至於正一品正二品的等級，乃是散官階級，即寄祿官（發工資的等級），顏常武正式設置文武官員分等，其中文官分爲1等文官到29等文官，數字越小官越大。
還是復古，這回用上了唐代的散官制度進行參照，即唐朝散官從從一品的開府儀同三司開始直到從九品下的將仕郎，共有29等級，其中從一品的開府儀同三司即1等文官，將仕郎爲29等文官……
再有文官官制（實職），初步設立爲軍機處乃是處理軍政事務的中樞，軍機處設置有首席執行官、首席運營官、首席財務官、首席人事官、首席參謀長；分別爲陳衷紀、洪昇、陳和彬、陳衷紀和甘輝。
軍機處的職責權勢一如明朝的內閣，協助督軍處理東南府的軍政事務，有票擬的權利，但無副署權。
在收到各部、各地的行政文書後，軍機處進行初步處理，其建議寫在一張紙上，貼在行政文書的上面，這叫做票擬。
之後督軍用紅字做批示，叫做批紅。
因此軍機處負責督軍下達的命令及參預官員上報文書的處理，還有督軍交議的大政，可進行重大案件的審理，官員的任免，財政支出，還有軍務參預之權。
由於東南府督軍長期在外，因此軍機處代辦軍政事務，等督軍回來，一一確認，所以軍機處權柄重大。
但是，督軍所下達的命令（不能說是旨意，因爲沒造反），哪怕與軍機處相左（不同），亦可推行，亦即軍機處無副署權。
副署權，如唐宋朝，皇帝與宰相共治天下，皇帝旨意如無宰相副署，則無實效，朝臣可以不認這個旨意，此乃皇帝自我約束，遂行兼聽則明，但顏常武不會給自己找不自在，即臣下有不同意見，可以“保留意見”，但必須執行，
顏常武以東南府初創，豈可學明朝內閣、清流（明朝的各部給事中有封駁權）進行掣肘，且東南府創立是新鮮事務，遇到事務可以來“摸着石頭過河”，又或者是“交學費”，反正顏大少還年輕，耗得起。
下設人事部（吏部）、戰爭部（兵部）、財政部（戶部）、文教部（禮部）、政法部（公檢法）和建設部（工部）共六個部，主官稱爲部長，還有一些獨立的部門，如第一要緊的參謀部，有出兵權；還有首席技術官，是荷人巴倫支出任。
由於官員嚴重匱乏，人事部是陳衷紀管着，戰爭部是顏常武自管，財政部是陳和彬、文教部則是徐柏森和張小石合作（兩人都是海澄人，顏大少的同鄉，秀才出身，做過簡體字事務），政法部（公檢法）則是張寅建設部還是陳衷紀兼管。
政法部的是張寅，乃閩省福州人，開臺元老，乃初代顏思齊的兄弟，是最早支持顏常武的人之一，最初名聲不顯，去跑船爲生，後被陳衷紀推薦從政，其性格剛毅，可坐政法部。
再設立部員，多是海軍學院出身，或者軍人退役充役。
實職亦有官品，如人事部長對應的是吏部尚書（明制二品官），爲表示謙恭，不是造反，人事部長爲從二品，對應明朝的官制，同等的幾乎都降一級使用。
再有軍隊，職稱早就確定，即軍銜制，是最高執行的官制。
其爲士兵4級，爲一等兵、二等兵、三等兵和列兵，新兵入營，只是列兵，之後按照訓練的表現和作戰表現，逐步升遷，往上的是士官三級，爲上士、中士和下士，之上的就是軍官了，有尉官四級，爲上尉、中尉、少尉和准尉，其中准尉又分爲5級，校官爲上校、中校和少校，再有尊貴的將官，是四星上將、三星中將和二星少將，最後是一星准將，最尊貴的是元帥，是最高軍銜。
實職則有海軍提督、副提督，參謀部正副參謀長、分遣艦隊司令，艦長、高級軍官等。
巡航艦艦長軍銜爲少校，副艦長爲上尉，高級軍官爲上尉和中尉，軍校生的軍官專業出來考取少尉資格證書。
戰列艦艦長軍銜爲上校。
……
至此，東南府的官制爵位確立，顏常武根據自己的知識，做出一個四不象，他自得其樂，部下甘之如飴，明朝士大夫階層則嘲笑這是一個草臺班子，不倫不類！
顏常武又確立祖宗家法：“凡爵非社稷軍功不得封，封號非特命不得予。”
即只有軍功纔可以封爵，又或者是重大的事涉社稷大事的才能封爵。
軍人可以封爵，但軍機務幾個要員也不怕，他們頭上頂着“軍機”的字樣，爵位是跑不了。
再有“各職部主官一任五年，只可二任！”
亦即主官最長十年，象陳衷紀現在權勢赫赫，但也只能風光十年，就要輪到其他人上了。
大家偷眼望向陳衷紀，卻見他表情穩定，沒有驚詫之感，顯然顏常武與他作了溝通。
他都沒意見了，其他人也無話可說，這個祖宗家法就此確立。
……
官制爵位確立，軍機處奮鬥了幾天，拿出初步方案，各官按官職一一對稱入座就位。
最激動的是爵位，以這次巴達維亞大會戰開始授爵，有：
軍機處陳衷紀、洪昇、陳和彬和甘輝，以及副參謀長斯托姆，出謀獻策，調度運轉，功在東南府，皆封簪嫋（三等奉國將軍，正三品，相當於4等文官）
參加巴達維亞大會戰，表現優秀的高級軍官如顏東來、肖長榮、西雷斯馬、戴維先生等，封了公士（最低的爵位，相當於品輔國中尉，相當於18等文官）
表現最突出的洪熙官，因其巨大的勇氣和謀略，成爲東南府封爵的第一人，被封爲官大夫（三等男爵）。
他是第一個擁有正式爵位的，榮耀無比！（男爵之上纔是正式爵位，其它的都是預備級）
他爵位比他的父親洪昇還要高，真正是青出於藍而勝於藍了。
大家記起他以前姓名叫做“洪官”，與父親合起來爲“升官”，結果顏大少看不過眼，給他改了名字，叫做洪熙官，就升官發財了。
一些傢伙記掛着此事，都找顏大少，想讓他給他們的孩子也來改改名，改改運！
當然顏大少讓他們快爬！
跟着他的左良玉和顏彰也發財了，他們一個是外將來自寧遠軍，另一個是小毛頭，爵位也是簪嫋（三等奉國將軍），與軍機大員們同列。
充分地表明瞭軍功第一！
這下東南府轟動了，有爵位的自豪，無爵位的眼紅無比！
這可是爵位，當前利益表現爲雙份工資，即即職務工資，又領爵位的薪水。
更可傳之子孫，與國（目前還是東南府）同休！
如唐太宗進行科舉，稱天下人才都入朕手。
東南府軍功爵位一出，立即在軍隊中引起了強烈反響，大家想的是努力戰鬥，搏個爵位。
如今相當於開國，爵位相對容易拿，現在不爭，更待何時！
就連行政系統中的一些人，因軍官出身的正途是軍校，也跑去報考軍校，想要參軍！
軍校一時間大熱，報考分數居高不下，篩選嚴格，就在這種背景下，迎來了一批免試入學的幸運兒！