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東京，往日一座繁榮的城市，即便是夜晚也是燈火輝煌，然而如今這兒已經變成了一個煉獄。
因爲原子恐龍噴吐高強度輻射的原子吐息的關係，使得這裡現在到處充滿核輻射，相信幾年之內是不能住人了。
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儘管此時哥斯拉三號帶着小哥斯拉離開了，但剩下的哥斯拉二號和彩色的魔斯拉，就在人類的關注下，展開了最終之戰。
大怪鳥拉頓被房屋瓦礫掩埋，生死未卜；
墨綠色的飛蛾巴特拉安靜的躺着，他的左臉流出大量綠色黏液，四隻翅膀只剩下三隻完好，一隻破了個大洞，背上也是一片焦黑。
廢墟之中，還有一堆廢鐵，沒人能想象到，這之前是一尊威武的機械恐龍。
能夠釋放熱線的巨大恐龍，那如熊一般的身軀矗立在水泥大地之上、鋼鐵叢林之間。
參戰的另一方，彩色飛蛾魔斯拉，浮在空中，看起來很龐大的身軀開始高頻率地震動，居然讓人產生了那裡有三隻魔斯拉的錯覺！
不！
那裡確實有三隻魔斯拉！
分身！
剛意識到這一點，兩隻斑斕的魔斯拉分身就已經來到了哥斯拉身側，繞着他，以超音速飛行，在其周身形成了一場龍捲風。
呼呼——！
哥斯拉沒有動，他以不變應萬變，高貴的金瞳好像在睥睨天下。
兩個魔斯拉在自己造成暴風中漸漸退去顏色，變成兩個白色絲線所組成的超大毛絨玩具，並且在暴風中分解爲絲線，一點一點地纏繞在哥斯拉身上。
哥斯拉當即噴出藍色火焰，可惜對白絲的效果微乎其微。
很快，殘破的鋼鐵水泥之森裡，一隻百米巨獸，變成了一個繭，魔斯拉從後面一推，輕鬆地把高達百米的巨繭推倒在地。
魔斯拉見此，得意地說道：“哼！叫你多管閒事，現在後悔也來不及了，我要把你封印起來。”
“呵呵，我正愁沒有一個安靜的地方睡覺~”
“死到臨頭還嘴硬，”冷哼一聲，魔斯拉不再使用能量傳聲與哥斯拉對話，轉而飛行巴特拉的屍體。
人類以爲魔斯拉要爲自己的同族哀悼，然而並不是這樣，一個真正的奇蹟即將展現在人類眼中——
只見金色的光芒從魔斯拉身上灑落在墨綠色飛蛾的屍體上，使後者那已經暗淡無光的一雙複眼恢復了一些神彩，死氣沉沉的“屍體”也恢復了一絲生機。
“巴特拉啊，再助我一臂之力吧！”
隨着魔斯拉的呼喚，在人類震驚的目光中，已經被認定死亡的巴特拉，再次震動殘破的翅膀，飛到空中。
死而復生！
這一詞出現在所有看到這一幕的人類腦海裡，這不是魔術師的障眼法，而是逆轉了現實，真正的起死回生！
這時人們纔想起來，魔斯拉號稱地球守護神，“神”之名實至名歸！
沒有理會人類的驚訝，魔斯拉與復活的巴特拉一起，將九萬噸哥斯拉巨繭擡了起來，並且朝着東方太平洋的方向飛去。
很快，天邊泛起了一絲白光，在新的一天第一縷陽光的映襯下，魔斯拉和巴特拉把哥斯拉巨繭擡到了馬裡亞納海溝上空，兩者同時鬆手，將哥斯拉巨繭扔了下去。
隨後，魔斯拉迅速在上空畫了個圓，金色的粉末灑在海面上，形成了一個魔斯拉圖騰——這是魔斯拉的封印術。
“巴特拉……”將哥斯拉封印了，可對於巴特拉，魔斯拉卻心懷愧疚。
她許諾過，要把巴特拉變回幼蟲，但以巴特拉現在的傷勢，變成幼蟲等同於直接殺死他。
巴特拉也知道自己的情況，但他沒有說話，只是淡然地看着東邊緩緩升起的一輪紅日，那抹紅光與他的紅色複眼十分相稱。
巴特拉還是巴特拉，翅膀上的閃電圖案並沒有改變，但給人的感覺似乎沒那麼可怕了。
太陽漸漸升起，墨綠色飛蛾眼中的紅光，隨着天邊變白，也漸漸消散了，飛蛾巨大的身體朝着波瀾起伏的海面落下去。
突然間，一團金色能量再次將隕落的飛蛾包起來，飛蛾的翅膀、外骨骼在金色能量裡漸漸破碎、消失，露出核心的一團紅色能量。
接着，在金色能量的作用下，那一團紅色能量漸漸化爲一顆巨蛋。
嘭！
巨蛋落入大海，隨着暗流不知飄到何處……
“我能做的，只有這些了，巴特拉。”魔斯拉低喃一句，便朝着來的方向回去，“希望我再回地球的時候，你已經復活了。”
……
魔斯拉回到了東京外圍的某個飛機場，東京中心地區變成了煉獄，外圍卻還完好，她來這裡，是爲了接她的兩個Cos|mos。
“艾梅拉，你不和我們一起去嗎？”小美人莉恩向艾梅拉露出一對水汪汪的大眼睛，似乎希望後者會被這雙眼睛打動。
“別那樣子看着我，真噁心。”然而艾梅拉不爲所動？把視線落在另一個小美人瑪娜身上。
“誒！！！哪裡噁心了！！！”
而瑪娜看着自己的手指甲，隨口說道：“愛去哪去哪去，我是不會挽留的。”
“哼，誰要你挽留？”艾梅拉輕哼一聲，轉過身去，“我要去找巴特拉大人！”
說完，也不等其他人說些什麼，就自顧自地開啓精靈之翼飛走了。
“誒？艾梅拉，等……”
莉恩還想說些什麼，卻被瑪娜攔了下來，“這種離別也挺好的，至少不會太悲傷。”
嘴上這麼說，但她的眼睛深處，也隱藏着一抹不捨。
“你們要去什麼地方？”藤原拓也一家子發問道。
順便一提，爲了感謝魔斯拉援助人類，能到此處表示感謝的人都來了，各個國家的人都有，因爲這次巨獸之戰，大量各國人才匯聚在這裡。
魔斯拉靜靜地看着這一幕——曾經地球智慧種族Cos|mos與現在地球智慧種族人類短暫的交流，待兩個小美人發出交涉完畢的信號，魔斯拉用念力讓兩個小美人飛到自己腦袋上。
【咦？那個人類女子……】
魔斯拉再度飛上高空，這時她注意到一個人類女子——三枝未希，這個女子身上隱藏着魔斯拉的力量。
【她可以成爲我的使者。】
這個念頭進入魔斯拉腦海，她卻沒有做出什麼表示，沒有絲毫停頓地朝着天空飛去，她用自身能量保護兩個小美人，然後開始加速。
從最初的2馬赫加速，幾分鐘之後，魔斯拉達到了第二宇宙速度，脫離了地球引力的影響，衝出大氣層，進入了宇宙空間。
“魔斯拉已經離開地球了。”
“魔斯拉仍然在加速！”
“魔斯拉的速度開始接近光速，我們無法繼續觀察！”
三個信息，迅速在地球各種組織間散開。
對此，人們不由的發出感嘆：“亞光速，不知人類何時才能達到這種速度……”