崇禎二十七年六月，遼東復叛的消息傳回京師，正在仁壽宮讀書的朱由檢聽說後勃然大怒，將手中經卷扔在地上，怒道：
“吳三桂！豎子安敢如此？！”
崇禎皇帝對投降遼軍頗爲信任，尤其對吳三桂這個三姓家奴，可以說是格外開恩。
“真以爲朕現在不吃人肉了嗎！讓平南王一定生擒此人，押會京師，朕要拿他做包子吃！”
這次光復遼東，朱由檢本着少殺、慎殺的原則，對遼東漢民格外開恩，哪怕之前做過建奴包衣，也在皇帝赦免之列，除了那些窮兇極惡爲虎作倀之人，如曹璽、佟普漢、範承謨，範承勳，其他人都可以既往不咎網開一面。
沒想吳三桂竟然敢重新背叛朝廷，這也怪朱由檢自信過頭，忽略了這位三姓家奴見風使舵的本性。
只是眼下建奴覆滅，江南平定在即，不知道吳三桂是不是腦子抽了，竟在這時叛亂。
王承恩等人不敢說話，也不敢上前去撿地上的書卷，皇上已經很久沒有這樣動怒了。
“他要耕牛，朕就給他耕牛，他要糧食，朕就給他糧食，沒想到他最後竟然反了！”
皇上劇烈咳嗽幾聲，從嘴裡吐出血來，王承恩連忙上前，扶住崇禎，正要開口叫太醫，被朱由檢攔住。
老朱家基因從朱棣開始，就變得孱弱多病，從朱棣開始，後面的朱家皇帝基本上都是短命而死。
雖然是穿越者附體，然而也逃不出基因的命運，在找到不死火山妖僧長生不老的秘密之前，朱由檢估計自己大概只能活到五十歲，或者不到。
建奴覆滅後，是時候該重新評估一下自己的遼東政策了，至少應該改招撫之策，由招撫改爲暴力。
崇禎皇帝反思了很久，終於意識到一個嚴峻問題。
在他固有的認識中，遼東漢人與關內各省漢人並無差異，所以也對他們一視同仁。
然而事情發展證明，並不是朱由檢想象的那樣的。
朱由檢撿起地上的經卷，轉身對王承恩道：
“召集大學士進宮，還有內閣首輔，倪元璐也過來，朕要和他們談談遼東歷史！”
一個時辰後，皇極殿，崇禎皇帝仔細梳理遼東地域的發展脈絡。
張國維倪元璐等人行禮完畢，崇禎充滿和氣道：
“幾位愛卿，匆忙召集你們過來，是要想聊聊遼東往事，幾位都是博古知今，張尚書還在遼東待過，關於遼東，相信諸位都比朕有更多看法，今日暢所欲言，不必在意！”
幾位大臣相互看了眼，一時之間不知道皇上要讓他們說什麼，然而吳三桂在遼東叛亂，屠殺當地官吏的消息，大家都已經知道了，這幾天京師人心惶惶，十年不經戰事，大家都有些忐忑不安。
“就從元末開始說起，朕想聽聽遼東過去的事，”
朱由檢淡淡一笑，心平氣和道。
遼東正式歸於大明，是在明洪武初年，然而朝廷對此經營一直頗爲鬆散，此地處於苦寒之地，冬季漫長寒冷，而且遠離南京政治中心，在明初，朝廷對此以招撫爲主。
張國維上前一步，大聲道：“元末，遼東劉益、高家奴、洪保保等人興起，佔據復縣、遼陽、平章劉益，平頂山等地，劉益死後，太祖派吳立，張良佐和房暠爲遼東衛指揮僉事，並在同年派大將馬雲和葉旺進駐遼東，以馬雲和葉旺二人爲定遼都衛指揮使，於洪武八年改定遼都衛指揮使司爲遼東都指揮使司。”
倪元璐接過話頭，繼續道：”蒙古人逃亡大漠後，仍不死心，元將納哈出時刻窺伺入侵我大明，太祖將北部邊疆穩固之後，於洪武二十年，派出徵虜大將軍馮勝率二十萬兵馬討伐納哈出，納哈出不敵投降，由此，遼東全境收復。爲防止遼東蒙古與和女真部聯合作亂，洪武二十八年，太祖再次派出都指揮使周興出開元，討伐和北元殘餘勢力鄰近並且關係比較密切的呼蘭河流域的女真酋長酉陽哈。”
三路大軍進發追擊酉陽哈到了今天的松花江流域的伏塔米古城，雖然最終被酉陽哈逃脫，但是大軍威行萬里，震懾了當地不少部落，於是遠近的女真部落紛紛來投。
洪武二十九年，成祖再次領兵進軍遼東打擊殘元勢力，追至兀良哈禿城，擊敗哈剌兀而返。率諸軍北至徹徹兒山，遇胡兵，與戰，擒其首將孛林帖木兒等數十人，追至兀良哈禿城，遇哈剌兀，復與戰，敗之，遂旋師。
太祖步步爲營的策劃之下，歷次遠征征服了多個女真部落，整個遼東直至外東北，庫頁島等地區紛紛降服，。
洪武年間雖然對黑龍江下游女真各部進行了招撫，但是由於元朝殘餘勢力還沒有清除，交通和驛站沒有建立起來，所以此時明朝影響力還遠沒有擴大到這些地方，並且想要深入女真部落設衛招撫也沒有實現。比如洪武二十一年，三萬衛指揮僉事侯史家奴帶領二千兵馬到斡朵裡設衛，但是因爲交通驛站系統沒有建立，糧草不濟，最終回撤。
指揮僉事侯史家奴領步騎二千，抵斡朵裡立衛，以糧餉難繼，奏請退師，還至開原。
到了永樂年間，隨着殘元勢力徹底覆滅，以及明朝在東北逐步建立起完善的驛站交通系統，才使得招募女真部落的工作取得了重大進展，在黑龍江，松花江及烏蘇里江流域先後建立起了一百一十五個衛所，並前後多次派出亦失哈爲首的帶領軍隊巡視遼東並招撫女真各部，隨着衛所不斷增設，出現了建立更高一級的行政機關來統治當地的需求，於是在永樂七年，朱棣增設了奴兒干都司負責黑龍江流域的管轄。
奴兒干都司設置後，明朝仍然在遼東地區不斷增設衛所，擴大影響力，鞏固統治，至萬曆時期，遼東地區共計衛所三百八十四個，相比永樂時期翻了一倍之多。
亦失哈九次巡視遼東對於明朝穩固遼東統治是極其重要的一件事，亦失哈受明太宗及宣宗委派，曾經帶領大軍先後九次巡視遼東，永樂九年，明朝政府決定設置奴兒干都司之時，派亦失哈帶領康旺，王肇舟第一次出使遼東地區。