得知發生在湖廣後方的驚天劇變，南京前線的明軍立刻陷入了巨大的騷動之中。
因爲這場如火如荼的東征之戰，把南京變成了一個空前殘酷的絞肉機，凡是稍微能打一點的軍隊，都被抽調到了南京前線，整個湖廣後方幾乎是完全不設防的。所以，當數十萬流寇大舉殺進湖廣的時候，當真是一路勢如破竹李自成奪了襄陽，張獻忠輕取漢口、漢陽，還有一堆諸如羅汝才、滿天星、老回回之類的雜牌賊寇，也爭相涌入湖廣行省，攻州破縣，大肆燒殺劫掠。
幾乎是眨眼之間，半個湖廣就基本淪陷了，剩下的半個湖廣看起來也是搖搖欲墜（當時還沒有湖南湖北的劃分，只有一個完整的湖廣行省）。原本留守武昌的內閣首輔溫體仁，面對如潮水般洶涌而來的數十萬流寇，雖然已經嚇得魂都快掉了，但也只得硬着頭皮組織防禦很顯然，襄陽那邊已經是鞭長莫及了，甚至連江北的漢陽和漢口也守不住了，但他還是企圖依託長江天險，至少要保住長江南岸的武昌城。
然而，此時的武昌城內兵力極度空虛，溫體仁派遣衙役臨時抓到的壯丁，尚未來得及整編上陣，就已經一鬨而散，湖廣的地方官吏也不怎麼服從溫體仁的調遣，不是陽奉陰違、敷衍了事，就是紛紛棄職潛逃，甚至還有小吏私通流寇，刺殺官員，弄得武昌全城人心惶惶，而駐蹕於此的流亡朝廷更是幾乎癱瘓。
另一邊，張獻忠也沒有愚蠢到直接強渡武昌江面，而是在稍遠處的上游江段，找了個偏僻渡口過江，然後大張旗鼓，沿着南岸一路朝着武昌殺過來！得知此事之後，武昌城內頓時一片大亂，市民官紳都忙着打點行李出奔，內閣的命令也根本沒人聽了。溫體仁的手頭只抓到了一千多兵馬，自認爲根本守不住武昌這樣規模的大城市，因爲連圍着城牆站一圈都遠遠不夠。因此，他只得放棄了武昌城，護送着皇后、太子和一干宮眷上船出逃，而留在後方的將士家屬也紛紛找船跟隨，一路亂哄哄地逃到了九江府才停下。
至此，湖廣全省等於是基本失陷了。這個噩耗傳到南京前線的明軍大營，頓時就引發了一場騷亂崇禎皇帝和盧象升不是沒想過要封鎖消息，但是鑑於明朝軍政部門極端可悲的保密能力，等到他們收到這事兒的時候，全軍至少已經有四分之一的人從各種渠道打聽到了消息！接下來自然是火速傳播得人盡皆知！
結果，南京前線的九萬明軍，當即就是一片軍心大亂，甚至有人覺得風色不對，就偷偷離隊逃散的。
無奈之下，崇禎皇帝只得下令召開軍議，討論下一步的出路。會上衆人自然是衆說紛紜，有人建議立刻放棄南京，火速回師湖廣平賊。但同樣有人堅持要再加一把勁，先拿下南京這座極具政治意義的城市再說。甚至還有人表示，哪怕丟光了整個湖廣，只要得到江南作爲交換，也還是值得的。
而崇禎皇帝本人也是舉棋不定。畢竟，爲了奪取南京，他已經押上了太多的賭本。在過去的半年裡，他之前從北京皇宮裡帶出來的銀兩珍寶，還有查抄洛陽福王府的全部收穫，都已經爲了發動這場東征而揮霍一空。而眼下他也已經奪取了大半個南京城，如果就這樣功虧一簣的話，天曉得還有沒有機會再來一次。
作爲一名穿越者，他很清楚這些陝西流寇是何等的難纏，絕不是什麼可以迅速解決的麻煩。
更何況，江南這片地方確實是非常的富庶，一切軍糧軍餉都可以就地搜刮。自從大軍攻入南直隸以來，就完全依靠繳獲的物資在作戰，甚至連火藥都能在南京附近籌措到，即使沒有了後勤補給也無所謂。
但問題是，在後方不穩，軍心已經動搖的情況下，他還能打得過皇太極這位“明君雄主”嗎？
與此同時，另一位同樣紅了眼的賭徒皇太極同志，也在佈置着屬於他的最終決戰。
過去這些日子的南京爭奪戰之中，由於地形、氣候、民心皆處於劣勢，清軍在南京巷戰和郊野拉鋸戰之中的損失相當慘重。皇太極最初帶着渡江南下的八千鐵騎，到現在已經被打得只剩下不足千人。
除了在南京戰場這個絞肉機裡的消耗之外，就連運載部隊渡江南下本身，也是一件非常危險的事情。崇禎皇帝的水軍雖然實力有限，但依然頑強地航向長江下游，時不時地偷襲運載清軍渡江的船隊。
而自從南京的永和帝朝廷瓦解以來，被東林黨控制的原南京朝廷長江水師，也不斷地有人譁變倒戈，導致先後有三千多名不識水性的滿洲大兵，隨着沉船墜入大江餵了魚鱉。
