順治三年（南明隆武二年，1646年）五月，降清的明臣洪承疇向清徵南大將軍多羅貝勒博洛提出招降鄭芝龍的建議，與招撫福建御史黃熙胤（晉江人）寫信勸鄭芝龍降清。
六月，清軍兵分兩路由仙霞關、分水關進逼福建。
鄭芝龍此時已經得到了貝勒博洛的允諾，要封他爲閩粵總督。
他決定投降滿清，和兄弟鄭鴻逵（原來叫鄭芝彪）串通好了，擁兵不進。
八月，鄭芝龍盡撤水軍回晉江安平，有船五六百艘；鎮守仙霞關的鄭鴻逵聞訊也立刻逃跑，滿清兵不血刃陷仙霞嶺。
隆武帝空有大志，手裡沒兵沒將，只有跟着他的黃道周等一般文臣有個屁用？他只能逃跑。
跑到汀州，被執，後絕食死於福京。
九月十九日，清徵南大將軍多羅貝勒博洛統兵佔福州。不久，清兵乃疾取興化、泉、漳諸郡縣。
同月，博洛遣泉州紳士郭必昌持書往安平招撫鄭芝龍，鄭芝龍不顧其子鄭成功苦諫，於十一月十五日北上福州降清。
十一月三十日，清兵進劫安平，翁夫人（田川鬆）未及逃出，恐受辱，乃自縊而死，享年四十五。
洪承疇看的是真準啊，鄭芝龍常年在海外爲盜，心裡早就沒有了國家概念，有的只有自身的利益最大化。
扶保隆武，也是爲了奇貨可居，將來成爲開國元勳，可以最大化鄭氏海盜集團的利益。
後來看到清軍實力不俗，遠超他的想象。見局面不利，就後悔把朱聿鍵給弄回來了。
這時候，洪承疇給博洛出主意，假意答應給鄭芝龍個閩粵總督的高官，此正中其下懷。
能繼續統治閩粵，他幹嘛要冒險對抗清軍？“明朝清朝有啥區別，投誰不都一樣？”
結果是這位聰明的大海盜沒玩過博洛後面站着的洪承疇，一到福州，博洛就變了卦，沒什麼閩粵總督了，直接把他給送北京去了。
朱棣的子孫裡，好歹出位英明後人，還讓鄭芝龍給坑死了。
到這時候，長江以南基本沒有大的抵抗力量了，多爾袞就想起來不服他的那位，盤踞四川的大西皇帝張獻忠來了。
可這位大西皇帝號稱黃虎，聽說比李自成還厲害，不是那麼好惹。
不能派阿濟格和多鐸去，這倆活寶打仗是沒得說，不着調惹禍也沒得說。
萬一倆人在四川幹不過張獻忠，後果不堪設想。
多爾袞琢磨半天，還是派豪格去合適。仗打勝了更好，打不勝，正好可以藉此治他的罪，讓他永世不得翻身。
豪格這次跟着滿清八旗進入中原，屢立戰功，論功行賞，多爾袞不得不恢復了他肅親王的王爵。
但有這麼個政敵在眼前晃悠着，他總有如芒在背的感覺。
他在攝政王府裡傳了聖旨，封豪格爲靖遠大將軍，與衍禧郡王羅洛渾、貝勒尼堪等一起西征，務必剿滅張獻忠，不得有誤！
豪格率大軍出京，一路直奔西安。
這時候的陝西及其周圍，當時已經投降滿清的的賀珍、羅岱等人，在阿濟格和多鐸先後率滿清主力走後，看着這一帶空虛，沒了清軍，又變幌子自立爲王了。
流寇的毛病就是這樣，打不過你我就投降，你走了我繼續造反，纔不管你是大明還是大清呢。
賀珍、羅岱、孫守法等佔據漢中、興安，武大定、高如礪、蔣登雷、石國璽、王可成、周克德等人佔據徽縣、階州，又是一片混亂。
豪格率清軍自西安分兵進擊，派尚書星訥等人在邠州破敵，又派遣固山額真都類攻打慶陽。
這幫人一看，好麼，大清軍又殺回來了，投降的投降，逃跑的逃跑。豪格又把這些地方重新收歸大清版圖了。
陝西的情況，王爍是知道的。爲不引起多爾袞注意，他故意按兵不動。
原本還以爲賀珍這幫人能抵抗一陣，消耗些清軍實力呢，這下好，直接不禁打，樹倒猢猻散了。
豪格得了多爾袞的命令，沒有入侵和陝西相連接的王爍地盤。
在肅清大順軍殘餘之後，豪格留下少部兵力，協同投降的漢官鎮守陝西一帶，自己親率滿清主力，於當年十一月自漢中向四川進軍，征討大西皇帝張獻忠。
滿清討伐張獻忠，多爾袞已經寫信向王爍通報了，一來試探一下王爍的態度，二來還是要勸王爍儘早接受朝廷封贈，歸順滿清。
王爍也明白，脣亡齒寒。多爾袞消滅了張獻忠，下一個要消滅的，肯定是他。
張獻忠在四川鬧了個烏煙瘴氣。他佔據了四川大部地區，由“流寇”轉爲“盤踞”。
“盤踞”你就得設官吏管理地方，設法增加所管理地方的出產。有了出產，有了物資，你才能待下去不是？
人家張大皇帝到處流竄慣了，腦袋裡根本就沒有這個概念。
明朝那套官老爺制度，張大皇帝恨透了，肯定不用。他自己大老粗一個，又沒有什麼章法，這就麻煩了。
琢磨半天，他還是把李自成那套搬出來了，“三年免徵”。
軍隊得吃飯呀，你不徵他們吃什麼呢？這位愣是沒往那裡想。
一開始，他流竄各地時搶了不少財物糧食，倒真不用麻煩老百姓，老百姓也是真心擁護他。
搶掠來的物資再多，也架不住這麼多人吃馬嚼。慢慢的，物資消耗的差不多了，眼看大家要餓肚皮了，怎麼辦？
人家張大皇帝也有辦法，搶自己地盤裡的百姓，而且還規定了搶劫的日子，三六九不搶，其餘是搶劫日。
額滴個神，還有這麼幹的。古今中外，上下五千年，還沒有一位大神能想出這麼好的主意，這主意愣是讓咱們張大皇帝給想出來啦。
老百姓也不傻，慢慢就摸着了大西軍的搶劫規律。你搶劫的時候我藏起來，讓你找不着我，看你怎麼搶？
大家一看，這麼着搶不着了，還得捱餓呀，那就不管什麼搶劫日了，天天搶吧。
亂套了。天天搶，不給就殺，整個四川一下子就亂成了一鍋粥，百姓到處躲藏，連地都沒法好好種了，大量耕地變成了荒野。