馮遷來到桓玄跟前，桓玄仰天不語，馮遷揮刀將玄殺掉。一代梟雄，就此斃命，終年36歲，做皇帝的時間還不到一年！馮遷後又將桓石康、桓浚、庾頤之盡皆殺掉。劉靈玉摟着桓昇在一旁哭泣。毛修之素來好色，看劉靈玉姿色出衆，上前說道“夫人，桓玄已死。你若願叢我，我可爲你向皇帝求情，將你留在我身邊。”“好。”毛修之大喜，進前數步。劉靈玉趁其不備，拔出匕首刺向他。毛修之躲閃不及，慌忙用手擋住，匕首穿透手掌。劉靈玉自桓玄敗後度其難以善終，因此一匕首不離身，以防受辱。這時知行刺不成，劉靈玉將刃抽出，抹頸自殺，就這樣香消玉殞了。
司馬德宗在江陵城重新做回了皇帝。毛修之一衆也將桓玄之首與桓昇帶來了。德宗大笑着說道“桓…玄…你…你…終於死了！”毛修之見桓昇幼小，父母都死，起了惻隱之心。向皇帝說道“陛下，賊玄已死。幼子只有五歲，可否饒其性命？”司馬德宗說道“不可，餘…餘孽…必須…斬…斬草除根！”可憐桓昇死在江陵。之後司馬德宗讓人將桓玄的頭傳送到建康劉裕處。劉裕見後悠悠的說道“當年你父親曾說‘大丈夫不能流芳百世，亦當遺臭萬年’你們父子倆，可算是都做到了！”將其頭顱懸於城門口示衆。
劉毅何無忌一衆崢嶸州之勝後，認爲大局已定，不着急追敵，桓玄死了十多天都未到江陵。再說崢嶸州桓玄敗後諸部逃散，桓謙逃到沮中，桓振藏於華容浦，而桓玄故將王稚徽一直在巴陵戍守。桓振騎射一流，勇力無雙，善使長戟。其所用戟爲槍加一橫枝，即矛與戈的綜合體。他知桓玄死訊後又惱又悲，尋思着重振桓氏雄風。由於桓振自幼爲人輕薄，好俠使氣，玄一直看不起這個侄子，不予重用。此時桓振恨恨地嘆道“若叔父早用我爲前鋒，豈會有今日之敗。”當王稚徽派人來送信說“劉毅諸將尚未過巴陵”之後，桓振心想機不容失，便與桓謙會和商量起兵。桓振言道“劉毅未到，江陵城剛剛歸晉，尚未安定，一定城守不嚴。我們趁虛火速拿下此城，此城乃桓家的根本之地，東山再起定有希望！”兩人收集餘兵，得三百多人。桓振大喜說道“足矣，由我來將，以一當十。”
五月下旬的一天，傍晚天降大雨。桓振大喜說道“天助我也！”於是桓振一衆冒雨，在夜裡潛行偷偷靠近江陵城牆。毛修之等人以爲劉毅大軍很快就會來到，是以未修守備，守軍也都懈怠。此時正值雨夜，守衛更是鬆散，多數去裡面躲雨，只留幾名衛士時不時提燈巡視一遭。桓振令幾名射手放箭將他們射倒，然後派數十名勇士用頂端帶有鐵爪的鋼索繩開始攀爬城牆。有一名守軍受傷未死匆忙去報信，爲數不多的城守開始往城牆趕來。這時勇士們已經接近城牆邊，在城下桓振等射箭掩護下登上城牆。當毛修之得知攻城之信後大驚，匆忙組織衆文武準備應戰。這時，桓振手下勇士們已經順利登上城牆，進至裡面將城門打開。
桓振一衆入城。桓振躍馬持戟大呼，衆軍士個個奮勇。此時又值電閃雷鳴，桓振挾勢進攻。兵刃交接聲，喊殺聲與雷鳴聲混合，城內很多人從夢中驚醒，慌忙起身披衣參戰。桓振果然驍勇難敵，持戟左右盤撥，一戟下去就殺傷數人。縱馬衝擊，無敢當其前者，連殺王康產、王騰之二將。城內倉促之軍士怎能抵擋，開始狼狽逃竄。毛修之正要前往迎戰，見兵士們紛紛退散，忽然一道閃電照亮了前方一將，正是桓振橫戟立馬。毛修之望之如天神降臨，心中大懼，不敢戰而逃，後來毛修之奔至建康，劉裕因他有殺玄功使其做了自己的諮議參軍。
桓振這時還不知道桓昇已死，只知被抓。他非常喜歡這個乖巧伶俐的小弟弟，因此着急知道桓昇下落，逢人就問。得知桓昇被殺後激憤填鷹，怒氣難遏，躍馬直入皇帝行宮。司馬德宗嚇得躲到桌子底下。桓振大喝道“狗皇帝給我滾出來！”司馬德宗慢慢爬出，癱坐一團，猶自戰慄不已。桓振拿戟指着德宗憤憤地說道“就你這德性，也配做皇帝？我們桓家有何負於國，至於盡遭屠滅？叔父本無殺你之心，這些時日虧待過你嗎？如今你連我們家的五歲幼子都不放過，今番看我不取你的狗命！”言畢便拿戟要刺德宗，卻被剛剛趕來的桓謙一把握住，說道“你先平息一下怒氣。如今桓玄已死，你若再把皇帝殺了，形勢將對我們更加不利。不如靠挾持他來收拾民心！”桓振心想有理，便抑制住怒氣下馬跪拜道“請陛下贖罪！”德宗仍然驚懼不已，直打哆嗦說道“愛卿…平…平身”。桓振與桓謙帶羣臣將玉璽奉於晉帝，言道“如今楚祚不終，百姓之心復歸於晉！”之後將晉帝的左右侍御之人全部換爲桓振腹心。
毛璩得知江陵城被桓氏所佔後，決定出兵攻取漢中來孤立桓氏。同時，派柳約之與羅述由白帝城東下，視劉毅之軍的前進情況相機進取。再說桓振得江陵後，肆情酒色，任意誅殺。這日傍晚，正一人獨酌，聽歌妓唱曲。桓謙來到。桓振起身說道“呦，叔父來了。你們先退下，換上管絃樂隊。”桓謙道“不必了，有事相商。”桓振“哪有那麼急啊。聽聞叔父喜歡絲竹，我們一邊耳入清音，一邊談論不遲！”桓謙道“賢侄好像更愛唱曲!”桓振說道“的確。古人云絲不如竹，竹不如肉！”桓謙問“此是爲何？”桓振道“以其漸近故也。絲爲撥弄琴絃發聲，距人最遠。管爲人之氣息衝撞管壁發聲，距人較近。而肉乃是人體喉嚨直接發聲，最能表達情感，因此聲音也最動人！”桓謙道“賢侄所言有理，只是如今我軍之中多對你有怨言，怕晉軍兵臨城下時，軍士不用命，佳音恐難再得！”桓振雖不喜桓謙之言，但之後暴行有所收斂。