判軍的水師雖多，這次出動了一萬大軍三多百條戰船，但被朱由崧御營的這一頓紅衣大炮轟得七零八落，全亂套了，判軍的水師統領徐勇一看不好，趕緊傳令撤退。
但是此時他已經指揮不靈了，朱由崧的人馬很快殺到附近。
這時朱由崧將岸的事暫時交由袁繼鹹、何騰蛟和堵胤錫負責，身披重甲的朱由崧登了最大的一條指揮船，在後面親自督師。卸營統領劉肇基和鄭大木按劍扶刀，緊緊立在他左右，這條大船有二百御營兵，全是火銃手，另外還有三百名水師，包括一百名弓箭手，船頭裝着一門佛郎機，兩側船玄各裝有一門虎蹲炮。這在當時武器裝備稱得一流的軍艦了。
在朱由崧前面共有六隻水師小隊，每隻小隊有水師七八百人，分別由賀兆雄、鄭彩、鄭鴻逵、賀宣嬌、李全、柳春紅等六將負責具體指揮，這六員戰將除了一半來自綠柳山莊，一半來福建鄭家軍的海盜，水裡的本事個一個牛逼，六隻小隊像六把尖刀直插向判軍的陣營。
朱由崧這五千水師的大船也裝有火器，雖然船頭的佛郎機和虎蹲炮不及紅衣大炮射程遠，但到了射程範圍，一齊向判軍開火威力也相當大，這種在紅衣大炮之後，數門佛郎機和虎蹲炮接連開火。
驚天動地的炮聲此起彼伏，江到處是沖天的水柱和傾翻的戰船，還伴隨着滾滾的濃煙和火光。
小船相對於大船來說，速度快，靈活度高，因此很快小船的弓箭也衝到了射程範圍，幾十條小船一字排開陣勢，每隻船有十名弓箭手，一聲令下，幾百名弓箭手萬齊放箭，天空數不清的箭雨呼嘯着罩向混亂的判軍。
一時間判軍箭落水者不計其數，判軍人數雖多，但現在全亂套了，先挨炮後挨箭，根本無有反手之力，這時朱由崧的六支水師小隊便衝進判軍的水師陣營。
“殺！殺！殺！”
賀兆雄、賀宣嬌、柳春紅、鄭鴻逵、鄭彩、李全等身先士卒，跳判軍的戰船，各舉刀槍殺向判軍，這下朝廷的人馬徹底佔了風，只殺得江到處都是死屍，把江水都染紅了。
判軍被殺得大敗，徐勇一看指揮不靈了，也顧不得追殺祖克勇等人了，他連自己的兵將也不要了，僅帶着大小二十幾只戰船，在他們的掩護下狼狽而逃。
祖克勇等人得救了，他們加入賀兆雄的隊伍一起追殺判軍。
但很快朱由崧的旨意下達了，停止追殺，立即收兵回營。
鄭彩和李全不解來問朱由崧：“陛下，爲什麼不追了，一鼓作氣，端了賊人的水師大營豈不更好？”
朱由崧道：“朕這次率水師只是爲營救祖將軍等人，而不是過江作戰，知己知彼才能百戰不殆，現在我們對賊人那邊的情況不甚瞭解，而且再往前追，進入賊人的火炮射程範圍了。人現在已經救回來了，還打了個大勝仗，暫且收兵吧。”
這下衆將皆佩服朱由崧銳敏的觀察力和果斷英明的決策。在勝利面前，還能有保持清醒的頭腦，非常人所能及也。
這時，祖克勇、羅岱和道興帶着一二百人了朱由崧船，感激涕零，全都跪在船板向朱由崧乞罪，“陛下，臣罪投降來遲，罪該萬死，請陛下治罪。”
朱由崧哈哈大笑，“朕知道你祖克勇會回來的，遲是遲了點，不過迷途知返，善莫大焉，還帶來這麼多識時務的兵將，棄暗投明，功過抵了吧，朕全都恕爾等無罪，都起來吧，從今天開始，你們還是朕的好兒郎！”
都說朱由崧寬仁無敵，今天這些人算領教了，以他們所犯之罪輕則殺頭，重則滅門，現在朱由崧一句話全都赦免無罪，而且，他們這條命還是朱由崧救的，若非朱由崧率水師及時出手，他們這些人一個也活不了，不是葬身江底，是被抓回去，那樣會死得更慘，一時間都覺得朱由崧是菩薩帝王，要知道這樣，早來歸順朝廷了。
以祖克勇、羅岱、道興爲首，這一二百人跪在甲板給朱由崧磕響頭，有的額頭磕出了包，有的額頭磕破了鮮血直流，但也不知道痛了，他們用這種方式懺悔並宣誓忠心。
這時賀兆雄則帶水師開始打掃戰場，雖然收兵了，但水裡的戰場也須收拾一下，落水的須得救來，朱由崧傳旨，江有活氣的不管是敵是我一律救來，受傷的亦是如此，不分敵我全部救治，朱由崧的這些政策很多將士都知道，開始時都不解，但這些人被救過來之後，敵人全部變成了陛下的死忠，因此都很服氣朱由崧的這一招。
這一戰不足一個時辰便結束了戰鬥，判軍一萬水師僅跑回去三千多人，有一千多人成了朱由崧的俘虜，還一百多條戰船都成了戰利品，
這些船有些完好無損，有些損毀輕的弄回去後修繕一下便可使用。那些炸燬的、被燒燬的、翻入江的，等等，這些損毀嚴重的船是沒辦法了。
他們指揮把俘虜集在幾條大船，帶着戰利品回了江對岸。
江的這一小仗打得也相當漂亮，這是朱由崧第一次親自在船督師，也是第一次大江指揮水戰，連一千多名俘虜算，此戰共殲滅了判軍水師六七千人，更加可喜可賀的是，不但收降了悍將祖克勇，還得了羅岱道興等一二百名兵將。
朱由崧傳令，犒賞三軍將士，該記功的記功，然後大排筵宴，全軍慶賀一天。
朱由崧白天陪着將士們飲酒，晚和賀宣嬌行魚水之歡，這一天過得非常愜意。
但世界的是這樣，有人笑必然有人哭，有人打勝仗，必然有人吃敗仗。
徐勇帶着殘兵敗將，狼狽逃回水師營，查點人數一萬水師，現在只剩餘三千四百餘人。
副將馬士秀的炮營作爲也不大，開始時表現還行，差點將祖克勇等人送入江底，但後來，目標不在射程是不在射程，在射程內時，雙方又是混戰，怕傷及自己人根本不開炮了。
因此二將一臉沮喪，來見左夢庚請罪。左夢庚唉聲嘆氣，一籌莫展，打一仗敗一仗，這樣下去可怎麼得了？
黃澍給他打氣提神，“少帥不要泄氣，我們堅守不戰，馬派得力之人，聯繫韃子，只要韃子願意接納我們，必然派兵來支援我們，到時候再與昏君決一死戰，報這兩次兵敗之仇。”