大明北路徵倭大軍先鋒慘敗平壤，遼東總兵楊紹勳退守義州防禦侵朝日軍北進，同時下令努爾哈赤協助朝廷防禦日軍北進咸鏡道。努爾哈赤已經與侵朝日軍達成議和，正抽兵北上回建州防禦海西女真各部。
平安道、黃海道侵朝日軍並沒有北進跡象，而是調集兩萬餘大軍南下進攻京畿、忠清兩道西部臺海軍及朝鮮義兵。面對日軍反攻，趙憲、靈圭、朱巍、樑雄、陳武立即組織起萬餘民兵緊急操練準備迎戰，同時派出部分將士駐守險要關隘防禦。
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大明官軍圍攻哱拜叛軍據守的寧夏鎮城不下，四鎮總督魏學曾決堤放水灌寧夏鎮城。叛軍也加堤反水淹官軍，故始終未能攻下寧夏鎮城。
進入八月，黃河暴漲決口，大堤毀壞，官軍也遭了秧，不得不修治大堤。寧夏鎮城外水深有八九尺，東西城崩塌百餘丈。
著力兔、宰僧又進入李剛堡，被李如鬆、麻貴等擊敗，被追擊至賀蘭山。叛軍更加害怕，要求和議，明軍對是和是戰懸而未決。
明軍平壤戰敗的奏報星夜兼程送到北京城，內閣代首輔趙志皋剛接到平壤戰敗消息震驚不已，忙派人向皇帝朱翊鈞稟報，隨即召集重臣前來商議應對之策。
文淵閣內閣衙門大堂中，趙志皋端坐上位，閣臣張位、兵部尚書石星、戶部尚書楊俊民端坐左右，趙志皋看向兩人道：“遼東兵兵敗平壤城，侵朝倭寇猖獗如斯！不增派大軍何以平朝鮮倭寇。”
兵部尚書石星一聽代首輔趙志皋要增兵朝鮮，忙提醒道：“元輔，侵朝倭寇猖獗，需得抽調精兵方可一舉平定侵朝倭寇。只是朝廷精銳大軍尚在寧夏平叛，再難抽調精銳大軍平定侵朝倭寇。”
戶部尚書楊俊民贊同道：“東泉所言甚是，戶部也一時難以調集大量糧餉同時多路作戰，何況南路徵倭大軍糧餉供給已是困難重重。”
趙志皋忙問道：“可知南路徵倭大軍進展如何？”
“回元輔，據福建巡撫張汝濟奏報，南路徵倭大軍此時應該也登陸東瀛與倭寇作戰。”張位信誓旦旦稟道：“吾得知臺海遊擊陳瀚此番調集不下六萬大軍隨朝廷大軍征伐倭國，倭國此番定在劫難逃。”
石星聞言大驚道：“想不到陳瀚竟有如此雄厚實力!”
張位陰着老臉沉道：“陳瀚何止這些兵力，他在南洋還有數萬大軍，南洋諸國近半爲其兼併，陳瀚已成尾大不掉之勢，倘若陳瀚再吞併東瀛倭國，陳瀚必將是豐臣秀吉第二。”
“這可該如何是好啊”楊俊民沒想到陳瀚竟在短短不到兩年之間在南洋擴張如此迅猛，真可謂是前所未聞。
趙志皋接連收了陳瀚兩千兩銀子，自是要爲陳瀚說話：“臺海遊擊陳瀚尚無反意，且忠勇可嘉，更何況陳瀚親率大軍隨朝廷徵倭大軍出征倭國在即，今遼東兵兵敗平壤，只有南路大軍擊敗倭國，方能牽制朝鮮倭寇北進。”
石星、楊俊民兩人贊同道：“元輔所言甚是”
張位一臉自得道：“此番陳瀚攻打倭國想必也將會元氣大傷吧”
石星一心都放在徵倭、寧夏平叛戰事上，忙問道：“張閣老何出此言？”
