5月18日，由中國海軍聯合艦隊第三艦隊保護，中國血軍58軍、59軍開始向臺灣前進，臺灣馬上就會成爲日本丟失的籌碼。
伊藤博文不能再等待了，他立即致電給日本駐華大使，希望立即與中國進行和談。
曹躍不是不能和談，畢竟談判纔是代價做小的政治鬥爭手段，上兵伐謀，逼迫日本交出臺灣，會讓中國方面省去了多少戰爭經費。根據曹躍智囊團的估計，如果戰爭持續下去，那麼大清國最多可以堅持到明年3月份。所以曹躍也希望儘快結束戰鬥，恢復國內經濟生產，甚至於中國想要恢復到戰前的經濟水平，還需要四年的時間。
作爲統治者，曹躍不可能把這個國家砸得稀巴爛，所以曹躍接手日本的和談，可是雙方關於10億日元的賠償，日本政府表示無能爲力。
隨後曹躍提出，如果日本不接受10億日元賠償，可以象徵性地賠償兩億日元，讓中國政府能夠面對國內高昂的民族情緒有所交代，另外需要割讓幾個島嶼給中國。曹躍提出的島嶼包括日本手中佔有的關島、庫頁島、千葉羣島等地方。
其中庫頁島有被俄國人成爲薩哈林島，是俄國人關押流放人員的島嶼，也是俄國人在四十年前佔領的島嶼，這個島嶼上只有一些當地的土人，不是中國人的領土。後世很多人一致認爲庫頁島是中國的領土，可是中華歷史上從來沒有任何一任政府對庫頁島進行過統治，他們就像是尼泊爾、不丹、暹羅一樣是中國的朝貢地區，而庫頁島之所以爭議很大，是因爲在庫頁島還沒有形成國家，由十幾個部落組成的部落聯盟對大清國進行朝貢，還讓大清國很不滿意。因爲庫頁島的部落送來的無非就是海蔘海貝，但是從大清國討走卻是真金白銀。而真正對庫頁島有效統治的反倒是日本，明治維新之後日本就將手伸到了庫頁島，庫頁島的部落民族誤以爲可以糊弄大清一樣糊弄日本人，卻不料日本人不是把他們當做僕從國，而是當做本土來對待，並且派遣軍隊進入庫頁島。當然，日本人也並沒有真正在意，甚至於日本在北海道都沒有多少軍隊，更別說更北方更冷的庫頁島了。
在俄國人來到之後，並且強制性地和中國簽訂了協議，將庫頁島劃歸到俄國領土內，狠狠地擺了日本一道。大清國將自己統治不到的庫頁島交給了俄國人，而俄國人上島之後將日本人全都趕走了。由於俄國人的強大，日本不得不忍氣吞聲，拱手將庫頁島讓給俄國人，所以日本人對俄國人的痛恨由來已久。在日俄戰爭開始之後，日本就重新佔領了庫頁島，如今中國提出索要庫頁島，正好讓日本人把這個麻煩還給中國人，順手還二次答應將庫頁島再還給俄國人，給中俄之間製造矛盾。
5月20日，中國血軍47軍全部佔領仁川，隨後向平壤開始進攻，日軍大驚失色，日本朝鮮軍不得不向南方撤離，撤向釜山方向。
日本朝鮮軍的撤退使得日本滿洲軍成爲了一隻車頭徹底的孤軍，而朝鮮半島上烽煙四起的大起義也讓日本人寸步難行，俄國人趁機連戰連捷。
5月22日，中國駐俄國大使顧慶英立即拜見尼古拉二世，提出中國受到英美法德的威脅，不得不和日本和談，但是中國會暗中幫助俄國人，全力協助俄國人佔領朝鮮半島。作爲補償，中國政府完全放棄朝鮮利益，將南北朝鮮即整個朝鮮半島全部交給俄國人。當然，中國也提出自己的要求，即中國希望能夠擁有庫頁島用來遏制日本人的發展，中國收復臺灣島與庫頁島之後，將成爲一南一北兩隻大鉗子將日本牢牢遏死，永遠難以翻身。
尼古拉二世身邊同樣也是一羣智囊，儘管這些智囊有的時候出於驕傲自大之中，但毫無疑問他們並不愚蠢，中國一旦撤軍，那麼俄國勢必會獨木難支，俄國人也打算停止進攻。而是俄國人的利益需要補償，既然中國決定將朝鮮半島交給他們，所以俄國人也不可以，提出中國人只能等待消滅日本在朝鮮半島的軍隊之後，再與日本進行和談，否則俄國人絕不接受，並且將私毀《中俄停戰條約》。
電報穿回到中國首都北京之後，軍機首輔大臣曹躍也對尼古拉二世的小算盤頗爲不滿，讓我們替你們打下朝鮮半島是不可能的，他已經決定47軍從朝鮮半島撤軍了，但是在此之前，他還是禮貌性地將朝鮮半島的起義軍組織起來，在民間據說找到了一位李氏朝鮮王國的繼承人，重新建立朝鮮王國，並建立朝鮮御林軍，進行收復朝鮮半島的行爲。同時，中國出面幫助朝鮮王國與俄國人進行私下的聯繫，畢竟俄國人不可能真的佔領朝鮮半島，他們也需要扶持朝鮮人當做傀儡。
朝鮮王國與俄國一拍即合，開始了全面的合作，隨着俄國士兵從鐵路以及海運源源不斷地運抵朝鮮半島，中國人的作用逐漸消失了。
此時中日談判已經到了尾聲，1905年6月28日，中日在日本下關（馬關）再一次簽訂了中日停戰條約，即《新馬關條約》。
《新馬關條約》主要內容是：
一、日本賠償中國軍費2億兩日元，共分五年償還，第一年償還兩千萬日元，第二年償還三千萬日元，第三年償還四千萬日元，第四年償還五千萬日元，第五年償還九千萬日元。（保函一千萬日元利息）
二、臺灣、旅順、澎湖列島、庫頁島、關島、北馬利亞納羣島、千葉羣島以及奉天省內一切土地資源，全部由日本歸還給中國，歸還時間爲7月12日。
三、中日雙方釋放對方戰俘，中國方面需保護旅順日軍守備部隊安全從旅順大連撤退到日本本土。
四、免除日本商人在中國的治外法權，僅日本大使館以及領事館工作人員部分人員享有治外法權。
五、日本軍隊不得除非受到中國政府邀請，不得進入中國領海、領土以及領空，否則將視作破壞《新馬關條約》，同樣，中國軍隊也不進入日本領海、領土、領空。