雖然蕭然算的上是手握大權，更控制着對聯邦來說一個重要地盤的全部兵力，但在對聯邦內部的情報流通這方面，卻是遠遠比不上幕後控制影響着聯邦和利馮茲的。天人幫助反抗組織救人的這件事情上，已經讓聯邦內部有了天人和反抗組織聯合的聲音，而在利馮茲的推動之下，聯邦很快就通過了對中東和非洲這兩個聯邦掌控能力最小，同樣也是反抗組織活躍最多地方的掃蕩行動。
而就在聯邦計劃着掃蕩行動的時間裡，通過王留美和拉古納聚集起來的大批彈藥，生活物資，藥品，甚至是極少量的ms在利馮茲的幫助下送到了反抗組織的手中，這種對反抗組織來說大手筆的幫助，也讓反抗組織的重要人員察覺到了自己的新盟友到底有多麼的不凡。
這樣數量的援助，而且基本對聯邦來說都是違禁品的援助竟然能一路暢通無阻的運送到他們的手中，這也變相的說明了這位盟友支持者在聯邦之中也具有着相當的能量，而能得到這麼一位盟友的幫助，雖然對反抗組織來說絕對是一件很好的事情，但也不得不讓他們在對待蕭然這位神秘的盟友保持足夠的警惕。
而隨着這批物資的抵達，蕭然的燃燒軍團也以小隊爲單位然後完全打亂，如今在經過了色ed-d世界的衆多資深者加入，並且有了小隊的加入之後，新人蔘與者和資深者的數量也差不多相互持平，所以便以老隊伍帶新隊伍的方式作爲戰力支持也暫時加入到了反抗組織之中。
這樣一來哪怕全部的軍團人員加起來其實也並沒有劃分出太多的隊伍，只是每個隊伍的人數稍多一些罷了，對於區域極大的非洲地區和中東地區來說也做不到完全覆蓋，也只能說是給予支持罷了，而且這其中還沒有包括骷髏小隊的六名機師，奧茲瑪，阿爾特，小盧卡，米歇爾，葛蘭葛蘭和布雷拉。
不過若是真的將資深者和新人完全分開，其實後果也可以想象，新人們基本都是d級機師，面對上有着級機體結果也只能是呵呵了，蕭然的目的是讓所有的成員在這次的任務中有足夠的成長並團結起來，而對新人來說更是希望他們通過這次的任務累計足夠的經驗成長爲級機師，當然不可能真的就把他們置於危險的境地當中。
所以骷髏小隊的六名機師就成爲了機動部隊，同樣來到了地球但卻只會在某支分隊出現危險的時候以最快的度趕到幫他們解除威脅，而已經對這個世界有着足夠了解的艾爾埃爾夫，則作爲所有分隊的總指揮進入到了反抗組織，成爲了支援隊伍的隊長。
克魯澤通過利馮茲的安排進入到了聯邦之中，在聯邦總部得到了一份體面的工作開始對聯邦的成員進行接觸，以他的能力相信很快便能夠找到一批同樣有着推翻現有政府想法的人聚集在自己的身邊，而巴薩克則留守邊境號，個人能力的強大和操作能力的優秀，足以讓巴薩克在利馮茲的基地裡保護好同樣不凡的邊境號，而積古斯則帶着那如同頭盔一般的面具被利馮茲安排進入到了之中，格拉漢姆則頂替了蕭然阿歷克斯的身份正式的加入到了天人，娜洛則回到了蕭然的身邊。
所有的一切都安排得妥妥當當，天人，聯邦反抗組織四方面都在最短的時間安插進了自己的人，對於龐大的聯邦和來說，區區兩個人並不會受到任何注意和重視，而天人方面對蕭然又是完全的信任，只有反抗組織這一方對於蕭然給予的極大物資支持和人員支持有感激但也有一定的警惕，大體上卻還是保持了基本的信任。
而開始對反抗組織進行全面掃蕩的幾個小時之前，這件事情才通過王留美傳到了反抗組織的那裡，很快反抗組織便開始了全滅的撤退，但幾個小時的時間又怎麼可能真正將一個龐大的組織完全隱藏起來，於是戰爭開始了。