張位見一衆同僚都看向自己，更是得意十足道：“據錦衣衛探知豐臣秀吉有不下三十萬大軍，除掉十六萬侵朝倭寇，尚有十餘萬大軍，陳瀚不過六萬大軍，朝廷就坐等陳瀚與豐臣秀吉鶴蚌相爭，方好漁翁得利。”
“若是南路徵倭大軍徵倭失利，當如何是好。”石星深感擔憂道：“朝廷纔派出兩萬五千大軍，加上陳瀚六萬大軍，共計八萬餘大軍，且糧草輜重供給困難，此番遠渡重洋征伐倭國實爲失策啊。”
當初朝鮮告急，侵朝日軍兵封直抵鴨綠江南岸，大有渡江進攻遼東之勢。大明精銳盡在寧夏平叛，遼東兵力空虛，大明君臣臨時抱佛腳，聽從陳瀚建議渡海徵倭。
“陳瀚就是個瘋子，慫恿朝廷徵倭，靡費錢糧無數，……。”楊俊民也對徵倭戰事深感擔憂，更是對陳瀚慫恿朝廷遠渡重洋征伐倭國，朝廷君臣欣然准許，捶足頓胸呼道：“太祖皇帝將倭國列爲不徵之國，實乃英明決策啊。”
石星一聽這話不滿道：“本菴（楊俊民字伯章，號本菴）此言差矣，若不浮海徵倭，則朝鮮倭寇必趁虛進攻遼東，遼東若失，則京城危也。”
“不錯”趙志皋贊同道：“浮海徵倭乃是廷議決策，實乃明智之舉。”
張位也贊同道：“正是，皇上下令浮海徵倭實乃英明決策。”
趙志皋發現議題嚴重跑調了，明明是議兵敗平壤應對之策，偏偏扯到陳瀚和南路徵倭大軍身上。張位如此做派，想必是沒少收遼東文武孝敬，遼東總兵楊紹勳派人星夜兼程進京送上孝敬，希望能將平壤慘敗大事化小。
自從陳瀚派沈惟敬送上一千兩白銀見面禮後，旦凡想請趙志皋辦事的文武送禮孝敬至少不能低於一千兩銀子，已形成規矩。
“遼東巡撫郝傑與遼東總兵楊紹勳聯名上奏稟明此番兵敗平壤皆因糧草不繼，軍情不實，火器失靈，朝鮮兵附倭射殺遼東兵。”趙志皋看向三人道：“遼東總兵楊紹勳言及此番戰敗皆因火器失靈所致，都說說該如何解決吧。”
石星做過工部尚書，自是清楚遼東兵火器配置還是老舊的三眼銃，遼東兵多是騎兵，對火器根本不重視，遠不如南方的浙兵及薊鎮大軍火器早已以鳥銃、虎蹲炮爲主。
石星提議道：“稟元輔，下官以爲遼東兵火器老舊，且三眼銃射程遠不及鳥銃，下官以爲當爲遼東兵大量更換裝配鳥銃作戰，以應對倭寇火器。”
“東泉言之有理”趙志皋當即贊同道：“那就命工部爲遼東兵調撥一批鳥銃淘汰掉三眼銃”
“是”石星、楊俊民、張位忙領命
趙志皋端起茶杯品茗一口後看向石星問道：“寧夏平叛進展如何了？”
“回元輔，寧夏平叛進展緩慢，叛軍據寧夏鎮城負隅頑抗。”石星對指揮寧夏平叛的四鎮總督魏學曾招撫叛軍上當受騙，就很是來氣道：“總督魏學曾勸降不成，決黃河水灌寧夏鎮城，未能水淹寧夏鎮城。
反倒讓叛軍加堤水淹官軍，真是愚不可及。幸得叛軍韃靼套部援軍已被延綏總兵官董一元擊敗，韃靼部衆大驚逃走，叛軍已失去外援。”
趙志皋拿起幾本彈劾奏疏氣憤不已道：“看看監軍御史梅國禎是如何彈劾魏學曾平叛的，平叛諸將觀望不前，總督魏學曾玩寇。還有給事中許子偉也彈劾魏學曾爲招撫所迷惑，耽誤國事。
梅國楨又上奏彈劾說僉事隨府從城上逃下，叛軍命四人下城捉拿，官軍距離咫尺卻不敢上前救援。而北邊河套諸部數萬人截斷官軍糧道，殺戮無數，魏學曾卻隱匿而不上報。”
