次在任期間的研究資料，幾乎每一季度各個部隊都要派出專門人員將資料備份送遞朝鮮境內的零號研究所儲存，以防萬一之用，所以請總司令官閣下與參謀長閣下放心，只要再給我三個月的時間，我一定能夠恢復七三一部隊的鼎盛，並且完善北野政次在任時期落下的工作進度，這一點請兩位放心。”
石原莞爾看了梅津美治郎一眼隨即道：“石井君你是帝國最爲出色的病毒專家，你從七三一部隊歷任可以說是帝國的巨大損失，北野政次在研究方面確實有不足，但是他的管理能力也不能完全否認，三個月的時間對於帝國來說非常寶貴，我請你珍惜時間，你所需要的人員和物資總軍方面當全力配合。”
梅津美治郎聽到這裡也算是暗自鬆了口氣，現在關於“滅絕”計劃的泄密問題大本營的調查組正在海參崴進行調查，除了御前會議的幾個爲數不多的人之外，關東軍方面只有區區五個人知道這個計劃，恰好梅津美治郎也是其中之一，身爲關東軍總司令官還要接受忠誠方面的調查，對於梅津美治郎來說似乎沒有比這個更爲荒謬了的。
北野政次的七三一部隊在五六九部隊遭遇轟炸之後相繼出了問題，並且涉及到了裕仁天皇親自核準的“滅絕”計劃，所以大批的重要崗位的日軍軍官被調離崗位，接觸過電文的甚至要隔離審查。
不過，石井四郎的復出也算間接幫了梅津美治郎一個大忙，起碼對天皇陛下和御前會議有了一個交待，如果石井四郎真的能夠在三個月之內恢復七三一部隊生產病毒用於實戰的能力，那麼滅絕計劃還是能夠得到實施的，“滅絕”計劃原本的作用就是在大量殺傷敵軍民的同時製造感染無人區，爲遠東的決戰爭取時間，現在從裕仁天皇到參謀本部、軍部都已經是徹底的騎虎難下了，當初發動的遠東之戰大大的超過了日本的國力承受力，在中國戰場陷入泥潭之際發動遠東戰役，隨後又入侵東南亞徹底觸動美國利益，似乎瘋狂已經到了極致。
以至於現在從天皇到參謀本和軍部，都將希望寄託在一些非常正規戰略戰術上，比如超級炸彈計劃，據說美國人、德國人都在開發一種超級炸彈，作爲最爲經濟快速的病毒武器，也被大本營視爲了扭轉戰局的秘密武器了，不過身爲關東軍總司令官的梅津美治郎知道，爲了這個該死的“滅絕”計劃，關東軍作爲了重大的犧牲，大量的戰略要點核心全部被放棄了，近百萬僑民難民和武裝開拓團的團民被中國青年軍驅趕到了遠東，這一切簡直就是作繭自縛苦不堪言。
中國青年軍的機械化在齊齊哈爾郊區準備了三天還不進攻，每天從齊齊哈爾發往遠東的列車上和沿途的鐵路、公路兩側都是密密麻麻的難民，大約每天有十餘萬難民涌入遠東，在梅津美治郎看來中國人驅趕日本難民進入遠東真是一條一箭雙鵰的毒計，大批的日本難民進入仍在冰天雪地的遠東，自己身爲關東軍總司令官不去管這些難民顯然不行，因爲這些難民中百分之八十都是軍屬和開拓團之流。
管這些人無疑要消耗大量的物資和糧食，現在失去了從朝鮮運輸物資的路線，只能夠從海參崴運輸物資和糧食，原本東北的糧食是向中國戰區、東南亞戰區、本土、遠東戰區輸送的，現在反而需要本土貼補遠東戰區，並不存在的中國戰區可以不顧了，東南亞盛產糧食，所以大本營只能讓南方總軍拼命的收刮支援遠東，但是現在海運對於日本人來說並不安全了，頻頻從寧波等沿海出擊的中美聯合空軍部隊將至少三分之一的日軍運輸船送入了海底，這對苦於缺少運輸船隻的日本人來說無疑是雪上加霜。
梅津美治郎面臨一個困境，那就是之前風光無限的關東軍總司令官的位置問題，梅津美治郎面臨的不是有人躍躍欲試搶位置，而且他以身體不好作爲理由辭職未得到東條英機的批准，在裕仁天皇哪裡御考也未能通過，具體的原因非常簡單，沒有人願意在這個時候出來接任關東軍總司令官一職務，因爲中國青年軍主力全部進入東北三省，日軍的主力已經完全退出東北，中國軍隊的東西兩路大軍如同兩把鐵鉗一般死死的鉗住了關東軍的尾巴。
中國軍隊的重兵徐徐推進的意圖非常明顯，即爲決戰，但是此刻的關東軍內部分爲至少三個派系，石原莞爾雖然剛剛複製，但是其擁有一批鐵桿的擁護者，尤其在基礎軍官之中，其的威信非常之高，在東京坐鎮的東條英機則是在師團長中有一大批是他一手提拔起來的所謂自己人，石原莞爾的復出對於東條英機來說是一件相當不愉快的事情，所以東條英機一直在念念不忘的尋找機會。
關東軍是一個整體，石原莞爾如果出了問題，身爲總司令官的梅津美治郎還能跑得了嗎？顯然梅津美治郎必須要與石原莞爾同舟共濟，但是他又不想得罪東條英機，於是梅津美治郎這位堂堂的關東軍總司令官，就成了風箱裡的老鼠兩頭受氣。
就連梅津美治郎自己都承認，關東軍此刻陷入了困境。