這支強大武力部隊的帶領下，同樣也有無數的普通聯邦ms加入到了這場對反抗組織的掃蕩之中，聯邦和情報能力不容小覷，更何況還有着利馮茲，王留美在這其中起到的重要作用，反抗組織的基地一個個的被摧毀，哪怕在提前得到了通知的情況下，大多數基地成員也同樣遭受到了追擊和屠殺，損失可謂是非常的大，哪怕在集合起來也不復原本的力量。
但在幾個重要的基地方面，因爲有着燃燒軍團的成員幫助，倒是給組織成員的撤離提供了足夠的時間和戰力，更是在撤退的過程中擊破了不少和聯邦的ms，讓這些基地的反抗組織成員安全的逃離。
這一場掃蕩足足持續了好幾天的時間，一個反抗組織的基地被現，要麼是空就開始遵循着痕跡追擊，追殺就是一場慘無人道的屠殺，要麼是有人的那就是一場戰力號不對等的戰鬥，然後用無人機進行屠殺。
這樣規模的掃蕩根本無法瞞過這個世界，哪怕聯邦在怎麼對信息進行管制，但也還是有不少關於掃蕩過程的信息泄漏了出去，一時之間也在世界範圍內引起了巨大的震盪。
在這次領頭的掃蕩行動之中，天人也再次出現並加入到了戰鬥之中，但這並不代表着天人的行動就完全是在幫助反抗組織的撤離，他們更多的是在單方面的阻攔行動，完全不和反抗組織有任何聯繫，但這樣一來也同樣給四散在各地的反抗組織成員更多的隱藏和撤離的時間。
蕭然也一直關注着地球另一邊的軍事行動，每一天甚至是每過幾個小時都會有不同的人向他這裡來那邊情況的一切報告，這其中也包括着卡蒂·馬妮金和謝蓋爾兩人，蕭然給他們的回覆便是儘可能不要傷害那些反抗組織的成員，掃蕩結束之後讓兩人過來和自己碰面。
卡蒂·馬妮金和謝蓋爾兩人雖然身爲但對行動卻是真的看不上眼，那種對毫無抵抗能力之人的屠殺讓他們和他們手下的人也感到真正的厭惡，所以兩人率領的分隊反倒成爲了這次掃蕩行動之中的一股清流，除了那些駕駛着ms和各種反抗的人之外，其實並沒有製造出更多的殺戮，哪怕是抓到了反抗組織的成員也僅僅只是將他們關押起來變相的保護在自己的羽翼之下。
動作成功達到了蕭然的預期目標，讓反抗組織實力極大削弱，讓自身的恐怖陰影流傳世界，在戰鬥之中讓自己軍團的成員得到了更多的戰鬥經驗，讓剎那在看見那屠殺的一幕幕之後變得更加的成熟。
就在聯邦忙碌着掃蕩的時候，兩個人也出現在了蕭然日本軍事基地的辦公室之中，在蕭然無法離開日本的情況下，這兩個人拋開了手邊的一切工作親自來到了蕭然的這裡，一個是以年邁爲由離開了聯邦全身心投入到天神之中的拉斐爾教授，而另一個則是擔任技術部主任但實際上卻同樣是天人下屬機構天神開部門主管的比利·片桐。
兩人的到來讓蕭然心情也相當不錯，而兩人的到來也並不會引起其他人的懷疑，畢竟當初兩人和蕭然的關係不錯，並且兩人曾經和現在都算得上是聯邦的重要保護人員，這次過來拜訪也純屬正常，但不會有人想到兩人前來蕭然這裡的真正目的可不僅僅只是拜訪那麼簡單。
這兩人在進入蕭然的辦公室之後，帶領着兩人進來的娜洛就轉身離開，而蕭然在看見了已經逐漸年邁的拉斐爾教授之後，也是作爲一個晚輩一樣親自的將拉斐爾教授攙扶到了巨大辦公室裡的沙坐下。
而拉斐爾教授在看到蕭然的動作或是蕭然本身也顯得相當的欣慰，順着蕭然攙扶着自己坐下之後，就直接感嘆的開口說道：“你回來了就好，四年了，你離開了四年，真沒想到世界竟然會變成這個樣子。”