總督魏學曾手下都是臨時抽調來的各路大軍將士，明軍普遍都是將驕卒惰。加上魏學曾又是文官，根本不懂帶兵打仗，只會學紙上談兵，明朝文官把持朝政帶來的禍患從寧夏之役可見一斑，主將無能，累死三軍。
一衆重臣都對魏學曾很失望，張位當即出聲道：“下官以爲前敵大將師老無功，當撤換三軍總督魏學曾，改以葉夢熊總統三軍作戰、蕭如薰總兵寧夏。”
石星深感贊同道：“下官附議”
戶部尚書楊俊民更是爲戶部接連不斷向陝西寧夏輸送大批糧餉輜重感到頭疼，當即贊同道：“下官附議”
趙志皋當即道：“那就依洪陽提議，準備票擬遞上去吧。”
“是”張位忙領命準備票擬交由當值太監呈遞上去。
乾清宮御書房中，朱翊鈞看着文淵閣當值太監呈遞上來的內閣閣臣票擬，見閣臣提議臨陣換將，朱翊鈞早已對四鎮魏學曾總統三軍進討寧夏叛軍遲遲不能攻下寧夏鎮城甚是不滿，當即吩咐道：“批紅吧”
“是”陳矩忙接過奏疏批紅
朱翊鈞對遼東兵兵敗平壤一事甚是關注，拿着內閣票擬看完嘆道：“想不到朝鮮倭寇猖獗如斯！遼東兵糧草不繼，軍情不實，火器失靈，倭寇甚是狡猾啊！”
朱翊鈞對遼東巡撫郝傑與遼東總兵楊紹勳聯名上奏奏書中提到有朝鮮兵附倭射殺遼東官兵一事怒道：“豈有此理，張誠，速命東廠錦衣衛查探清楚朝鮮兵附倭襲擊遼東官兵之事。”
“是，奴婢這就去辦。”張誠忙領命告退出乾清宮趕回東廠下令東廠番子錦衣衛查探平壤兵敗，朝鮮兵附倭襲擊遼東官兵一事。
朱翊鈞隨即看向一旁的陳矩吩咐道：“將上次福建巡撫張汝濟上奏奏書給朕找出來”
“是”陳矩忙帶着兩名親信太監去取奏書
朱翊鈞看着陳矩找來的福建巡撫張汝濟上奏奏書中言及浮海徵倭大軍糧草難以渡海運送，已交由臺海遊擊將軍府東洋商行海船運送糧草輜重前往東瀛爲徵倭大軍補給。
“東洋商行一力承擔徵倭大軍糧草輜重運送，徵倭大軍糧草輜重豈不是握在陳瀚手中。”朱翊鈞甚是不滿道：“愚不可及，糧草輜重如此重要竟然交給陳瀚，且不是將徵倭大軍都交給陳瀚了。”
拿人手短，吃人嘴軟，陳矩忙出聲勸道：“萬歲爺息怒，朝廷還需要陳瀚牽制侵朝倭寇，何況陳瀚還算忠勇可嘉。”
“哼，眼下他是忠勇可嘉。”朱翊鈞冷哼一聲道：“等他攻滅倭國羽翼豐滿之時，還會忠於朕嗎？”
陳矩嚇得匍匐在地小心翼翼回道：“閣臣在票擬中說豐臣秀吉有不下三十萬大軍，陳瀚纔不過六萬大軍，如何是豐臣秀吉對手。”
朱翊鈞對陳瀚兵力雄厚深感頭疼，又擔心徵倭大軍兵敗，最好是陳瀚與豐臣秀吉兩敗俱傷，但陳瀚水師火器厲害，朝廷都讓工部尚書曾同亨派人購買了一批陳瀚軍中所用佛朗機炮，工部尚書曾同亨奏報威力比之國朝佛朗機炮更兇猛。
大明朝廷以寧夏平叛大軍三軍總督魏學曾師老無功，下令撤換三軍總督魏學曾，改以葉夢熊總統三琿，蕭如薰總兵寧夏。
調李如鬆爲提督陝西討逆軍務總兵官，統一指揮新增派的山西、遼東、浙江兵和南方苗兵，配合督撫各軍通力合圍寧鎮。