其罪三、東林黨撤銷監察機構，官員貪污現象加劇。
天啓皇帝駕崩後，以魏忠賢爲首的閹黨迅速倒臺。至天啓七年（1627年）十二月，閹黨基本被清算一空，於是崇禎帝組建了一個全新的，以東林黨爲首的內閣。
東林黨人認爲東廠等特務機構對官員的監察，就是對他們道德操守的嚴重懷疑，是對善於“修身”的讀書人的一種侮辱，於是在這個全新內閣的建議下，崇禎撤銷了東廠這個最大的監察機構，還有撤銷分派往各地的其他監察機構和監察太監，例如各省的河道太監、茶稅太監等。
傻乎乎的崇禎，後來大家對比東南府，發現這個傢伙收稅收得狠，而且成立了有史以來中國最大的情報系統保障了他的、東南府的安全，高下之分，皇帝不如小海賊！
之前嘉靖皇帝懷疑河道官員貪墨治河工款，於是派遣太監監督河工，這種監察讓各地官員“深惡痛絕”，於是隆慶時期便被廢除。萬曆皇帝親政後，他要求各地河工款項一律要交由太監過目，甚至規定，一旦洪水過堤，則立即處死監督太監。
皇帝想殺臣民，並不是想殺就能殺，但TJ是家奴無人權，皇帝可以隨便處置。
這個做法極大的“激發”了監督太監的工作熱情，他們極力敲打工部和地方官員，這再次遭至了東林官員的憎恨，於是天啓朝後河道太監再次被廢。直到魏忠賢掌權之後，河道監察太監製度纔再次恢復，不過隨着魏忠賢閹黨的失勢，這項制度再次被廢。
河道監察太監的被廢，直接導致從天啓元年開始到天啓六年魏忠賢掌權之前，全國上下河道修繕基本荒廢。而在崇禎撤回河道監督太監開始到李自成攻破京城爲止，十七年間河道的修繕再次被荒廢。
河道不修繕，河流決堤，形成水災，災民流離失所，活不下去，那就反了吧！
預防永遠比事後補救要省錢和有效得多，可是東林黨的袞袞諸公都看不到這一點。
其罪四、明末農民起義同樣與東林黨人有脫不開的干係
明朝滅亡，除了遼東與後金的戰局不利外，最重要的原因就是明末天下各處的農民起義，而農民起義的全面爆發，同樣與東林黨人密切相關。
工商稅的減少導致西北農業稅加重，百姓苦不堪言。明末時期，南北發展差異巨大，北方依舊主要以傳統農業爲主，而南方的工商業則極爲發達。而由於進入崇禎年間工商稅再次被廢除，且各地稅監被撤回後，導致朝廷茶稅、礦稅、海關稅等稅收急劇減少，例如到崇禎十年（1637年），僅浙江一省的茶稅就從萬曆、天啓年間的二十萬兩降到了每年十二兩白銀。
區區12兩白銀，一省的茶稅，這可是出產茶葉的大省！
單是浙江的一個富春江茶就是一等品，你得明白，顏常武大力開拓茶路，得到了紅毛番的積極響應（尤其是紅毛番貴族，他們吃肉多，吃蔬菜少拉屎不出，喝茶就通便），一等品的茶葉賣到歐洲，甚至是一磅茶葉一磅白銀，極品的是一磅茶葉賣一磅黃金！
明末由於小冰河時期的影響，天災不斷，再加上遼東戰事緊張，朝廷處處要用錢，導致國庫極爲緊張。於是朝廷支出的重擔就壓在了農民身上，農業稅從張居正時期的二百萬兩，一直攀升到崇禎十二年的兩千三百萬兩，這還是在各地大災小災不斷的情況下，這導致北方百姓尤其是西北百姓苦不堪言，簡直到了賣子賣女也交不起稅的地步，百姓活不下去，豈能不造反。
更有甚者，朝廷通過節省開支來維持運轉，然而即使“節流”，東林黨人也不願觸及自己的利益。在東林黨人的主持下，“節流”被加在了基層小吏身上，例如驛站制度的改革，精簡驛站支出。於是原本爲銀川驛站驛卒，以爲捧着鐵飯碗的李自成同志，就這樣地光榮下崗了，沒了工作的他，越混越回去，走上了造反之路，最終把他以前的大老闆給送上了黃泉路。
……
朝廷明刑正典，宣佈東林黨爲逆黨，將東林黨諸人無論活的死的統統打入黨冊，褫奪死者生前一切榮譽，剝奪生者一切榮譽，沒收家產，九族流放東南亞！
良心話來說，東林黨有的地方還是委屈的，譬如崇禎皇帝在發現了東林黨的真面目後，疏遠了他們，把東林黨領袖錢謙益給送回老家讓他去秦淮河吹風了，皇帝對於東林黨的話也不大聽了（但還是顧忌着他們，他們的噴功太厲害了）。
但是呢，東林黨倒黴是喜大普奔的事情，皇帝掛了總得有人來背鍋，就他們了！
東林黨號稱清流，影響天下輿論，一副老子天下第一的派頭，對誰都說三道四的，見到不合心意就狂噴，早就引發了勳貴、TJ集團和其他文官集團、武將們的嚴重不滿，說他們遍地是敵不爲過！
不多說什麼，單是一個裁撤驛站，讓多少的官員在路上奔波，沒有公家的支持，辛辛苦苦，連個安心睡覺和飯的地方都沒有，徹底地失去體面，又讓多少官員們失去了一個可以進項和安排自家人手的地方。
天底下的官員永遠都是對於新增一個機構強烈支持（多了位置出來！）對於裁撤一個機構而大力反對的，僅此一項，東林黨就得罪了天下的官員！
所以對於永明帝的旨意，舉朝上下一片歡迎，熱烈擁護！
名聞天下的“東林書院”在五月十八日一個很吉祥的日子迎來了它的末日！
東林書院，位於江蘇無錫，亦名龜山書院，建於北宋政和元年即公元1111年，是當時知名學者楊時長期講學的地方。
臨伯瀆港，前臨清流，周圍古木森天與鬱鬱蔥蔥的廬山東林寺頗爲相似，是一個研究和傳授學問的理想場所，
明朝萬曆三十二年，也就是公元1604年，由東林學者顧憲成等人重新修復並在此聚衆講學，他們倡導“讀書、講學、愛國”的精神，引起全國學者普遍響應，一時聲名大著。
顧憲成撰寫的名聯“風聲雨聲讀書聲聲聲入耳，家事國事天下事事事在心”寫得確實有水平，可惜事與願違，東林黨淪爲江南士大夫爲主的官僚政治集團，更看中自己的官品、官位、利益。
諷刺的是，當他們打倒了他們的閹黨大敵，打倒了許多政敵，把朝中的宣黨、浙黨、楚黨、齊黨一古腦兒地趕了下臺，沒有了敵人，就輪到自己被消滅了。
刨了東林黨老巢的正是明末名人，前東林黨人士阮大鋮！
隨着他意氣風發的一聲令下：“拆！”
民工們蜂擁而來，名聞天下的東林書院被拆成一片白地。