影片世界觀設定方面，蚩尤在“巫妖大戰”中險死還生，曾受重創，故而戰力比巔峰大巫時期是下降的。而黃帝這邊，因爲殘酷的生存環境，士兵們的體魄也都頗爲雄壯。單挑一般不是巫族士兵的對手，可要是用兵器，三四個打一個還真不好說。
劇情發展到這，該交代的都交代了，剩下的那就是“生死看淡，不服就幹！”一切的一切，都是爲了戰爭場面服務。
第一次交鋒雙方各有損傷，整體看是炎黃聯軍吃了小虧。巫族將領、士兵的戰力都遠超人族，若非帶的人數略少，蚩尤出擊的太快太早，與本部人馬脫離，弄不好要來一場“彭城之戰”，項羽三萬大軍擊潰劉邦五十六萬聯軍那樣的奇蹟。
之後的幾場戰鬥中，雙方各憑本事，互有傷亡。蚩尤見炎黃聯軍紮營的地勢頗低，便生出“水淹七軍”的想法，命麾下將領風伯、雨師做法施行。
這一日，公孫軒轅正大營內與麾下將領商討破敵之策。忽聽外面旗幟颯颯作響，旗杆折斷的聲音。衆將領簇擁着公孫軒轅到帳外一看，但見外面颳起漫天的風沙，遮天蔽日。不少帳篷被颳走，士兵被颶風捲到天上。
公孫軒轅瞧見不好，忙向身邊的廣成子請援。此刻距封神之戰尚有兩三千年，縱使那時的他也沒見有什麼特別的法術，卻笑道：“我下山時，老師曾贈我一個錦囊，告訴我計無可施時打開，想來就是這一刻。”
旋即從懷中掏出一個錦囊，從中取出一個龍眼大小的淡黃色珠子來。這珠子一亮相，肆虐的狂風立刻停住。衆將領都覺神奇，或是誇讚或是打聽。
現場觀衆則有些想笑，這不就是靈吉菩薩收黃風怪的時候，用的定風珠嗎？話說在《西遊記》中，是如來佛祖賜給靈吉菩薩的，卻不知又是如何到的佛祖手中。
再說大銀幕上，正在半空中施法的風伯忽間鼓不動風，心下詫異。落地後憋的滿臉通紅，道：“不知那大營中有什麼寶物，竟能把我鼓起的風定住，一點也吹不動啊！”
蚩尤聞言眉頭微皺，道：“想來是有些左道之術的練氣士，這些人肉體脆弱不堪一擊，可在術法方面，確實有些門道。”
胖迪飾演的雨師道：“風颳不起，倒要看看能不能把我的雨也定住！”言罷中飛到半空中，做起法來，高空上雲層翻滾，不到一時三刻已是烏雲密佈，黑如鍋底。
炎黃聯軍大營，衆人望着天上的烏雲，都是一臉驚詫。想來這定風珠也是有使用範圍的，竟然不能阻止烏雲齊聚。
不等衆人說什麼，已下起瓢潑大雨，好似天又塌了一般。衆人急忙往大帳內避雨，可望着腳下上升的水位，公孫軒轅面露驚駭之色，“不好，蚩尤想水淹聯軍大營，不知仙長可有秘法！”
熟料廣成子卻搖頭苦笑，“老師並未交代，不過我瞧軒轅首領有人族共主之相，想來自有鬼神相助！”陳保幗飾演的公孫軒轅一臉苦笑，真想知道誰能來助他。
電影中的水位持續上漲，很快漲到半膝深，許多帳篷被沖垮，士兵被沖走，炎黃聯軍一時間損失慘重。
另一方營寨中，蚩尤雖沒親眼瞧見，可望着這大雨，也能猜到炎黃聯軍此刻的慘狀，哈哈一笑向衆人道：“爾等磨好刀子，擦好戈矛，再下上半日讓雨師收了法術，就去是取炎帝老兒和軒轅小子的人頭！”
