且說多寶道人回到人族之後，不好意思說自己被刑天打怕了，沒有徹底將一干大巫剿滅，只是向軒轅黃帝說九黎中的大巫基本被剷除，僅剩三兩個被逃掉，九黎已不足爲慮，讓軒轅黃帝放心便是。軒轅黃帝雖然聽說刑天與昊天玉帝大戰之事，卻不知多寶道人慘敗於刑天之手，便信了多寶的話，放鬆了對九黎殘部的監控，爲日後埋下禍根。
轉眼間軒轅黃帝已在在位幾十年了，人族在軒轅黃帝的領導下發展得越來越強盛，軒轅黃帝可謂志得意滿，不過也有讓他苦惱的地方，那就是在修行方面，似乎軒轅黃帝的法力道行達到了某個瓶頸，修爲增長得越來越慢，軒轅黃帝試了幾個方法效果都不大，無奈之下只得向多寶道人請教。
多寶道人便向通天教主求來了雙修之法傳與軒轅，通天教主所賜雙修功法非同一般，只是需以一點至陰至純的仙靈之氣爲引才能達到最好效果，要想找一個擁有至陰至純仙靈之氣的女仙可不容易，西王母，瑤池王母，嫦羲娘娘這些大能哪一個是現在的軒轅黃帝能夠招惹的，至於女媧，好吧，軒轅黃帝連這個念頭都不敢想，軒轅黃帝都要放棄雙修之法了，不過天無絕人之路，經過多寶道人一番探查，發現曾經傳授軒轅兵法，幫助軒轅黃帝擊敗蚩尤的九天玄女乃玄陰之體，又是修煉多年多女仙，修爲高深，完全能夠達到與軒轅雙修的條件。
軒轅黃帝得知九天玄女就是自己要找的人之後，心中大喜，因爲他本來就對九天玄女甚有好感，軒轅黃帝連忙請多寶道人作媒向天庭求親。九天玄女作爲王母娘娘屬下仙女，深受其信任，不過爲了拉攏軒轅黃帝還是同意了。
軒轅黃帝迎取九天玄女之後便開始了他的雙修大業，之後又納大量女子爲妃與其雙修，加上原本妃子，足有三千之數，軒轅黃帝的修爲法力果然快速增長起來，只是軒轅不知道因爲急功近利，與他雙修女子太多導至法力不純，爲日後埋下隱患，這一點多寶道人早已料到，不過多寶並不擔心，因爲他知道將來軒轅黃帝證人皇道果時必然會有功德降下，到時便可純化軒轅法力，消除隱患。關於這點多寶道人也是羨慕嫉妒恨呀，功德呀，天地間最神奇的力量，雖然現在軒轅跟自己的實力差不多，都是準聖初期修爲，可一旦軒轅證道，那時他的修爲絕對達到準聖巔峰，再加上位階之力加持，聖人之下少有敵手。
軒轅黃帝御女三千，法力大增，漸漸得沉迷於修行之中，讓他不由產生了退位的心思，只是有件事一直讓軒轅黃帝苦惱，那就是沒有合適的傳位之人。事實上關於這點三清和西方二聖也是頭疼，證道人皇果位所需的其它紫氣一直沒找到，無論怎麼推算都亳無頭緒，這讓他們不禁懷疑女媧是怎麼得到四條紫氣的，難道彼此之間的修爲真的這麼大嗎？可是爲何三清聯手以秘法推演天機都不行。
無可奈何之下，三清決定暫時扶持一人作爲人皇統領人族，也趁機加強對人族的掌控，選來選去，最後選中了軒轅之孫顓頊。顓頊本就是聰慧過人之輩，受軒轅喜愛，又有多寶等人向軒轅黃帝進言，訴說顓頊爲帝的諸多好處，並承諾全力輔佐於他治理人族，軒轅黃帝也覺得在沒有更合適人選的情況下，顓頊確實是個不錯的選擇，此事便如此定了下來。
一個月後，軒轅招集人族，祭拜天地，舉行退位大典，當着來賀的衆修士和人族高層將人皇之位傳與顓頊，一大團功德從天而將，其中人成落在軒轅身上，另外有半成飛向崑崙山，方向卻是歸廣成子所有，被廣成子融入自己的法寶玉虛印中，讓玉虛印威力大增，剩下的功德有一部分落在軒轅劍和崆峒印兩件寶物上，至於其它的被多寶，趙公明，玄都大法師，燃燈道人，太乙真人等這些相助的三教門下弟子分攤了，雖然少了點，但也是功德嗎，這可是三界中的萬金油，哪裡不行補哪裡。
軒轅得了功德，法力道行一個勁的往上竄，很快達到了準聖巔峰，腦海出現一幕幕畫面，巨大的身體在北海遊弋，結識兄弟玄武，天地破碎，女媧補天后，要以自己四肢支撐天地，賜與人皇紫氣。前世的記憶終於恢復過來，不過軒轅卻沒有多少欣喜，他不是傻瓜，通過這些年的瞭解，再加上前世記憶自然明白女媧與三清，西方二聖的爭執，現在自己的成就多虧人闡截三教的支持，再加上自已的老師是號稱闡教第一金仙的廣成子，自已也算是闡教門下，可偏偏證道最重要的人皇紫氣是女媧給的，雖然女媧當時說人皇紫氣是給自己的補償，可實際上自己已經得了撐天功德，女媧並不欠自己什麼，反倒是自己欠了女媧人情，日後若是女媧與三清起了衝突自己又該站在哪一邊呢。
就軒轅爲將來站隊問題頭痛時，天邊忽然祥雲漫天，霞光萬丈，一輛九條神龍牽拉的車輦飛來，軒轅擡頭看去，只見車輦上坐着的正是燧人，神農兩位皇者。看到神農，軒轅黃帝稍微一愣，當初精衛遇害之事軒轅雖不知情，但畢竟是因他而起，廣成子所爲也是爲了讓他成爲名正言順的人皇。神農在自己女兒遇害後，並沒有找軒轅麻煩，說到底還是爲了人族安寧。想到這裡，軒轅眼神變得堅定起來，什聖人爭執，什麼站隊問題，通通滾蛋，我爲人皇自然要爲人族考慮，對人族有益的我就支持，有害的我就反對，你們要爭自己爭去吧，老子不玩了。
軒轅黃帝隨兩位皇者前往火雲洞鎮壓人族氣運，不過並沒有乘坐九龍車輦，而是把自己五匹龍馬牽拉的車駕拖出來，以後三皇就用九龍車輦，至於龍馬車輦就作爲五帝的車駕吧。