袁崇煥的所爲很快的便是傳到了京師紫禁城，此時朱由校正在和孫承宗和徐光啓還有熊廷弼三人在左順門中商議着官制改革的事宜。
“皇上，微臣覺得這內閣應該還是喚着內閣！”孫承宗臉無表情的說道。
徐光啓接着孫承宗的話說道：“不對，既然要官制改革，自然要有些變化，這內閣從太祖開始便是不斷髮展變化的，如今爲何還要死守這一名稱！依微臣的意見，還是改爲總理衙門好了！”
朱由校看着孫承宗和徐光啓總是爲着這麼些小事爭論不休，有些頭痛，便是對着熊廷弼問道：“熊愛卿覺得呢？”
熊廷弼進京有些時間了，對朝廷的各種關係都是有了瞭解，對於孫承宗和徐光啓之間的矛盾，熊廷弼是不願意參與的。
“皇上，這些是官制改革的細枝末節，不是今日辯論的重點，似乎無須這般爭論吧！”
熊廷弼這話一說，倒是讓孫承宗和徐光啓停住了嘴。
“這些還是朕來決定，你們就不用爭論了，朕要知道這官制改革到底什麼時候能夠完成啊！這時間一日一日過去，但是朕看你們的進展實在是……”朱由校現在已經有些懷疑孫承宗等人在給自己使絆子，故意拖延時間。
孫承宗這時看了看熊廷弼，心想看你如何處理，而熊廷弼顯然早有準備。
“皇上。??這官制改革進展雖然慢些，但是卻沒有什麼困難，只是工作量比預想的大了很多，如果重新構思一套行政系統地話，這樣整個改革的成本太高，所以微臣一直在仔細研讀皇上給微臣的提綱，微臣覺得皇上的很多看法不切實際！”
朱由校倒是有些着急。??那可是自己辛苦工作的結晶，自己苦心鑽研了半月。??還花了三四個月的時間來修改，纔是提出了那麼一份提綱，現在倒被人說不切實際，不由的有些惱怒地問道：“有什麼不切實際，你說來聽聽！朕倒要看看你能說出什麼來！”
熊廷弼還是不溫不火的回道：“像皇上所說地要成立立法院，微臣便是覺得不實際，立法院的院士由百姓層層選出。??這樣最後選出的還不是各地的大儒、鄉紳，這些人去修改大明律法就更是不切實際了，怎麼能期望這些人去修改大明律法這種祖宗留下來的東西呢，這些人懂麼？”
朱由校自然知道明朝人的素質還沒有到能夠實行民主的地步，而且朱由校也沒有實行那些虛僞地民主的意思，開玩笑，皇權這個東西有時候你會覺得厭煩，但是真的要你放棄。??那可是根本不可能的事情。??而朱由校搞上這個立法院的目的不過是淡化都察院的權利。
“那愛卿以爲應該如何？”熊廷弼也算是自己人，朱由校沒有必要爲了熊廷弼的一句話生氣，而且熊廷弼這種人浸淫官場幾十年，自然有他地獨到之處。
“微臣的意思是，這個要有，但是不能是現在。??至少第一次官制改革的時候不能有！”
朱由校的計劃是預計三次大的改革搞定，每次都有各自改革的重點，第一次重點清理內閣六部，第二次重點是大理寺和都察院這種衙門，最後一次便是完全完成。
朱由校這時候拿起一份摺子，稍微看了看說道：“那愛卿地意思是去處這個立法院，然後把六部各自拆分，再新設一些衙門，如果僅僅這般的話，便是沒什麼改變了！”
熊廷弼這時候卻是從衣袖中拿出一個紙片。??開始念道：“皇上。??首先內閣要變成常設機構，設立官署。??大學士品級一品，負責提供決策以供皇上參考，草詔，票擬和批答，通政司合併至內閣，內閣便有了收發本章的權利，然後內閣還要保存皇上的印章，這樣司禮監便可以撤除！而皇上所說的立法院的立**能也劃歸內閣……”
朱由校越聽越是覺得不對勁，怎麼越聽越是趕緊像是國務院似的，這樣一來自己這個皇帝到底幹什麼去了，不行，這可是明擺着削弱自己的君權，要是剛剛登基那會自己還會有君主立憲制的想法，可是過了一年多的帝王生活之後，朱由校已經捨不得這世人羨慕地皇權。
“在這奏摺裡，六部地改革朕沒什麼異議，愛卿的提案僅僅比朕少增設幾個衙門而已，那些都可以放置以後再說，可是內閣似乎不大合適！還要回去再議！”
孫承宗可不是熊廷弼，熊廷弼和朱由校接觸地時間斷，對朱由校根本就不瞭解，但是孫承宗可不一樣，孫承宗可是朱由校登基以後第一個信任之人，因此朱由校的那些奇異東西孫承宗見識了許多，如今熊廷弼把朱由校的想法改的亂七八糟的……
