新的第二艦隊將會分爲三個支隊，一支隊駐紮在福州，二支隊駐紮在臺灣城，三支隊暫時駐紮在澎湖。尐說網5203187等到將來將西班牙人攆走之後，駐紮在澎湖的第三支隊將會換防到雞籠港。
李峰給鄭芝龍近段時間的任務，就是訓練隊伍，掃蕩福建廣東一帶的海盜，保障遠洋商行船隊的安全。這點其實不用李峰特別交代，鄭成功在那些船隊裡，可是有股份的，他自然是十分上心。
另外，海軍還有一個任務，就是打擊走私。凡是在臺灣、福州海關繳納了稅收的船隻，將會發給大明的日月龍旗，若是沒有交稅的，對不起，海軍請你們喝茶去。不過喝那個茶的代價有些高，船上的貨物會被收繳，待到補足了罰金之後，方可放行。
現在大明的關稅乃是按船來算，從一千兩銀子到三千兩銀子不等，根據船的大小來定。雖然稅收的很高，但是海上貿易的利潤十分巨大，跑一趟下來，那就是十倍的利潤，所以那些商賈們是乖乖地交銀子去。而且現在領了旗子，打上船號之後，有一個好處，那就是海軍的艦隊絕對不會進行刁難，被海盜騷擾，只要給海軍一報，海軍將會去剿滅海盜。
若是有人想要抗稅，在海上想跑，門都沒有，那海軍的鐵甲船跑得比帆船快多了。
鄭芝龍這個人，當海盜在海上縱橫，當起官兵來，也毫不含糊。劉香和他原先是拜把子的兄弟，但是卻不願意投降，鄭芝龍這個時候收拾起兄弟來，絕不手軟，帶着親自帶着第一第二支隊，三艘蒸汽船，一百多艘戰艦，海軍陸戰隊兩千來人，直奔劉香的老巢，只用了兩天的時間，就將劉香的老巢翻了個底朝天，繳獲了價值一百多萬兩的財物，大小船隻二百多艘。
劉香駕船想要逃跑，結果被鄭芝龍駕着蒸汽輪船輕而易舉地追上，直接就在海上將那條帆船打成了碎片。
其餘的幾個海盜一聽此訊息，迅速地遁入南洋，不知道到哪裡的小島上安身去了。至此，福建、廣東一帶，海事基本清淨了。
三月二十五，李峰率領四艘蒸汽戰艦，福船十二艘，海軍陸戰隊隊士兵五百名，直撲雞籠港。
雞籠，也就是後世的基隆，因爲最早居住在此地的爲凱達格蘭族，格蘭的諧音近似臺語之“雞籠”，加上此地有山形似雞籠，因而得名。
天啓六年，也就是1626年，西班牙遠征隊在社寮島（後世基隆的和平島）登陸，隨即在島上西南端修築“聖薩爾瓦多城”。
三月二十八，艦隊來到了基隆港的外面。
西班牙人的主力艦隊都不在，只有十餘艘小船和五百人守在所謂的聖薩爾瓦多城。見到明軍的艦隊前來，這些西班牙人連忙派了小船前來交涉。
李峰的態度很明確，通商是可以的，但是一定要退出臺灣，並且以後的交易需要向大明繳納稅收。
西班牙人的頭領伐爾得斯當即就拒絕了，並且聲明這裡是西班牙國王的領土。
既然西班牙人這麼願意談判，那就讓大炮發言吧。
李峰一聲令下，八門艦炮和四十門野戰炮就直接轟到了那個聖薩爾瓦多城上。一口氣來了十輪齊射之後，陸戰隊的士兵們就開始登陸向那聖薩爾瓦多城進攻。到了城下，士兵們毫不客氣，架起二十門迫擊炮對這城裡頭又是一陣炮擊，往城裡打了一百多發炮彈，直到沒有抵抗了，這纔上去用了二十多公斤的炸藥包炸開了城堡的大門。
等到他們衝進這個城一看，哪裡還需要進攻，那個聖薩爾瓦多城已經變成一片廢墟了，活着的西班牙人沒有幾個了。即使是活着的士兵，也早都失去了戰鬥的勇氣。
很快，士兵們便押解着二十多個嚇傻了的西班牙人走了出來，至於那些重傷的，已經沒有搶救的價值了。
西班牙人的長官伐爾得斯已經在炮擊中被炸死了。將這些西班牙人帶走之後，皇家海軍第二艦隊的第三支隊便駐紮在了這裡。至於新的堡壘建設，就交給建築商行。今後這裡將會建成一座菱堡，扼守住水道的入口。同時，在山上將會構築炮臺，可以居高臨下地對下面海邊的艦船進行俯視攻擊。
解決了雞籠港的西班牙人，李峰便帶着艦隊往臺灣城方向而去。在經過了淡水城的時候，放了一個西班牙俘虜上到淡水城去，叫淡水城的二百西班牙士兵投降。
淡水城與其說是一個城，不如說是一個大院子，現在更是沒有什麼防禦力。那些西班牙士兵一聽說明軍火炮犀利，伐爾得斯都死了，於是便都投降了。
