戴奧尼亞征服布魯提的消息傳到錫拉庫扎時，狄奧尼修斯正在馬西阿斯的陪同下視察錫拉庫扎城防禦要塞的修築情況。
看到工程接近完成，心情愉悅的他突然聽到這個消息，臉色立刻頓時變得陰沉，脫口罵了一句：“該死的迦太基人，阻礙了我的計劃！……”
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公元前397年初春，迦太基蘇菲特希米爾科率領一支號稱10萬的大軍，從迦太基城出發，在海上與錫拉庫扎海軍發生小規模戰鬥之後，順利登陸西西里，而且很快收賣叛徒，輕鬆奪取了西西里島西面的厄律克斯城，接着強攻摩提亞，獲得成功。
錫拉庫扎軍隊被迫撤出對塞格斯塔的包圍，希爾米科並未趁勝追擊，而是摧毀了摩提亞城，在靠近它的海邊附近修建了一座新城，取名叫做利利俾。
在迦太基軍隊停止前進之時，謹慎的狄奧尼修斯在錫拉庫扎城屯兵不動。
希爾米科在爲利利俾新城奠基後不久，就在2月到來之際，率軍繼續向東進攻。這一次他並未沿着去年錫拉庫扎的進攻路線前進，而是乘船繞到西西里島的東北角，輕鬆拿下毫無防備的墨西拿。
墨西拿的陷落對海峽對岸的利吉姆是一大刺激。這個依靠有利的地理位置、繁榮的港口轉運貿易而富裕的大希臘城邦多年來一直悄悄的與迦太基來往，以防被錫拉庫扎對墨西拿海峽的覬覦。忽然間友好的異族城邦亮出毒牙，將利吉姆的姊妹城邦——墨西拿給攻佔了。爲何是姊妹城邦？因爲墨西拿最早是由庫邁和卡爾基斯人聯合殖民建立的，最初叫贊克列，後來因爲美塞尼亞移民的到來才改名叫墨西拿。墨西拿人很早就意識到海峽對岸必須掌握在自己人手中，安全才會有保障，所以他們鼓動母邦庫邁以及美塞尼亞人建立了友邦城市利吉姆。
利吉姆感到了恐慌，他們很快作出決定，派出使者到西里庭的南意同盟總部駐地，要求加入同盟。至此，除洛克裡及其附屬城邦外，大希臘其他希臘城邦，都與戴奧尼亞有了盟約。
希爾米科徹底摧毀墨西拿城之後，爲了討好西西里東部的土著——西凱爾人，同迦太基一起進攻錫拉庫扎，於是他在墨西拿南面的海岸，準備建一座新城——陶羅美尼昂，贈送給西凱爾人。
到了3月，狄奧尼修斯感到不能再放任迦太基人繼續進攻它的附屬城邦了，再不有所作爲，盟邦們很可能倒向迦太基。於是他調集了海陸兩路大軍向北推進到卡塔尼亞平原。
在卡塔奈附近的海域，錫拉庫扎與迦太基爆發了一場海戰。原本希臘戰船的數量多於迦太基人，在裝備上也佔據優勢。但是，狄奧尼修斯任人唯親，他的兄弟萊普提涅斯作爲海軍統帥指揮失誤，導致錫拉庫扎海軍遭受敗績，損失慘重。
陸地上的希臘軍隊都在岸邊觀看海戰，結果看到了海軍的慘狀，開始軍心動搖。
幸好，希爾米科率領的陸上軍隊並未及時到達戰場，因爲在那幾天陶羅美尼昂西南面的埃特納火山突然爆發了，高熱的火山漿噴涌而下，毀壞了南下的道路，黑濛濛的火山灰遮天蔽日，使得迦太基大軍不得不選擇繞道。
錫拉庫扎軍隊敬畏的一路默唱着火神赫菲斯托斯的頌歌，匆忙的退回錫拉庫扎城，卡塔奈、列奧提尼相繼落入迦太基手中。
希米爾科夾着海戰勝利的餘威，率領大軍終於順利到達錫拉庫扎，迦太基海軍也駛入了錫拉庫扎的大港，然後他們在阿拉普斯河岸安營紮寨，企圖從陸上和海上圍困錫拉庫扎。
而此時，狄奧尼修斯卻着急的派出使者乘快船前往意大利的坎帕尼亞、希臘本土的母邦科林斯、霸主斯巴達等城邦，尋求它們提供緊急援助。雖然大希臘是距離錫拉庫扎最近的地方，狄奧尼修斯卻有意無意的忽略了這片區域，沒有向南部意大利霸主戴奧尼亞聯盟求援。
戴奧尼亞也不可能在沒受到邀請的情況下主動派兵，那樣會讓西西里人懷疑是別有用心。而且，戴奧尼亞在經過了頻繁的戰爭和急劇的擴張之後，同樣需要時間去休整、鞏固和整合，所以在西西里的希臘城邦面臨全部淪陷的危急時刻，戴奧尼亞人、以及南意的希臘人心緒複雜的隔海旁觀。