不想他的話剛剛說完，原本末世降臨般的大雨，竟忽然止住了，氣溫更是陡然而升。帳篷上、地面上有絲絲白氣上升，居然在被蒸發！
炎黃聯軍營寨上空，一個青衣赤足的美麗女子自空中走來，盈盈下拜，自稱女魃，乃是旱神，所在之處天不降雨。聞聽公孫軒轅與蚩尤戰於逐鹿，特來相助。
衆將領瞧着這樣一個美人，都覺口乾舌燥，似乎體內的水分，也隨着周圍的雨水、溼氣一起被蒸發掉。
公孫軒轅忙謝過女魃，準備設宴款待。大軍修整三日後，士氣已復，而且更加高漲。營中士兵都傳，公孫軒轅是上天選定的新天子，所以纔會有各路神仙相助。
而蚩尤那邊，兩次攻擊失利，軍心已然不穩。又聽炎帝舊都那邊傳來消息，“十二都天神煞大陣”已佈置的七七八八，可以勉強一用。蚩尤遂生退意，準備引大軍先回炎帝舊都，據城而守。
蚩尤一退，公孫軒轅和炎帝豈能容他逃走，盡起大軍追擊。且令應龍蓄水，準備也給蚩尤來一次水淹之法。
不料這蚩尤不僅武力頗高，詭計更是不少。施展巫族秘法降下大霧，炎黃聯軍被阻隔於路上，首尾不能相顧。
萬幸普通的巫族士兵也看不透大霧，此法只爲阻敵，否則一戰就能把炎黃聯軍給殺散了。
公孫軒轅召集手下的臣子商議對策，常先、大鴻、力牧等大臣都到齊了，唯獨不見風后，原來這位正在造指南車，一連造出多輛，爲聯軍指明瞭方向，衝出大霧籠罩的範圍，追上了緩緩而行的蚩所部，自是又一場大戰。
劇中蚩尤爲了阻敵，也爲了給“十二都天神煞大陣”的佈置爭取時間，命大部隊先行回去加速佈陣，而他身邊僅有萬餘人馬。
這一下被炎黃聯軍攆上，又有蓄水後的應龍沖垮前方的道路。若是拋棄大軍孤身潛逃，蚩尤怎麼也都是能跑掉了，偏偏不忍拋棄部隊，好似楚霸王入了“十面埋伏”。雖沒說出那句“此天亡我，非戰之罪！”卻也是一臉悲憤。
他自覺洪荒大地，論武力、兵法、計謀，根本無像樣的對手可言，奈何敵方總開掛。
“我巫族承盤古血脈所生，統治洪荒幾萬年，大巫后羿連下九日，祖巫們一戰覆滅天庭。想我蚩尤亦是大巫出身，也曾斬殺無數妖神。只因當年重傷難愈，才託庇與前代炎帝，爲人驅使。本欲覆滅人族一雪前恥，不意今日連累衆兄弟，受困於小小人族！
我蚩尤終不願再忍辱偷生，今日一戰，就要做個了結，衆兄弟可願隨我？”
“殺！”
“殺！”
“殺！”
陷入困境中的這一萬巫族，已然心存死意，腦子只有殺戮一個念頭。
而人族那邊，公孫軒轅也在做站前動員：“兄弟們，當年女媧娘娘捏土造人，煉石補天，纔有我人族誕生。可那時，兇殘暴虐的巫族統治洪荒，先輩們苟且偷生，飽受凌辱。萬幸巫族天生狂妄自大，竟與天庭開戰。精銳覆滅大半，餘孽散落四方。
今有巫族蚩尤，欲重複巫族在洪荒大陸的統治，你們告訴我，能答應嗎？
“不能！”
“不能！”
……
喊聲震動原野，公孫軒轅見士氣可用，緩緩拔出長劍，向天一指大聲道：“開戰！”