回到了臺灣城，李峰便吩咐鄭芝龍加強戒備，算了算，那荷蘭也該打來了。
事實上，荷蘭駐印尼的總督簡·皮特斯佐恩·科恩也確實是在韋斯回去之後便得到了消息，但是他卻沒有馬上前來大明進行報復。這倒不是他相信了韋斯說的明軍的海軍艦船很厲害，而是現在他的艦隊正在印度洋上，還沒有回來。不過，這位科恩總督還是給李峰送來了一封措辭強硬的抗議信，要求大明退出臺灣城，並且賠償荷蘭東印度公司的損失五十萬兩白銀。
李峰直接就將那信件扔到了垃圾桶，然後派人到福州給天津水師那邊發報，將最新下水的五艘戰艦中的四艘，立即送到臺灣城來。
十天後，這三艘蒸汽戰艦便到了臺灣城，編入了大明皇家海軍第二艦隊。這三艘戰艦分別被命名爲福州號、臺灣號、南昌號和杭州號。
有了這些蒸汽戰艦，鄭芝龍是笑逐顏開，說是保證會將那些紅毛番子打得滿地找牙。
李峰相信這鄭芝龍有這個能力，不過還是告訴他一定要小心，防止大意。
隨後，李峰再次對第二艦隊進行了整編。將第二艦隊和第一艦隊進行混編之後的人員抽調了一半，隨同自己北返。李峰只帶走了艘天津號蒸汽戰艦，和原來山東水師、第一艦隊的福船。
四月中旬，李峰終於是返回了天津港，隨船一起前來的，還有山東水師的六千官兵。他們到了這裡之後，將會接受第一艦隊的培訓。等到新的戰艦下水之後，便會接受第一艦隊的整編，合編成皇家海軍艦隊的第一艦隊。
到了天津之後，李秉如被任命爲第一艦隊的司令，原登州水師的副總兵沈壽崇被任命爲爲副司令，王謙擔任參謀長。
至於李峰，他的這個司令之職已經結束，回京城去找皇帝覆命去了。
臨走之前，李峰去了一趟天津造船廠，他對劉安撫講了大明皇家海軍的作戰過程，對劉安撫大大地恭維和感謝了一番。
如今，造船廠的十幾個船塢之上，鐵甲艦還在不停地建造之中。因爲採用了規範化作業，有采用了蒸汽機作爲動力，因此建造的速度都十分快。用劉安撫的話說，只要木材夠，他每個月都能保證有兩到三艘戰艦下水。
李峰忽然笑了笑，對劉安撫說道：“劉大人，有沒有想過，如果不用木材，全部用鋼板如何來建照船呢？”
劉安撫一愣，說道：“全部用鋼板，怎麼可能，那全是鋼鐵又怎麼能夠浮在水面上？”
李峰一看這劉安撫到現在還是個外行，便不再和他說，只是叫他將那些技術骨幹叫道一起來開會。
李峰看着這些骨幹，有許多就是皇家學院的學生，也有一些是工匠出身。
他給大家講道：“告訴大家一個好消息，你們造出來的蒸汽鐵甲船，在和荷蘭人的戰鬥中，大獲全勝，將敵人打得丟盔棄甲。所以，回到京城後，我會向皇上爲你們請功！”
頓時，這些工匠都歡呼起來。
“但是，這種鐵甲蒸汽船，就是你們的目標嗎？不該是！這種鐵甲戰艦，是在福船的基礎上改建而成的。這種船體是不是最好的？是不是阻力最小的？是不是海軍最需要的？你們要多想，多問，而且要大膽想，大膽試，大膽創新！我們造船廠的目標是什麼？我總結一下，送給你們，那就是要更快、更大、更堅固、更安全。除此之外，你們還要逐漸開發一些能夠一次裝幾千噸的蒸汽的運輸船，能夠供人們出門遠行的客輪。這些，都要你們來實現。當然，這不是能夠一蹴而就的，需要你們去摸索！”
“你們中，有些是經驗豐富的工匠師父，有些是經過皇家學院學習過的學生，你們要相互學習。學生出身的要向工匠師父們學習經驗，工人師父們也要向學生們學習先進的科學知識。學生們呢，也要將你們在學院裡的知識充分地運用道艦船的建造之中來。比如說，要想讓設計出來的艦船跑的快，很重要的一個方面，就是阻力要小一些。那麼你們就可以設計出模型，在流動的水中，用彈簧秤來測定阻力嘛！還有，我剛纔和劉大人提到全部用鋼板來建造船體的問題，這就需要你們想辦法，用什麼東西能夠將兩塊鋼板融化後接在一起。這些都需要你們去開動腦筋，運用智慧去解決問題！”李峰一席話，頓時叫那些學生們茅舍頓開。此會之後，學生和工匠們掀起了技術攻關的狂潮。李峰將這些學生們鼓動起來之後，自己便一拍屁股，回京城去了。他給這些學生們的金手指已經這麼明顯了，若是還不開竅，那就真是豬腦袋了。。