陳瀚指揮海東四路海陸大軍同時出擊，陳寅、劉忠信、楊文率兩萬陸軍收復紹興府，在蕭山縣追上撒施洛統率的一萬餘西班牙大軍及漢奸僕從軍，雙方在蕭山縣即將展開會戰，駐守杭州城的馬丁·德戈伊蒂忙率兩千大軍渡江趕來增援。
陳瀚同陸啓航率海陸大軍一萬五千經杭州灣直奔錢塘江殺來，陸啓航率東海海軍第二編隊六十餘艘戰艦封鎖錢塘江，陳瀚親自指揮六千禁衛軍、御林軍及部分虎賁軍騎兵等陸軍炮軍將士在侯朝門外登陸作戰。
“殺光西寇漢奸走狗，拿下杭州城。”剛在侯潮門外錢塘江北岸登陸的海東將士蜂擁朝着殘破坍塌後被清理乾淨的侯潮門衝殺而來，喊殺聲震天：“衝啊……”
杭州城中只有五百西班牙兵及一千漢奸僕從軍鎮守，杭州城東城牆上的西班牙兵及漢奸僕從軍看着海東大軍蜂擁衝殺而來，漢奸僕從軍嚇得頓時一鬨而散，西班牙將士見漢奸僕從軍逃跑，也跟着逃跑。
六千海東大軍從殘破坍塌的侯潮門衝殺進杭州城來，駐守侯潮門的西班牙兵及漢奸僕從軍紛紛嚇得驚慌失措四散而逃，海東軍迅速控制侯潮門、鳳山門、永昌門城南一帶，王旭率着三千禁衛軍陸軍將士追殺上去。
身穿銀白鋼盔甲全副武裝到牙齒的陳瀚身披大紅披風，胯下一匹棗紅高頭大馬，正騎馬進城，兩千御林軍沿街進城駐守，六百虎賁軍在前開道，六百御林軍在後護衛着六輛美姬們馬車跟着進城，杭州城中城北喊殺聲震天，槍聲、炮聲此起彼伏響起。
王旭秦勇率禁衛軍御林軍及千餘陸軍兵分數路追殺上去，殺得漢奸僕從軍在城中倉皇逃竄，海東大軍迅速控制城中城北大部分城門，走投無路的漢奸僕從軍紛紛跪地磕頭求降：“我們願降，我們願降，別殺我們，……。”
五百西班牙兵慌忙朝着城北武林門逃來，匆忙開城而逃。林勇正率千餘將士駕着十幾艘平底沙船從江南大運河上趕來，見西班牙兵正要渡河，忙下令道：“發炮進攻”
十幾艘沙船上的將領紛紛高呼下令道：“放”
‘轟轟……’沙船上艦炮發炮猛轟武林門外西班牙兵，西班牙兵頓時慘死一片，王旭在後率千餘禁衛軍追殺出城來將還未死透的西班牙兵悉數殺光，梟首城外示衆。
陳瀚收復杭州城後將巡撫衙門及臨近的浙江三司衙門一併徵用當做臨時行宮，陳瀚隨即下令將領嚴加約束大軍軍紀，安撫民心，儘快恢復杭州城秩序。
撒施洛同馬丁·德戈伊蒂統率一萬八千西班牙兵及漢奸僕從軍原本準備在蕭山與海東軍展開決戰，錢塘江被海東海軍封鎖，杭州城被海東大軍趁虛而入攻下的消息傳來，西班牙大軍及漢奸僕從軍開始軍心不穩起來，不少漢奸僕從軍紛紛連夜開溜。
撒施洛同馬丁·德戈伊蒂慌忙在次日一早率近萬西班牙兵及漢奸僕從軍倉皇南逃諸暨縣，陳寅、楊文隨即率一萬六千大軍在後追殺而去。
何崇奇率東洋海軍第三編隊搭載劉雄、鄭彥武統率的一萬虎賁軍騎兵陸軍炮軍將士渡海在海鹽縣海寧衛登陸作戰，何崇奇指揮東洋海軍發炮一通猛轟海鹽縣城，劉雄隨即率虎賁軍騎兵一舉攻佔海鹽縣城，何崇奇隨即率東洋海軍第三編隊主力返回舟山駐守。