各地的希臘援軍紛紛趕來，尤其是斯巴達派遣了年輕的將領菲比達斯率領30艘戰船和500百名斯巴達戰士趕到。
此時，錫拉庫扎城內的民衆卻在有心人的鼓動下發動了暴亂，要將狄奧尼修斯趕下臺。菲比達斯帶領來自各處的希臘聯軍趕來制止他們的暴亂，他們卻向菲比達斯控訴：正是因爲狄奧尼修斯的糟糕指揮，才使得錫拉庫扎陷入困境，讓民衆失去親人。同時又歷數狄奧尼修斯在國內的殘暴統治，懇求盟邦斯巴達能幫助他們擺脫這個僭主的枷鎖。
菲比達斯想起之前阿格西勞斯的叮囑，板起面孔告訴他們：斯巴達人前來錫拉庫扎的任務是幫助狄奧尼修斯對抗迦太基，而不是幫助錫拉庫扎人推翻狄奧尼修斯！他希望暴亂的民衆能夠平息憤怒，齊心協力趕走已經兵臨城下的迦太基人。
同時，他還讓狄奧尼修斯做出保證：從今以後，不得對參與暴亂的民衆進行報復，今後的統治也會更加寬容。
在斯巴達人的全力支持下，狄奧尼修斯暫時度過一個難關。
城外的迦太基人安定下來之後，開始對錫拉庫扎城外的一切設施進行破壞。他們不但搗毀農田、村鎮，還褻瀆神祗。不但破壞了波皮克萊高地上的宙斯神廟，還搶劫了德墨忒爾和珀爾塞福涅兩位女神的神廟。
這種瀆神的行爲激怒了錫拉庫扎人，雙方多次在城外和大港內發生小規模的陸戰和海戰，勝負各半。
戰爭相持到夏季的到來，隨着氣溫的上升，形勢開始對錫拉庫扎人有利起來，因爲阿斯普拉河附近沼澤地裡的蚊蟲增多，受到叮咬的迦太基士兵受到了瘟疫的折磨，死亡的人數越來越多。
此時，飽受內憂外患壓力的狄奧尼修斯也激發了自己的智慧，制定了一個巧妙的進攻計劃：在黑夜行軍，利用聲東擊西的戰術調動敵人之後，海軍和陸軍同時猛攻敵人要塞的弱側。
而迦太基人因爲瘟疫的折磨，士氣低落，面對錫拉庫扎人的進攻反擊無力。
狄奧尼修斯在付出了上千名僱傭軍生命的代價，相繼攻佔了迦太基人在阿拉普斯河畔修建的波利克那要塞和修建在海岸邊的達斯孔這兩座要塞，同時大敗迦太基海軍，迦太基人紛紛傷亡慘重，希米爾科的中軍營地被圍在中間，營地內一片混亂，眼看着就要全軍覆沒的危險。
就在這時，狄奧尼修斯卻命令停止進攻。
當晚，迦太基軍營與狄奧尼修斯的秘使往來頻繁。
接下來的三天，雙方保持着平靜，沒有發生戰鬥。
到第四天晚上，希米爾科僅帶領剩餘的30條三層槳戰船倉皇的逃出了大港，遺棄了大多數迦太基士兵、同盟軍和僱傭軍，他們最終遭到錫拉庫扎及其盟軍的全殲。
大勝之後的狄奧尼修斯並未對迦太基人窮追不捨，徹底收復西西里，將迦太基人趕出這個島嶼。因爲之前錫拉庫扎民衆的逼宮事件已經使他深刻的意識到，只有迦太基人的勢力繼續在西西里存在，他的僭主地位才能得到保障，所以他不但放跑了希米爾科的殘軍，也沒有繼續掃蕩迦太基在西西里的殖民城鎮，而是開始重點打擊東部內陸地區的西西里土著西凱爾人的勢力，因爲在這次的戰爭中，西凱爾人成爲迦太基的幫兇，給錫拉庫扎製造了很大的麻煩，讓他覺得光統一島上的希臘城邦還不夠，必須擴張錫拉庫紮在西凱爾人居住區的勢力範圍，徹底將西西里東部變成鐵板一塊。
錫拉庫扎的大軍開始征服一個個西凱爾人的城鎮，如摩甘提那、凱法羅伊狄昂、赫那等，也逼迫更多的西凱爾勢力與他簽署了附屬協議。
他還包圍希米爾科爲西凱爾人修建的唯一的海濱城市——陶羅美利昂，只是一時未能攻下。
到第二年（即公元前396年），錫拉庫扎的勢力已經向北擴張到西西里東北角。
在迦太基焚燬的廢墟上，狄奧尼修斯重建了墨西拿，而新墨西拿城的居民構成是由錫拉庫扎的盟邦洛克裡和麥德瑪的殖民者，這主要籠絡他在大希臘的盟友，同時還有剛被斯巴達人趕出原居地而居無定所的幾百名美塞尼亞人，這樣的新住民跟利吉姆人再無一點親緣關係。
但很快，斯巴達人就派來使者，對狄奧尼修斯將斯巴達的仇敵安置在如此重要的城市裡表示了不滿。
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