“皇上，這些微臣也是覺得不妥，還要回去再商議商議，反正距離皇上給定的時間還有半月，這些微臣和熊廷弼一定會商議好的！”
這時候李進忠在門外晃了晃，見到裡面氣氛有些不對，便是懾手懾腳的走了進來，徑直到了朱由校旁邊，放下手中的奏摺，輕聲說道：“皇上，這是錦衣衛張玉庭的奏摺！”
朱由校接過李進忠手中的奏摺，認真的看了一遍，然後笑着說道：“這袁崇煥還是有些意思，臨陣還能作出這麼多花樣了，不過倒是有些期待！”
衆人都是一陣納悶，前些日子朱由校一直記掛着聞香教的事情，每日都是拉着臉，這幾日怎地突然高興起來了。
“這袁崇煥竟然因爲京營的士兵在當地欺壓百姓，將二十幾個千把總打了四十軍棍，還將一百多個百戶抓進了大牢，估計過上幾個時辰內閣便能夠收到袁崇煥的奏摺吧！這樣雷厲風行的性格，朕很欣賞，大明就是缺了這麼有血性的官員！”
衆人都是一陣譁然，這袁崇煥可是太過大膽了，這京營的千總那個不是後臺極硬，這回袁崇煥得罪的人可不是一個兩個，估計大半個朝廷的官員都是讓袁崇煥給得罪了。
袁崇煥算是孫承宗的門生，此刻見到袁崇煥做了這般的事情，便是試探着問道：“皇上，如今前線交戰，袁崇煥這般做不是自損士氣麼？”
朱由校心知孫承宗關注袁崇煥，可是自己比他還關注呢，這回的事情還不是自己逼出來的，要不是自己讓張玉庭一直給袁崇煥暗示，那袁崇煥那裡敢做這般驚天動地的大事，於是笑着說道：“朕倒是看不出來，要是部隊需要搶掠自己百姓來激發士氣，那這種部隊朕還要它作什麼？說到這裡，徐愛卿，等這聞香妖教剿滅之後，還有遼東的奴酋的問題處理乾淨之後便立刻進行兵制改革！看着京營的紀律，朕才能想到爲什麼我大明的軍隊爲什麼以前接連敗與後金手中！”
徐光啓這時忙是回道：“皇上，兵制改革的事情已經準備的差不多了，像廣東，江西這些比較安穩的地方已經開始推行新兵制了！所以的軍隊改革在三個月內完成一半，剩下的一半在一年內完成！”
朱由校聽完點點頭，然後說道：“兵部的尚書崔景榮朕也罷免了，如今愛卿你可沒有什麼藉口了，好好的辦好這個差事！那熊愛卿，你接着說！”
熊廷弼被朱由校這麼一打岔，加上又被朱由校否決了改革內閣的決議，不由的一陣氣餒。
“皇上恕罪，微臣最大的分歧便是內閣了，如果這個皇上不同意，那微臣便覺得其他沒什麼好說的了！”熊廷弼就像是茅坑裡的石頭，又臭又硬。
朱由校也是無奈，溜鬚拍馬的官員沒什麼實力，自己不喜歡，但是能言善柬的官員又是太過剛硬，也讓自己不爽。??像內閣的五個大學士，除了孫承宗和徐光啓又有實力脾氣又好，但是兩人之間又是矛盾不斷，剩下的韓纊和劉一燝屬於實力不強型，而熊廷弼便是脾氣不好的，反正五個人沒有一個讓朱由校舒心的！
朱由校知道今日估計又是白搭，白白浪費了一個上午的時間，便是沒好氣的說道：“好了，都回內閣去好了，安心把自己的本職工作做好，至少在內閣改制之前要給朕好好做！”
孫承宗等人雖然心中有很多事情要說，但是現在朱由校顯然不想議事，也只好行禮離開！
…………
楊肇基本來以爲自己拖延拖延時間可以爲難爲難袁崇煥，但是事實完全不是這樣，六七萬大軍中能夠聽楊肇基等人的有幾個，這些牆頭草便是這樣，給點顏色便是老實了，袁崇煥的嚴酷執法雖然沒有將這些兵痞的根性改變，但是卻讓這些兵痞老實了下來。
袁崇煥的三日之期當然沒有辦法實現，楊肇基等人不是隨便嚇唬嚇唬便能解決的，但是就在這時候，朱由校竟然快馬給袁崇煥送來了尚方劍，這樣一場鬧劇便是以一場悲劇收場，袁崇煥手中有了尚方劍，這鄒縣、嶧縣兩地怎麼會是火銃大炮的明軍的對手。
大明天啓元年十月六日，明軍攻陷鄒縣，是役，明軍陣亡八百餘人，傷二千多人，而徐鴻儒的聞香教叛軍傷亡上萬人，徐鴻儒被生擒！
徐鴻儒的暴亂沒有傷及大明這個腐朽落後的封建皇朝的根基，在朱由校的親自指揮下，雖然數萬無辜百姓被殃及，但是這次殘酷的鎮壓無疑給朱由校贏取了很多改革的時間。
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