一萬餘海東大軍大舉北上收復嘉興府，一路勢如破竹，接連收復平湖縣、嘉興府城、嘉善縣，鄭彥武率三千大軍駐守嘉興府城，出兵南下收復桐鄉縣及湖州府，劉雄率五千虎賁軍騎兵及陸軍炮軍乘勝沿江南大運河北上攻入南直隸，準備收復蘇州府。
吳建從處州府敗逃回金華府，爲提振軍心士氣，籠絡手下，吳建宣佈脫離西班牙遠征軍，在金華府稱帝，國號大吳，大封文武百官，封其弟吳昌爲豫章王，統率五千大軍出兵進攻江西廣信府（上饒），又派出三千大軍進攻南直隸徽州府。
吳建親率兩萬餘白蓮教羅教信徒饑民流民貧苦百姓組成的亂賊大軍在武義縣迎戰正大舉北上進攻的海東北伐大軍陳沖率領的中路軍，陳沖派先鋒將領秦義久率兩千薩摩精兵衝殺在前，一舉擊潰吳建兩萬烏合之衆，斬殺數千白蓮教羅教反賊，趁勝收復金華府。
五千海東北伐大軍中路軍偏師在李固率領下從處州府城麗水北上松陽縣、遂昌縣，翻山越嶺突襲進攻並一舉收復衢州府城西安，接連收復江山、龍遊、常山諸縣，與陳沖大軍遙相呼應，夾攻漢奸白蓮反賊吳建。
吳建面對海東大軍前後夾攻，慌忙率着近萬殘兵敗將逃往嚴州府，撒施洛、馬丁·德戈伊蒂被陳寅、楊文率一萬六千海東大明聯軍一路追殺得死傷慘重，馬丁·德戈伊蒂被陳寅追殺趕來斬於馬下，撒施洛帶着五千殘兵敗將逃到嚴州府城與吳建匯合。
海東軍主將陳沖、陳寅、李固及浙江參將楊文等統率三萬餘大軍進剿敗逃到嚴州府合流的一萬三千餘白蓮反賊西班牙殘兵敗將，吳建、撒施洛面對海東大明聯軍圍剿，慌忙率殘兵敗將沿着新安江逆流北上逃往南直隸徽州府。
吳昌率五千白蓮教反賊大軍攻入江西，一舉攻下廣信府各縣，隨即大舉進攻饒州府、撫州府。遭到劉慶、郭國安、徐爲斌出兵鎮壓的邵武府羅教反賊也紛紛敗退到江西建昌府與建昌府羅教反賊合流，隨即向吳昌請求增援。
劉慶、郭國安率兩萬海東大軍控制邵武府、建寧府北部與浙江江西邊界險要關口，出兵進攻建昌府白蓮教、羅教反賊，劉慶採用攻心爲上，攻城次之策略，對依附反賊生存的饑民流民展開攻心瓦解宣傳，但凡主動投降歸順會得到海東國分配土地糧食，得到不少饑民流民貧民響應主動趕來投靠海東軍。
郭國安、徐爲斌率一萬大軍在江西建昌府城南城擊破吳昌統率的兩萬餘白蓮教羅教信徒饑民流民大軍，斬殺白蓮教羅教骨幹教徒兩千餘人，俘獲一萬餘饑民流民，大挫攻入江西的吳昌白蓮反賊大軍。
江西巡撫莊國楨調集兩萬餘江西明軍同福建明軍海東大軍對吳昌率領的近萬白蓮教羅教殘兵敗將展開圍剿，吳昌慌忙朝着饒州府逃去。
郭國安按照劉慶軍令將圍剿白蓮教羅教殘餘反賊的大好機會留給明軍將士，以防止浙江白蓮反賊進入江西爲由派兵接替明軍駐守撫州府、廣信府。