在此時的燕子磯大營裡，皇太極的旗下還有一萬一千滿洲八旗兵，一萬八千各色雜牌漢軍，外加寥寥數百名蒙古人和百餘名朝鮮火槍手。整個大清帝國剩下的全部家底兒，幾乎都在這裡了。
至於原來那個南京朝廷的兵馬，在此時已經徹底瓦解，對皇太極而言完全派不上半點用場。
南京爭奪戰打到了現在這一步，皇太極已經沒有了任何退路，如果失敗的話，就只有死路一條了。
雖然如今在淮北的徐州、濟寧一帶，還佈置有多爾袞、多鐸、阿濟格三兄弟的兩白旗，超過六十個牛錄的滿洲勇士，但皇太極很清楚，自己就算是英勇地戰死在南京，也比回去看這三兄弟的臉色要強得多！
事實上，雖然皇太極被譽爲大清的一代明君雄主，但至始至終，他的君主地位都非常尷尬。
要知道，努爾哈赤在臨死的時候，原本是想要讓多爾袞繼承汗位的，甚至把自己的嫡系部隊都給了他。所以，多爾袞三兄弟當時掌握着整個後金集團內部實力最強大的兩黃旗，而皇太極麾下的兩白旗卻是最弱的。然而，皇太極成功地團結了其餘四個旗的掌權貴族，一齊打壓當時還是小孩子的多爾袞三兄弟，終於逼死了多爾袞三兄弟的母妃阿巴亥，奪取了後金大汗的寶座。
因此，在成功繼位之後，多爾袞就成了皇太極的第一個打擊對象。隨着皇太極一紙令下，曾經是努爾哈赤直屬禁衛軍的兩黃旗，連番號都保不住，直接改成兩白旗，皇太極自己的兩白旗則變成了至高無上的“兩黃旗”。互相換旗之後，接下來不用說，在六個旗的進一步聯手打壓之下，多爾袞三兄弟麾下的各個牛錄被不斷調走、削弱，成爲了第一個被皇太極收拾乾淨的政治集團。 ，
可是，爲什麼皇太極沒有繼續置多爾袞於死地，反而又漸漸將他和多鐸、阿濟格給提拔了起來呢？
因爲，無論在軍事鬥爭還是政治鬥爭之中，敵人和盟友的角色都是在不斷變換的。在擊敗了年幼力弱的多爾袞三兄弟，坐穩了後金大汗寶座之後，皇太極的主要政治對手，就不再是這三個已經失去了威脅的幼弟，而是幫助他奪取汗位的阿敏、莽古爾泰、代善這三個大貝勒了。要知道，在當時的後金內部各大勢力裡面，皇太極的嫡系是最弱的，除了擁有一個大汗的名分之外，阿敏、莽古爾泰、代善麾下的實力都比他要強，或者至少是相差無幾。爲了對付阿敏、莽古爾泰和代善，缺乏嫡系實力的皇太極，又不得不把年齡漸長的多爾袞三兄弟給擡舉了起來，讓這兩白旗的三兄弟打頭陣，通過各種手段對付三個大貝勒。
結果，就像蹺蹺板一樣，在皇太極把三個大貝勒給相繼打倒之後，兩白旗的勢力卻急速地膨脹了起來。比如阿濟格在眼下就已經成了大清帝國的第一勇將，在八旗軍中威望卓著。多爾袞則智勇兼備，十七歲的時候就因戰功卓著被封爲聰明王。就連多鐸也在入關之後的戰事之中屢建奇功。兩白旗更是積累了大量的丁口和財富。更糟糕的是，雖然皇太極之前百般設計挑撥離間，但始終沒能破壞這三兄弟的團結一致。
原本，以皇太極的雄才大略，接下來肯定還有一系列壓制兩白旗的手段。而他也確實早已預備了伏筆在多爾袞三兄弟給皇太極充當走狗，撕咬阿敏、莽古爾泰和代善三大貝勒的過程之中，兩白旗不可避免地與兩紅旗、兩藍旗結下了深仇大恨，日後完全可以再一次借力打力，重新聯合六旗把兩白旗打壓下來。
誰知就在這個節骨眼上，大清帝國卻莫名其妙地遭到了毀滅性打擊，苦心經營了多年的遼東故地瞬間易主，盤踞河北的關寧軍豎起叛旗分道揚鑣，滿洲八旗回家的道路從此斷絕，大清旗下的漢軍和蒙古盟軍也相繼叛變……在這種土崩瓦解的惡劣局勢之下，焦頭爛額的皇太極根本就顧不上再對付自己人了。
再接下來，還沒等大清帝國從連番挫敗之中緩過一口氣，皇太極就突然得知江南局勢有變，又有張溥代表東林黨和復社，秘密渡江來向清軍求援。於是，皇太極唯恐錯過這一難得的戰略機遇，幾乎是馬不停蹄地就往揚州趕了過去，同時傳令全軍盡數南下，不惜一切代價也要把天底下最富饒的江南給搶到手！
注意，在這時候，皇太極的計劃是盡發傾國之兵南下，把整個滿洲八旗全都投入到江南戰場上！