比利·片桐也對着蕭然笑了笑，喊了一聲將軍之後也坐到了拉斐爾教授的身邊，一人杵着柺杖坐着，一人雙手搭在膝蓋上坐着，但兩人的目光卻全都集中在了蕭然的身上。
看着拉斐爾教授那對於這個世界局勢揪心的眼神，蕭然也是微微的嘆了口氣：“我也沒想到在聯邦建立之後世界竟然又會變成現在這樣成立最開始是爲了保證世界的平穩，但沒想到只是四年世界，這支部隊竟然會變成了這樣，導致了那麼多的屠殺，戰鬥，在加上這次對中東和非洲地區的掃蕩行動，更是讓世界的矛盾再次凸顯，完全脫離了之前我們計劃。”
說道這裡，拉斐爾教授有些生氣，用着非常不滿的眼神看了蕭然一眼重重的將自己的柺杖敲在了地上，氣呼呼的說道：“要我說當初你就不應該離開，要不是你離開了那支部隊在你的掌握之中又怎麼可能會變成今天這樣，到現在外星人還沒有來，自己人就開始打自己人了，如果外星人忽然出現現在又該怎麼辦！”
對於拉斐爾教授的話蕭然也只能歉意一笑，對於這位睿智的老人，爲了天神而付出了不少的老人蕭然是從心裡尊敬他的，但離開與否根本由不得他做主，而且這短短時間裡越猖狂的舉動也是他一手導致，自然這一點是不可能當着拉斐爾教授說出來的，比利在聽到拉斐爾教授的話之後也是頗爲無奈，誰讓如今司令官已經正式落到了他叔叔的頭上，而且哪怕是以前也是他的叔叔在安排做事，真要牽連進來他自己也脫離不了關係。
比利一邊輕輕拍着拉斐爾教授的後背，一邊說道：“老師消消氣，將軍當時離開也應該是有必須的理由，現在將軍也回來了，應該是辦法解決現在的情況的。”
等到比利的話音落下，娜洛便走了進來並且手上還端着一個放着三杯咖啡的盤子，等到娜洛如同秘書一樣將咖啡放在三人身前，蕭然才轉頭對着娜洛說道：“出去守着不要讓任何人進來打擾我們的談話。”
娜洛點了點頭和拉斐爾教授，比利兩人打了個招呼就再次離開，守在了辦公室門外不準任何人進入蕭然的辦公室。而直到大門關上，蕭然纔對着兩人說道：“當初我的離開的確是有不得不離開的理由，當時我就已經察覺到了聯邦內部之中有着異常的動靜，而且被安插進來的古德曼雖然明面上聽從我的指揮，但實際上卻是聯邦和某些人安排內部限制我的一顆棋子。”
“就算我想要留下，也有人不會願意我繼續留司令這麼一個重要的位置上，如果內部的古德曼和外部的聯邦總部一同施壓，在那種世界最需要安穩的時候我也只能被迫的離開說不定還不知道會被配到什麼地方去，而一旦反抗或許就會被視爲叛逆悄悄的講我處理，既然如此還不如主動一點自己離開留下一個好名聲爲回來做好打算。”
蕭然所說的這些拉斐爾教授也能理解，不過就是因爲太生氣於現在的聯邦纔會對蕭然說出剛纔那樣的話，拉斐爾教授確實也能感覺到此時的聯邦和經被一隻黑手所掌握，有些事情的確也是無可奈何。
拉斐爾教授沉默了一下，然後問道：“那你現在準備怎麼做，世界的局勢絕對不能在混亂下去，而且這支部隊的存在也影響到了世界的和平，同樣不能在容忍噁心在持續，否則將會有更多無辜的人因此而犧牲，也會有原本應該作爲抵抗外星生命中堅力量的人白白死去。”
蕭然點了點頭，說道：“我知道而且我也已經有了安排，而且在這四年裡我也沒有浪費時間，而是帶着家族力量展出了足以改變這個世界的東西，對於現在的聯邦和想要做的就是推翻現在的聯邦政府，成立一個新的聯邦政府。”