“我可以毫不誇張的講，即便我和你聯手，也打不過實力強勁的首領。”幹柿鬼鮫認真地說道，“至於能不能打敗木葉，這個的確不好說，但你要是不去嘗試的話，就永遠都沒有機會去實現你的抱負……”
“……另外，你曾經在木葉待了將近四十年，對於木葉的很多事情，你應該都很熟悉吧？要我說，你完全可以將你自己對木葉的熟識轉化成實戰上的優勢，除此之外的事情，就需要你和佩恩自己看着辦了……”
聽到幹柿鬼鮫的話後，大蛇丸先是沉默了一會兒，繼而揚起了嘴角，喃喃地說道：“交易成功！”
……
三天後。
令宇智波祭有些意外的是，大蛇丸竟然以“宇智波祭態度消極”爲由，單方面終止了和自己的聯盟關係。
對於大蛇丸的這一做法，宇智波祭並沒有產生什麼其他的想法。的確，大蛇丸說的不假，宇智波祭在保護大蛇丸方面確實有點不走心。
因此，在得知大蛇丸單方面撕毀條約的原因後，宇智波祭並沒有向“曉”組織拉攏大蛇丸那方面去想。
時間過得很快。
一眨眼，三個春秋過去了。
木葉55年。
宇智波祭和波風水門31歲，鳴人7歲。
三年內，忍界發生了諸多變故。
木葉方面。
波風水門執政已滿11年，對於三代火影的政策，波風水門一股腦地選擇了繼承。
因而，和火影原著相同，在木葉高層的壓迫下，忍無可忍的宇智波一族的族長和高層開始密謀着叛亂。
對於宇智波一族的叛亂意圖，木葉高層（除波風水門外）早就有所發覺，因而，志村團藏等三位長老瞞過了波風水門，暗中同宇智波鼬接觸，向宇智波鼬陳述利弊，希望宇智波鼬能夠從大局出發，幫助木葉解除宇智波一族的叛亂。
權衡再三，擁有極強大局觀意識的宇智波鼬最終決定，一人揹負殺害宇智波一族的全部罪狀，但前提條件是，木葉必須在此後保護好自己的弟弟佐助。
在制定好具體的行動方案後，爲了不引起波風水門的懷疑、更好地完成這一部署，在宇智波一族叛亂的前一天，志村團藏便以出村訪問爲由，帶走了“根”部大半的精英。而在水戶門炎和轉寢小春的安排下，暗部的大部分忍者也都被派出村子執行任務去了。木葉，一時間陷入了低防禦狀態。
另外，經過三年的偵查，波風水門終於將初代煙影的打探的十分透徹了。將獲得的情報全部拼起來後，波風水門得出了一個令自己都感到驚訝的推測：初代煙影就是已經“死去”多年的好友宇智波祭！
聯想起初代煙影之前的所作所爲，波風水門開始逐漸明白了宇智波祭的想法。而對於宇智波祭當年爲什麼不回木葉，波風水門的想法也是和事實無二。
站在火影的角度上，波風水門覺得，宇智波祭現在或許並不值得信賴。但站在昔日好友的身份上，波風水門真的是高興的徹夜未眠。
和三代火影、志村團藏這種常年混跡官場的老狐狸不同，波風水門的思想依舊還是那麼單純，甚至可以說是有些天真。這一點，從波風水門打心底裡“期待着宇智波祭能夠回到木葉”可見一斑。
砂隱村方面。
經過三年的發展，五代風影馬基已經帶領砂隱村走出了“滅村”事件的陰影。另外，這三年裡，砂隱村和木葉的關係越來越好，幾乎已經達到了火影原著中四戰過後木葉和砂隱村的那種密不可分的關係。
煙隱村方面。
宇智波祭在三年內一直沒有動手，同樣，“忍刀四人衆”像是銷聲匿跡了一般，再也沒有出過煙隱村。
然而，平靜的水面下蘊含着殺機。
宇智波祭的木分身學成歸來後，宇智波祭已經徹底掌握了龍地洞的仙術，經過宇智波祭的幾次改進，在使用龍地洞仙術時，宇智波祭的外貌不會像火影原著中藥師兜那樣令人厭惡。
在掌握了仙術之後，宇智波祭的下一個奮鬥目標呼之欲出——永恆萬花筒寫輪眼。
衆所周知，萬花筒寫輪眼並不是一個完美的狀態，即便有柱間細胞護體，宇智波祭在使用萬花筒寫輪眼的能力時，依舊是有些力不從心。
爲了在和宇智波斑的較量中佔據優勢，思索之後，宇智波祭最終決定，奪取自己兄長宇智波富嶽的萬花筒寫輪眼（粗略看過火影原著的宇智波祭知道，宇智波富嶽已經開啓了萬花筒寫輪眼），煉成永恆的萬花筒寫輪眼。
（宇智波祭和兄長宇智波富嶽的關係並不算好，在宇智波祭年幼之時，宇智波富嶽就曾試圖拉攏宇智波祭，但被宇智波祭拒絕了）
另外，就在宇智波祭想要潛入木葉，“拜訪”宇智波富嶽時，煙隱村暗部傳來消息，志村團藏帶領一干“根”部精英悄悄離村。對於普通人來講，這個消息似乎並沒有用，但對於宇智波祭來說，這是一個殺死志村團藏、爲自己復仇的絕佳機會。
雨隱村，“曉”組織。
三年的時間裡，“曉”組織也是發生了諸多變故。
第一，“曉”組織吸納了阿飛（宇智波帶土）、迪達拉兩名新晉成員。“曉”組織的實力出現了回暖的跡象。
第二，“曉”組織成功地將除八尾和九尾之外的，其餘三隻沒有捕捉的尾獸捕捉到了。（角都和小南捕捉到二尾，幹柿鬼鮫和阿飛捕捉到四尾，蠍和迪達拉捕捉到六尾）
這就意味着，只要將八尾和九尾再捕捉到，十尾神樹就能立即復活了。
此時，面對即將到來的勝利，“曉”組織的首領佩恩似乎有些迫不及待了。經過嚴密的方案設計，佩恩決定兵分兩路。
一路由蠍和迪達拉組成，北上雷之國，意圖在雲雷峽中捕捉八尾和八尾人柱力奇拉比。另一路由佩恩、小南和合作者大蛇丸組成，悄悄潛入木葉，意圖給木葉致命一擊，捕捉木葉的九尾和九尾人柱力漩渦玖辛奈。